黑桃花 -
问题一：酵母属于什么类别的添加剂 面包酵母(Saccharomycescerevisiae)，又称酿酒酵母或者出芽酵母。面包酵母是与人类关系最广泛的一种酵母，不仅因为传统上它用于制作面包和馒头等食品及酿酒，在现代分子和细胞生物学中用作真核模式生物，其作用相当于原核的模式生物大肠杆菌。面包酵母是发酵中最常用的生物种类。面包酵母的细胞为球形或者卵形，直径5C10μm。其繁殖的方法为出芽生殖。
酿酒酵母是第一个完成基因组测序的真核生物，测序工作于1996年完成。
酿酒酵母的基因组包含大约1200万碱基对，分成16组染色体，共有6275个基因，其中可能约有5800个真正具有功能。据估计其基因约有23%与人类同源。酵母基因组数据库包含有酵母基因组的详细注释(annotation)，是研究真核细胞遗传学和生理学的重要工具。另一个重要的酿酒酵母数据库由慕尼黑蛋白质序列信息中心维护。
在酿酒酵母测序计划开始之前，人们通过传统的遗传学方法已确定了酵母中编码RNA或蛋白质的大约2600个基因。通过对酿酒酵母的完整基因组测序，发现在12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白质的开放阅读框。这意味着在酵母基因组中平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因，即整个基因组有72％的核苷酸顺序由开放阅读框组成。这说明酵母基因比其它高等真核生物基因排列紧密。如在线虫基因组中，平均每隔6kb存在一个编码蛋白质的基因；在人类基因组中，平均每隔30kb或更多的碱基才能发现一个编码蛋白质的基因。酵母基因组的紧密性是因为基因间隔区较短与基因中内含子稀少。酵母基因组的开放阅读框平均长度为1450bp即483个密码子，最长的是位于XII号染色体上的一个功能未知的开放阅读框(4910个密码子)，还有极少数的开放阅读框长度超过1500个密码子。在酵母基因组中，也有编码短蛋白的基因，例如，编码由40个氨基酸组成的细胞质膜蛋白脂质的PMP1基因。此外，酵母基因组中还包含：约140个编码RNA的基因，排列在XII号染色体的长末端；40个编码SnRNA的基因，散布于16条染色体；属于43个家族的275个tRNA基因也广泛分布于基因组中。
序列测定揭示了酵母基因组中大范围的碱基组成变化。多数酵母染色体由不同程度的、大范围的GC丰富DNA序列和GC缺乏DNA序列镶嵌组成。这种GC含量的变化与染色体的结构、基因的密度以及重组频率有关。GC含量高的区域一般位于染色体臂的中部，这些区域的基因密度较高；GC含量低的区域一般靠近端粒和着丝粒，这些区域内基因数目较为贫乏。Simchen等证实，酵母的遗传重组即双链断裂的相对发生率与染色体的GC丰富区相耦合，而且不同染色体的重组频率有所差别，较小的Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅸ号染色体的重组频率比整个基因组的平均重组频率高。?
酵母基因组另一个明显的特征是含有许多DNA重复序列，其中一部分为完全相同的DNA序列，如rDNA与CUP1基因、Ty因子及其衍生的单一LTR序列等。在开放阅读框或者基因的间隔区包含大量的三核苷酸重复，引起了人们的高度重视。因为一部分人类遗传疾病是由三核苷酸重复数目的变化所引起的。还有更多的DNA序列彼此间具有较高的同源性，这些DNA序列被称为遗传丰余(genetic redundancy)。酵母多条染色体末端具有长度超过几十个kb的高度同源区，它们是遗传丰余的主要区域，这些区域至今仍然在发生着频繁的DNA重组过程。遗传丰余的另一种形式是单个基因重复，其中以分散类型最为典型，另外还有一种较为少见的类型是成簇分布的基因家族。成簇同源区(cluster homolog......>>
问题二：酵母到底是食品还是食品添加剂 一般都是当作食品添加剂的。
问题三：酵母粉到底是不是食品添加剂 酵母粉不是食品添加剂
它在食品分类系统中被划分在其他类，编号为16.04
问题四：酵母粉是不是添加剂 酵母粉不是食品添加剂
它在食品分类系统中被划分在其他类，编号为16.04
问题五：发酵粉是不是食品添加剂 是，但一般来说相对安全健康，比如我们一般用小苏打类的，如果是尿酸过高的病人还要多吃有添加小苏打的食物比如苏打面等
问题六：食品添加剂干酵母的国际标准用量是多少 酵母不算食品添加剂，酵母的生产许可证是普通食品的生产许可证，而不是添加剂的生产许可证。食品添加剂使用标准里面也没有酵母……到是普通食品分类系统里可以找到酵母。所以，无论从哪个角度看，酵母都不是食品添加剂。
所以，关于使用量，不会受到添加剂使用标准的限制，按工艺技术要求，需要多少放多少呗。
问题七：安琪酵母是否为添加剂 不属于添加剂！建议你百度下思宾格！他们家的产品也很不错！法国思宾格是世界上历史最悠久的酵母厂家之一，它于1872年成立于法国巴黎，并在美国、法国、巴西、中国以及澳大利亚等地设有制造工厂，是全球酵母抽提物的主要供应商，专长在于为客户提供纯天然的酵母原料。
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开放阅读框架(orf)名词解释
开放阅读框架（orf）是指在给定的阅读框架中，不包含终止密码子的一串序列。开放阅读框架介绍：1、开放阅读框（英语：Open reading frame；缩写：ORF；其他译名：开放阅读框架、开放读架等）是指在给定的阅读框架中，不包含终止密码子的一串序列。2、这段序列是生物个体的基因组中，可能作为蛋白质编码序列的部分。基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。3、由于一段DNA或RNA序列有多种不同读取方式，因此可能同时存在许多不同的开放阅读框架。有一些电脑程序可分析出最可能是蛋白质编码的序列。开放阅读框架使用说明：1、当一个基因被识别、其DNA序列被解读时，人们往往仍然无法弄清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的终止密码子）。2、ORF Finding针对小基因序列，搜索并报导可能的蛋白质编码区，它检测这六个阅读框架，并寻找以启动子和终止子为界限的DNA序列，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。2023-06-30 01:24:041
