1、成立的目的不同:成立之初,塔利班只有800人,并没有引起人们的重视。他们高举铲除军阀、重建国家的旗帜,纪律严明,作战勇敢,并提出反对腐败、恢复商业的主张,因此深得阿富汗平民的支持。基地组织成立之初,其目的是为了训练和指挥与入侵阿富汗的苏联军队战斗的阿富汗义勇军,但是从苏军撤退后的1991年前后开始,该组织将目标转为打倒美国和伊斯兰世界的“腐败政权”。“东伊运”的活动资金主要来源于本·拉登“基地”组织的资助。2、组织性质不同:塔利班是发源于阿富汗的坎大哈地区的伊斯兰原教旨主义运动组织。它的大部分成员是阿富汗难民营伊斯兰学校的学生,故又称伊斯兰学生军。基地组织是一个伊斯兰教军事组织,该组织于1988年苏联入侵阿富汗斯坦后期创立,创立者是沙特阿拉伯富商本·拉登。在阿拉伯有10多处训练基地,对从各国来到阿富汗的成员进行恐怖活动训练。3、组织结构不同:塔利班政权实行高度的中央集权制,组织机构严密。塔利班总部设在坎大哈。最高领导人为毛拉·穆罕默德·奥马尔。最高决策机构是大协商会议(大舒拉)。“基地”组织有三层核心:第一层核心是“基地硬骨头”,这个核心是由拉登本人以及那些自八十年代以来一直随拉登鞍前马后跑的人组成,人数在数十人左右。第二层核心是数十个分散在世界各地的“基地”组织分支的领袖人物。第三层核心是拉登最铁杆的秘密信徒。参考资料来源:百度百科-塔利班参考资料来源:百度百科-基地组织