自民党一向以来都派阀林立。现在有九个派阀，各派势力由大到小为：清和政策研究会（森派），会长为森喜朗。它是偏向政革的派阀，首相小泉纯一郎也属于这派。2005年，它取代旧桥本派在众议院拥有最大势力，虽然它不大能联合参众两院的势力。它在众议院占53席，参议院占26席。 平成研究会（津岛派），会长为津岛雄二，前身为竹下登的“经世会”。现在于参议院由青木干雄领导。它是最官僚和保守的派阀。前首相桥本龙太郎和整个派阀最近受丑闻打击，涉嫌收受日本牙医协会金钱。桥本辞去会长职务。它在众议院占38席，参议院占34席。它分开为支持与不支持小泉两派，支持者较多。它的团结不靠共有政治理念，而是多数势力和猪肉桶政治。 宏池会（丹羽·古贺派），会长目前空缺。它在众议院占33席，参议院占15席。这派曾由加藤纮一领导，直至2001年分裂。它较保守，也较针对首相小泉，所以比加藤领导的派阀较成功。这派历史上是最有声望的一派，很多成员都来自精英官僚的上层。 近未来政治研究会（山崎派），会长为山崎拓。它在众议院占32席，参议院占5席。在靖国神社问题方面主张应研究可以对战殁者表示哀悼、祈祷和平的设施。 志帅会（伊吹派），会长为伊吹文明，它在众议院占18席，参议院占16席。多认为它是最右翼派阀。在对外关系方面主张日本需要进一步增加外交考虑，与亚洲的繁荣和发展共生存。 宏池会（谷垣派），会长为谷垣祯一。以前由加藤纮一领导，直至2002年加藤因私人秘书的财政丑闻暂时退出国会。加藤纮一领导以前的联合宏池会（包括现在的堀内派），直至2001年加藤纮一企图推翻当时的首相森喜朗失败，之后加藤派分裂。它在众议院占11席，参议院占4席。在对外关系方面认为必须改变与近邻的异常关系。 番町政策研究所（高村派），会长为高村正彦。它在众议院占13席，参议院占2席。在对外关系方面表示要致力于保持和发展与亚洲各国良好的政治关系。 新波（二阶派），会长为二阶俊博。括了前保守新党的党员，该党在2003年解散。它是自民党内其中一派最右翼的。它在众议院占12席，参议院占2席。 大勇会（旧河野派），前会长为河野洋平，他现为众议院议长。前属加藤派，在1990年代中分裂出来。它在众议院占9席，参议院占1席。它较针对小泉首相，也较偏向改革。它现在称为旧河野组，因为会长辞职，还未决定到新会长。 自民党内还有84个议员不属任何派阀。