什么是开放阅读框
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译(每条链三种，对应三种不同的起始位点)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。2023-06-30 01:24:401
什么是开放阅读框
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以起始密码子和终止密码子为界限的DNA序列而其内部不包含起始密码子或终止密码子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。2023-06-30 01:24:481
什么是开放阅读框
在分子生物学中，开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能，一段无终止密码子打断的碱基序列。由于密码子（codon）读写起始位点的不同，DNA序列可能按六种ORF阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。在真核生物中，ORF可能跨过外显子，在mRNA中进行拼接。2023-06-30 01:24:551
什么是开放式阅读框?
开放阅读框 开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断. 当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽.这是 因为在没有其它信息的前提...2023-06-30 01:25:011
开放阅读框（open reading frames, ORFs）是什么？
ORF是分子生物学和生物信息学中的一个基础概念。ORFs的检测是在基因组序列中发现特定蛋白质编码基因的重要一步。orf中的o，或者说open，是指完整基因中用于蛋白质翻译的“开放”区域；而rf，也即reading frame，是指双链基因序列翻译至氨基酸时的6种可能性之一。 定义1 ：一个ORF是指一段能够被3整除的序列，并且包含起始密码子和1个终止密码子（start/stop）。 定义2 ：一个ORF是指一段能够被3整除的序列，以终止密码子为头尾（stop/stop）。 定义3 ：一个ORF是指一段被受体和供体的剪切位点所分隔的序列。 至于为何要选择定义2作为生信领域的最佳选择，请移步文末所列的参考文献[1]，有详细的解释。 orf与基因的关系 orf是完整基因序列的一部分，一个完整基因包括orf序列以及非编码序列。orf可作为一个潜在蛋白质编码基因的指示器，但是预测的orf并不一定是基因。例如，一个典型的细菌基因组中已注释基因的数目远低于ORFs数目，前者约10 3 至10 4 ，而后者可达到10 4 至10 5 [2]。很好理解，毕竟ORFs的数目只是统计的潜在的编码基因数目，stop codon与stop codon所包含的区域并不一定能对应已知基因，因此ORFs相较于已知注释基因会更多。 参考文献 [1] Sieber, P., Platzer, M., Schuster, S. 2018. The Definition of Open Reading Frame Revisited. Trends in Genetics, 34(3), 167-170. [2] Mir, K., Neuhaus, K., Scherer, S., Bossert, M., Schober, S. 2012. Predicting Statistical Properties of Open Reading Frames in Bacterial Genomes. Plos One, 7(9)2023-06-30 01:25:071
开放阅读框要从第几个ATG开始
开放阅读框要从第5个ATG开始。在处理生物学数据的时候，我们经常要对于碱基序列的开放阅读框（ORF）进行获取，以预测其功能和基因结构，甚至是单倍型。从5端开始翻译起始密码子（ATG），到终止于终止密码子TGA，TAA，TAG。期间的序列就是我们所要获取的开放阅读框。特别要注意的是DNA以双链的形式存在，因此两条链（正义链和反义链）都可能成为编码链，在这里需要分类讨论其ORF。2023-06-30 01:25:141
开放阅读框lab基因是什么
开放阅读框lab基因是如下。1、根据查询相关资料信息显示，开放阅读框是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。2、是从起始密码子到终止密码子之间的序列，连续翻译一段多肽链。3、以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。2023-06-30 01:25:201
开放阅读框与阅读框的关系
开放阅读框是阅读框的一部分。开放阅读框是阅读框的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断，开放阅读框是一个从开始起始密码子和端部由终止密码子，没有终止密码子之间，通过将开放阅读框翻译成氨基酸直至达到终止。2023-06-30 01:25:261
什么是开放阅读框
