酵母双杂交

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酵母双杂交的具体过程是什么?(中文)

菌株与质粒AH109酵母菌株(MATa,trp1.901,leu2—3,112,ura3-52,his3-200,gal4A,gal8O~X,LYS2::G地1U^s-GALlT^T^-HIS3, G U^s—GAI2T^T^-ADE2,URA3::h吐1U^s.h吐1T^T^.1acZ),YM187酵母菌株(NATQ,um3-52,his3-200,ade2—101,trpl-901,leu2-3,112,g △,met, O△,URA3::GAL1U^s-GAL1T^T^一laeZ,NE!,1).I~BKT7-p53是编码鼠p53蛋白(a.a.72—390)和GAL4 DNA BD(a.a.1—147)融合蛋白的阳性对照质粒。pcArrr7.T是编码SV40大T抗原(a.a.87—7O8)和GAL4 DNA.BD(a.a.1—147)融合蛋白的阳性对照质粒,上述菌株与质粒均购自CLONTECH公司。JIVl109大肠杆菌菌株购自promega公司。1.2 试剂鲑鱼精担体DNA,酵母培养用的YPDMedium SD Minimal medium 一 DO Supplement 一LeuDO Supplement、一Leu/一Trp DO Supplement、一Leu/Trp/HisDO Supplement、一Ade/一His/一L~aTrp 130 Supplement等均购自CLONTECH。硫酸腺嘌呤(Adenine hemisul。fate)购自Gibco。PEG 3250购自Sigma。DMSO购自AMRESCO。硝酸纤维素膜购自Phamacia。X-Gal购自BBI。QIAprep Miniprep Kit购自QIAGEN公司,其它常规分子生物学试剂购自北京华美生物公司。1.3 pGBKT7.ps3和t~alrr7.T质粒的制备用2mL LB液体培养基扩增pGBKT7一p53和pGADT7一T质粒。分别用小规模碱裂解法【7 (AIK法)和QtarREPMiniprep Kit试剂盒(QIAGEN法)提取质粒。紫外分光光度法测0D260/280,并计算质粒DNA含量。1.4 酵母双杂交共转化实验按酵母操作手册建议的方法进行转化,取不同量的上述两种方法提取的pGBKT7—053和pGADT7.T质粒共转化到AH109酵母菌株中,将转化好的细胞按照1:10、1:100、1:10003种不同浓度稀释,然后取100 铺于SD/Trp/一Leu平板上,待长出克隆后计算生长克隆数目(cfu)。计算共转化效率:转化效率cfu//.tg DNA=cfu×悬浮细胞体积( )×稀释倍数/[铺板体积( )×DAN‘](*这里的DNA的量指的是所用一份的质粒量而非全部质粒总量)。1.5 酵母双杂交顺序转化实验取不同量的上述两种方法提取的pGBKT7—053转化于AH109酵母菌株,用SD/ TW缺陷培养基筛选得到AH109[pGBKT7—53],挑取新鲜的直径为2—3 iran的AH109[pGBKT7一p53]酵母单克隆4—8个,接种于1 ml SD/一Trp缺陷液体培养基中,旋涡振荡1 mira,彻底打散菌团。将1IIll菌液转移到5O IIll的sD液体缺陷培养基中。将pGADT7一T转化于AH109[pGBKTT-53],其余方法同酵母操作手册,将转化好的细胞按照1:10、1:100、1:1000三种不同浓度稀释,然后取100 铺于SD/一Trp/.Leu平板上,待长出克隆后计算生长克隆数目(cfu)。按上述公式计算转化效率。1.6 酵母双杂交交配实验 将pGBKT~.p53和pGADTrT质粒分别转化于酵母菌株AH109和YM187中,待在相应SD缺陷培养基平板上生长出克隆后,分别各挑取一个2—3 nl/n酵母单克隆共放置于一个含有0.5 ml YPDA液体培养基的1O IIll离心管中,涡流震荡1 min,彻底打散菌团,3ocI=、200rpm过夜培养(20—24 h)。100 交配培养物铺于SD/一 一Leu培养基平板,200 交配培养物铺于SD/一His/一I~u/Tw(TDO )培养基平板。检测二倍体数目:将交配产物按照1:10、1:100、1:1000三种不同浓度稀释,然后取100 铺于SD/一Trp/.Leu平板。待长出克隆后计数cfu。计算二倍体细胞数目:cfu×悬浮细胞体积(ta)×稀释倍数/铺板体积(ta)。1.7 窖a1分析实验1.7.1 8一半乳糖苷酶的定性分析 检测AH109[pGBKT7—053+pGADT7一T]的8一半乳糖苷酶活性,挑酵母克隆(新鲜直径为2—3 mm)划双斜线于平铺在相应培养基平板上的灭菌的硝酸纤维素膜上,3ocI=倒置培养24小时。将膜于液氮中冷冻,冷冻时间分别为10 s、30 s、1 rain、2 rain,30cI=放置10 mill,置于浸没于Z bufer/X.gal(100 ml Z bufer、0.27 ml f≥I巯基乙醇、1.67 ml 20 mg/m~的X—ga1)溶液的滤纸上(z bufedX.gal溶液以刚刚浸湿滤纸为佳),放置于3OcI=下进行观察,15 rain记录一次,以后可每隔1 h记录一次。观察不同条件下菌落的颜色变化,划线的酵母菌落颜色在8 h内显色变蓝的即为阳性结果。同时没定液氮冷冻时间为1 min,比较处于不同显色温度(25℃、30℃、37℃)下f;-半乳糖苷酶的活性。1.7.2 8一半乳糖苷酶的定量分析定量分析AH109[pGBKT7—053+pGADT7一T]的8一半乳糖苷酶活性,同时以AH109[pCL1]为阳性对照,AH109[pGBKT7—053+pG~rr7一T]和AH109[pGBKT~+pGADT~一T]为空载体对照,AH109为阴性对照。AH109[pCL1]的稀释倍数为3,其余的稀释倍数为1。具体步骤参照酵母操作手册。计算p半乳糖苷酶的单位:1000×OD∞/(t×V×ODao),其中t为反应时间,V=0.1 ml×稀释倍数。

酵母双杂交技术与蓝白斑筛选的区别

酵母双杂交系统是将待研究的两种蛋白质分别克隆(融合)到酵母表达质粒的转录激活域(如GAL4等)的DNA结合结构域(DNA-BD)和转录激活域(AD)上,构建成融合表达载体,从表达产物分析两种蛋白质相互作用的系统。蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子。蓝白斑筛选主要为基因互补与抗生素基因。蓝白斑筛选在指示培养基上,未转化质粒的菌落因无抗生素抗性而不能生长,重组质粒的菌落是白色的,非重组质粒的菌落是蓝色的,以颜色不同为依据直接筛选重组克隆的方法。

酵母双杂交技术与蓝白斑筛选的区别

酵母双杂交系统是将待研究的两种蛋白质分别克隆(融合)到酵母表达质粒的转录激活域(如GAL4等)的DNA结合结构域(DNA-BD)和转录激活域(AD)上,构建成融合表达载体,从表达产物分析两种蛋白质相互作用的系统。蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子。蓝白斑筛选主要为基因互补与抗生素基因。蓝白斑筛选在指示培养基上,未转化质粒的菌落因无抗生素抗性而不能生长,重组质粒的菌落是白色的,非重组质粒的菌落是蓝色的,以颜色不同为依据直接筛选重组克隆的方法。