在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段,每三个连续碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸.其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和三个终止“ 密码子”,终止“ 密码子”提供 终止信号.当细胞机器沿着核酸合成蛋白链并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时,蛋白的延伸反应终止,一个成熟（或提前终止的突变）蛋白产生.因此开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的 碱基序列.由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白.x0d现在有很多找ORF的软件,包括在线的,如：x0dORF Finding的功能x0dORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列.它较早应于序列设计,应用优于长片断、高质量的匹配.进而,它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息.ORF Finding 把提交序列分成六个亚区,并对这六个阅读框分别进行默认,赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量,如果可能,将对每一亚区进行进一步分析.每个亚区按照已有的分类结果,被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器.最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报导.ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定的蛋白质的部分或全部的先决条件,可用于大规模的开放式阅读框寻找.x0d使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时,人们往往仍然无法 弄清相应的蛋白序列是什么.这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 （每条链三种,对应三种不同的起始密码子）.ORF Finding 针对小基因序列,搜索并报导可能的蛋白质编码区,它检测这六个阅读框架,并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物.x0dORF Finding 通过如下方式处理您的序列：x0d·定位六个阅读框上的ORF候选区域x0d·对每个候选区域的编码可能性进行评估x0d·如果可能性很高,就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用.ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测,有三步程序.x0d第一步：延伸无终止密码子的序列,把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列.x0d第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性.x0d第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性.x0d这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来,其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定.这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量,被称为候选ORF的二次判别式.这个判别式对于编码区趋向于取大值,对于非编码区 趋向于小值,并被固定化,所以非编码区获取的值趋向于小于1.一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式.89%的区域的期望值小于2.经多次应用发现,5.0的结果很理想,它是介于正、误之间的阈值.x0d使用方法:首先选择你测试的序列的来源（物种）,然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可.但输入序列的长度不得小于50bp.x0d结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置.通常,ORF Finding 会把您提交的序列进行检测,然后根据阅读框的次序（+1,+2,+3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息.如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话,则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出.编码区域的详细信息包括：x0d·Numb x：编码区编号.从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目.x0d·Predicted start、Predicted end:预测的基因编码区的开始、结束.是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置.x0d·Reading frame：阅读框.六种框架（每条链三种,对应三种不同的起始密码子）中的哪一种.x0d·Type：类型.说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的.x0d·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束.即这一编码区的起始和结束.它除包括编码蛋白质的核酸序列外,还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等2023-06-30 01:25:351
开放阅读框跟结构基因到底有什么不同?
开放阅读框:指从起始密码子AUG到终止密码子UAG、UGA、UAA之间,可被翻译成蛋白质的编码序列. 结构基因：以原和生物举例说,一个完整操纵子包括启动子、调节基因、结构基因,只有结构基因才是编码蛋白质的基因,其它的是调控序列. 当转录发生后,结构基因可被转录成mRNA,其中包含一个(真核)或多个(原核)开放阅读框,还有5"UTR,以及3"UTR.2023-06-30 01:25:521
什么是开放阅读框？生物信息学概念
开放阅读框是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。就是从起始密码子到终止密码子之间的序列，连续翻译一段多肽链。生物信息学概念的话就是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面，因为要分析生物基因和蛋白数据量很大，加上现在所说的大数据时代，突出了生物信息学的作用。2023-06-30 01:26:001
什么是开放阅读框（Open Reading Frame, ORF）
在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段，每三个连续碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和三个终止“ 密码子”，终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞机器沿着核酸合成蛋白链并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止的突变）蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的 碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。 现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如： ORF Finding的功能 ORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计，应用优于长片断、高质量的匹配。进而，它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息。ORF Finding 把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量， 如果可能，将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器。最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报导。ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定的蛋白质的部分或全部的先决条件，可用于大规模的开放式阅读框寻找。 使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时，人们往往仍然无法 弄清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 （每条链三种，对应三种不同的起始密码子）。 ORF Finding 针对小基因序列，搜索并报导可能的蛋白质编码区，它检测这六个阅读框架，并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。 ORF Finding 通过如下方式处理您的序列： ·定位六个阅读框上的ORF候选区域 ·对每个候选区域的编码可能性进行评估 ·如果可能性很高，就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用。ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测，有三步程序。 第一步：延伸无终止密码子的序列，把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列。 第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性。 第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性。 这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来，其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定。这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量，被称为候选ORF的二次判别式。这个判别式对于编码区趋向于取大值，对于非编码区 趋向于小值，并被固定化，所以非编码区获取的值趋向于小于1。 一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式。89%的区域的期望值小于2。 经多次应用发现，5.0的结果很理想，它是介于正、误之间的阈值。 使用方法: 首先选择你测试的序列的来源（物种），然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可。但输入序列的长度不得小于50bp。 结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置。通常， ORF Finding 会把您提交的序列进行检测，然后根据阅读框的次序（+1,+2, +3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息。如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话，则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出。编码区域的详细信息包括： ·Numb x： 编码区编号。从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目。 ·Predicted start、Predicted end: 预测的基因编码区的开始、结束。是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置。 ·Reading frame：阅读框。六种框架（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）中的哪一种。 ·Type：类型。说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的。 ·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束。即这一编码区的起始和结束。它除包括编码蛋白质的核酸序列外，还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等。 ·Spectral：吸收光谱。 该段核苷酸的吸收光谱数。 ·ORF length：ORF长度。 ·Max likelihood：最大可能性。请参考 测试过程 中的 编码可能性。 MLE length score：最大可能性估量长度评估。即该编码区上编码部分占整个ORF区的比例。 ·Quadratic discriminant：二次判别式的值。对于编码区趋向于取大值，非编码区趋向于取小值2023-06-30 01:26:081
开放读码框和读码框的区别
整个编码区可以看做一个开放阅读框。开放阅读框 排除了内含子就是 编码序列。 真核生物的基因组成是编码区和非编码区 其中编码区是由外显子和内含子组成的 但是其中内含子又是非编码序列 所以说真核细胞基因结构中，非编码区和内含子是非编码序列2023-06-30 01:26:151
开放阅读框(open reading frame，ORF)
【答案】：指DNA或RNA分子中一组连续的不重叠的密码(不包括终止子)。从DNA序列确定开放阅读框的方法是，一组不含终止密码的编码序列即为一个开放阅读框。2023-06-30 01:26:211
怎么通过开放阅读框序列编码多少氨基酸，预测分子量
在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段,每三个连续碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸.其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和三个终止“ 密码子”,终止“ 密码子”提供 终止信号.当细胞机器沿着核酸合成蛋白链并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时,蛋白的延伸反应终止,一个成熟（或提前终止的突变）蛋白产生.因此开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的 碱基序列.由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白.x0d现在有很多找ORF的,包括在线的,如：x0dORF Finding的功能x0dORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列.它较早应于序列设计,应用优于长片断、高质量的匹配.进而,它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息.ORF Finding 把提交序列分成六个亚区,并对这六个阅读框分别进行默认,赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量,如果可能,将对每一亚区进行进一步分析.每个亚区按照已有的分类结果,被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器.最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报导.ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定的蛋白质的部分或全部的先决条件,可用于大规模的开放式阅读框寻找.x0d使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时,人们往往仍然无法 弄清相应的蛋白序列是什么.这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 （每条链三种,对应三种不同的起始密码子）.ORF Finding 针对小基因序列,搜索并报导可能的蛋白质编码区,它检测这六个阅读框架,并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物.x0dORF Finding 通过如下方式处理您的序列：x0d·定位六个阅读框上的ORF候选区域x0d·对每个候选区域的编码可能性进行评估x0d·如果可能性很高,就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用.ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测,有三步程序.x0d第一步：延伸无终止密码子的序列,把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列.x0d第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性.x0d第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性.x0d这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来,其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定.这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量,被称为候选ORF的二次判别式.这个判别式对于编码区趋向于取大值,对于非编码区 趋向于小值,并被固定化,所以非编码区获取的值趋向于小于1.一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式.89%的区域的期望值小于2.经多次应用发现,5.0的结果很理想,它是介于正、误之间的阈值.x0d使用方法:首先选择你测试的序列的来源（物种）,然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可.但输入序列的长度不得小于50bp.x0d结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置.通常,ORF Finding 会把您提交的序列进行检测,然后根据阅读框的次序（+1,+2,+3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息.如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话,则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出.编码区域的详细信息包括：x0d·Numb x：编码区编号.从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目.x0d·Predicted start、Predicted end:预测的基因编码区的开始、结束.是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置.x0d·Reading frame：阅读框.六种框架（每条链三种,对应三种不同的起始密码子）中的哪一种.x0d·Type：类型.说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的.x0d·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束.即这一编码区的起始和结束.它除包括编码蛋白质的核酸序列外,还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等2023-06-30 01:26:302
什么是开放式读码框
开放式读码框：某些人认为这是分子病理学领域中最孤独的首位字母缩写名词。开放阅读框是DNA上的一段碱基序列，由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。在构成基因的核苷酸序列中存在一些最终翻译成蛋白的碱基段。每三个连续碱基，名为三联“密码子”——编码相应的氨基酸（氨基酸是构成蛋白的基本单位）。有三个“密码子”提供终止信号，也就是说，当从DNA和RNA合成蛋白链并使其不断延伸的细胞机器遇到代表终止的“密码子”时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止的突变蛋白）产生。2023-06-30 01:26:391
6个开放阅读框架怎么判断是哪种
6个开放阅读框架判断可以用ORF识别。根据查询相关资料显示，ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。在真核生物中，ORF可能跨过外显子，在mRNA中进行拼接。2023-06-30 01:26:451
ORF开放阅读框和CDS序列的区别是什么啊?
（1）开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列；不是所有读码框都能被表达出蛋白产物，或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。（2） CDS，是编码一段蛋白产物的序列。（3）CDS可能是一个ORF，但也可能包括多个ORF。（4）反之，每个ORF不一定都是CDS。（5）Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide. Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA ORF-----translation, CDS----transcription translation 是理论上的，而transcription则显然是事实存在的。2023-06-30 01:26:531
snapgene中开放阅读框的方向是
转录。snapgene中有专门的设置这个开放阅读框的方向，它是转录，会跳转这个页面。打开一个质粒图文件，在拓扑选项中选择圆形，显示质粒图的开放阅读框和转录方向。2023-06-30 01:27:111
开放阅读框是DNA序列 还是mRNA？
开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。是DNA序列。2023-06-30 01:27:202
基因、外显子和开放阅读框的区别。
【答案】：基因是产生一条多肽链或功能RNA分子所必需的全部核苷酸序列。开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断，也就是被翻译的区域。外显子为基因上及其转录初级产物上可表达的序列，或转录初级产物上通过拼接作用而保留于成熟的RNA中的核苷酸序列或基因中与成熟RNA相对应的DNA序列。[考点]基因、外显子与开放阅读框的三个概念的内涵。2023-06-30 01:27:271
请问CDS和ORF有什么区别？谢谢回答详细一点。
1、含义不同。ORF的英文展开是openu2002readingu2002frame（开放阅读框）。u2002CDS的英文展开是codingu2002sequencesu2002（编码区）。2、来源不同。ORF只是理论上的编码区，与真实的情景可能并不一样。u2002u2002而CDS是检查cDNA后得到的编码组合序列，和实际情景比较接近。扩展资料：ORF三种框架的来源：（1）ATG（T在中心）电脑程序发现的启动因子的组合u2002（2）CAT（T在最右侧）u2002（3）TGC（T在最左侧）本例中实际核酸编码的组合。2023-06-30 01:27:373
开放阅读框是对cdna来说的吗
不是～cDNA是由mRNA反转录得来～开放阅读框orf是由起始密码子开始到终止密码子结束的一段理论上能编码蛋白质的基因序列～2023-06-30 01:27:581
开放阅读框怎么计算
在分子生物学中，开放阅读框从起始密码子开始，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能，一段无终止密码子打断的碱基序列。由于密码子读写起始位点的不同，DNA序列可能按六种ORF阅读和翻译。ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。在真核生物中，ORF可能跨过外显子，在mRNA中进行拼接。在mRNA序列中，每三个连续碱基(编码相应的氨基酸。其中有一个起始密码子AUG和三个终止密码子UAA，UAG，UGA。核糖体从起始密码子开始翻译，沿着mRNA序列合成多肽链并不断延伸，遇到终止密码子时，多肽链的延伸反应终止。由于读写位置不同，ORF在两条链上具有六种可能性。2023-06-30 01:28:051
怎样快速找到基因序列的开放阅读框
可以先到NCBI的数据库去找，里面会有基因的详细信息，有一些软件分析的时候也会给出已知的基因的ORF。如果没有就要自己分析了，一般是有ATG作为起始密码子，在这个ATG前有3种终止密码子中的一个。2023-06-30 01:28:122
DNA序列分析为什么要分析开放阅读框
因为一般的做DNA相关的都是为了能更好的分析蛋白及表达蛋白，开放阅读框的DNA序列编码的就是你所要分析的蛋白2023-06-30 01:28:211
非编码区与外显子、开放阅读框的关系？谢谢
DNA包括编码区、非编码区编码区即开放阅读框（ORF），它包括了外显子、内含子，除去了内含子的编码区，即编码序列（CDS）2023-06-30 01:28:282
如何确定开放阅读框生物学功能
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。ORF开放阅读框[open reading frame，ORF] 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。2023-06-30 01:29:081
什么是开放阅读框
什么是开放阅读框开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译(每条链三种，对应三种不同的起始位点)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。2023-06-30 01:29:151
什么是开放阅读框
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。2023-06-30 01:29:231
什么是开放式阅读框？
开放阅读框 开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。 当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是 因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三 种不同的起始密码子）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终 止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子，符合这些条件的序列有可能对应一 个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的 部分或全部的先决条件。 An open reading frame (ORF) is a portion of a gene"s sequence that contains a sequence of bases， uninterrupted by stop sequences， that could potentially encode a protein. When a new gene is identified and its DNA sequence deciphered， it is still unclear what its corresponding protein sequence is. This is because， in the absence of any other knowledge， the DNA sequence can be translated or read in six possible reading frames (three for each strand， corresponding to three different start positions for the first codon). ORF identification involves scanning each of the six reading frames and determining which one(s) contains a stretch of DNA sequence bounded by a start and stop codon， yet containing no start or stop codons within it； a sequence meeting these conditions could correspond to the actual single product of the gene. The identification of an ORF provides the first evidence that a new sequence of DNA is part or all of a gene encoding for a particular protein. 在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段，每三个连续 碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和 三个终止“ 密码子”，终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞机器沿着核酸合成蛋白链 并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止 的突变）蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的 碱基 序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的 终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。 现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如： ORF Finding的功能 ORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计 ，应用优于长片断、高质量的匹配。进而，它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息 。ORF Finding 把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚 区一个确定其编码内容的度量， 如果可能，将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照 已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器。最后只有那 些具有编码潜能的重要区域才被报导。ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定 的蛋白质的部分或全部的先决条件，可用于大规模的开放式阅读框寻找2023-06-30 01:29:311
开放阅读框的介绍
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以起始密码子和终止密码子为界限的DNA序列而其内部不包含起始密码子或终止密码子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。2023-06-30 01:29:371
开放阅读框和什么对应
关闭阅读框。开放阅读框（openreadingframeORF）是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。开放阅读框相对应的是关闭阅读框。2023-06-30 01:29:491
什么是开放式阅读框？
开放阅读框 开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。 当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是 因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三 种不同的起始密码子）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终 止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子，符合这些条件的序列有可能对应一 个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的 部分或全部的先决条件。 An open reading frame (ORF) is a portion of a gene"s sequence that contains a sequence of bases， uninterrupted by stop sequences， that could potentially encode a protein. When a new gene is identified and its DNA sequence deciphered， it is still unclear what its corresponding protein sequence is. This is because， in the absence of any other knowledge， the DNA sequence can be translated or read in six possible reading frames (three for each strand， corresponding to three different start positions for the first codon). ORF identification involves scanning each of the six reading frames and determining which one(s) contains a stretch of DNA sequence bounded by a start and stop codon， yet containing no start or stop codons within it； a sequence meeting these conditions could correspond to the actual single product of the gene. The identification of an ORF provides the first evidence that a new sequence of DNA is part or all of a gene encoding for a particular protein. 在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段，每三个连续 碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和 三个终止“ 密码子”，终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞机器沿着核酸合成蛋白链 并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止 的突变）蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的 碱基 序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的 终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。 现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如： ORF Finding的功能 ORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计 ，应用优于长片断、高质量的匹配。进而，它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息 。ORF Finding 把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚 区一个确定其编码内容的度量， 如果可能，将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照 已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器。最后只有那 些具有编码潜能的重要区域才被报导。ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定 的蛋白质的部分或全部的先决条件，可用于大规模的开放式阅读框寻找2023-06-30 01:29:561
什么是开放式阅读框？
开放阅读框 开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。 当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是 因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三 种不同的起始密码子）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终 止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子，符合这些条件的序列有可能对应一 个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的 部分或全部的先决条件。 An open reading frame (ORF) is a portion of a gene"s sequence that contains a sequence of bases， uninterrupted by stop sequences， that could potentially encode a protein. When a new gene is identified and its DNA sequence deciphered， it is still unclear what its corresponding protein sequence is. This is because， in the absence of any other knowledge， the DNA sequence can be translated or read in six possible reading frames (three for each strand， corresponding to three different start positions for the first codon). ORF identification involves scanning each of the six reading frames and determining which one(s) contains a stretch of DNA sequence bounded by a start and stop codon， yet containing no start or stop codons within it； a sequence meeting these conditions could correspond to the actual single product of the gene. The identification of an ORF provides the first evidence that a new sequence of DNA is part or all of a gene encoding for a particular protein. 在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段，每三个连续 碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和 三个终止“ 密码子”，终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞机器沿着核酸合成蛋白链 并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止 的突变）蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的 碱基 序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的 终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。 现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如： ORF Finding的功能 ORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计 ，应用优于长片断、高质量的匹配。进而，它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息 。ORF Finding 把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚 区一个确定其编码内容的度量， 如果可能，将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照 已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器。最后只有那 些具有编码潜能的重要区域才被报导。ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定 的蛋白质的部分或全部的先决条件，可用于大规模的开放式阅读框寻找2023-06-30 01:30:041
开放阅读框的使用说明
使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时，人们往往仍然无法弄清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 （每条链三种，对应三种不同的终止密码子）。 ORF Finding 针对小基因序列，搜索并报导可能的蛋白质编码区，它检测这六个阅读框架，并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF Finding 通过如下方式处理您的序列： ·定位六个阅读框上的ORF候选区域 ·对每个候选区域的编码可能性进行评估 ·如果可能性很高，就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用。ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测，有三步程序。 第一步：延伸无终止密码子的序列，把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列。 第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性。 第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性。 这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来，其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定。这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量，被称为候选ORF的二次判别式。这个判别式对于编码区趋向于取大值，对于非编码区 趋向于小值，并被固定化，所以非编码区获取的值趋向于小于1。 一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式。89%的区域的期望值小于2。2023-06-30 01:30:111
什么是开放阅读框
开放阅读框 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。2023-06-30 01:30:252
开放读码框的原理
ORF Finding 通过如下方式处理您的序列：定位六个阅读框上的ORF候选区域对每个候选区域的编码可能性进行评估。如果可能性很高，就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导。编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用。ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测，有三步程序。第一步：延伸无终止密码子的序列，把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列。第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性。第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性。这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来，其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定。这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量，被称为候选ORF的二次判别式。这个判别式对于编码区趋向于取大值，对于非编码区 趋向于小值，并被固定化，所以非编码区获取的值趋向于小于1。 一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式。89%的区域的期望值小于2。 经多次应用发现，5.0的结果很理想，它是介于正、误之间的阈值。使用方法: 首先选择你测试的序列的来源（物种），然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可。但输入序列的长度不得小于50bp。结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置。通常， ORF Finding 会把您提交的序列进行检测，然后根据阅读框的次序（+1,+2, +3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息。如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话，则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出。编码区域的详细信息包括：·Numb x： 编码区编号。从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目。·Predicted start、Predicted end: 预测的基因编码区的开始、结束。是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置。·Reading frame：阅读框。六种框架（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）中的哪一种。·Type：类型。说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的。·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束。即这一编码区的起始和结束。它除包括编码蛋白质的核酸序列外，还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等。·Spectral：吸收光谱。 该段核苷酸的吸收光谱数。·ORF length：ORF长度。·Max likelihood：最大可能性。请参考 测试过程 中的 编码可能性。MLE length score：最大可能性估量长度评估。即该编码区上编码部分占整个ORF区的比例。·Quadratic discriminant：二次判别式的值。对于编码区趋向于取大值，非编码区趋向于取小值。2023-06-30 01:30:431
开放阅读框架需要多少个氨基酸
开放阅读框架需要66个氨基酸。开放阅读框是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。2023-06-30 01:30:551
什么是ORF
开放阅读框（Open Reading Frame, ORF），某些人认为这是分子病理学领域中最孤独的首位字母缩写名词。在构成基因的核苷酸序列中存在一些最终翻译成蛋白的碱基段。每三个连续碱基，名为三联“密码子”——编码相应的氨基酸（氨基酸是构成蛋白的基本单位）。有三个“密码子”提供终止信号，也就是说，当从DNA和RNA合成蛋白链并使其不断延伸的细胞机器遇到代表终止的“密码子”时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止的突变蛋白）产生。因此开放阅读框是DNA上的一段碱基序列，由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。2023-06-30 01:31:012
开放阅读框的发现
经多次应用发现，5.0的结果很理想，它是介于正、误之间的阈值。 使用方法: 首先选择你测试的序列的来源（物种），然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可。但输入序列的长度不得小于50bp。结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置。通常， ORF Finding 会把您提交的序列进行检测，然后根据阅读框的次序（+1,+2, +3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息。如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话，则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出。编码区域的详细信息包括：·Numb x： 编码区编号。从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目。·Predicted start、Predicted end: 预测的基因编码区的开始、结束。是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置。·Reading frame：阅读框。六种框架（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）中的哪一种。·Type：类型。说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的。·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束。即这一编码区的起始和结束。它除包括编码蛋白质的核酸序列外，还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等。·Spectral：吸收光谱。 该段核苷酸的吸收光谱数。·ORF length：ORF长度。·Max likelihood：最大可能性。请参考 测试过程 中的 编码可能性。·MLE length score：最大可能性估量长度评估。即该编码区上编码部分占整个ORF区的比例。·Quadratic discriminant：二次判别式的值。对于编码区趋向于取大值，非编码区趋向于取小值。2023-06-30 01:31:081
开放阅读框跟结构基因到底有什么不同
开放阅读框跟结构基因到底有什么不同开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可能按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。ORF开放阅读框[open reading frame，ORF] 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。2023-06-30 01:31:221
怎样快速找到基因序列的开放阅读框
开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。2023-06-30 01:31:292
开放阅读框形成多少个肽
开放阅读框形成66个肽。根据查询相关资料显示：开放阅读框架需要66个氨基酸，肽是由氨基酸组成的，因此需要66个肽。2023-06-30 01:31:351
开放读码框的介绍
英文：（Open Reading Frame, ORF） 某些人认为这是分子病理学领域中最孤独的首位字母缩写名词。开放阅读框是DNA上的一段碱基序列，由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。2023-06-30 01:31:421
开放阅读框的核苷酸序列
在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段，每三个连续碱基(即三联“ 密码子”） 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和三个终止“ 密码子”，终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞器核糖体沿着核酸合成蛋白链并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时，蛋白的延伸反应终止，一个成熟（或提前终止的突变）蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的 碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。2023-06-30 01:31:561
简述克隆真核生物基因组已知基因全长ORF的基本过程。ORF是开放式阅读框。
首先设计好引物，提取RNA、转录成cDNA，扩增、克隆到合适载体2023-06-30 01:32:331
HBV-DNA的基本组成
乙肝病毒有3200个核苷酸组成的，分为负链和正链，负链有4个开放阅读框（ORF），分别称为S区，X区，C区，P区。S区：由S基因、PreS1和PreS2基因组成。编码HBsAg、PreS1、PreS2。C区：由前C和C基因组成。C基因编码核心蛋白HBcAg。Pre-C与C基因共同编码Pre-C蛋白。Pre-C蛋白经切割加工后形成HBeAgP区：编码DNA多聚酶X区：编码HBx2023-06-30 01:32:411
某一基因开放阅读框中的一个碱基突变(替换、插入或缺失)会对该基因编码产物产生什么影响？
某一基因开放阅读框中有一个建议会对飞机产生一个异常好的效果和质量。2023-06-30 01:32:551