绿色荧光蛋白(GFP)的基因序列有多大
最开始是 238 个氨基酸的肽链,约 25KDa。然后按一定规则,11 条β-折叠在外周围成圆柱状的栅栏;圆柱中,α-螺旋把发色团固定在正几乎中心处。发色图被围在中心,能避免偶极化的水分子、顺磁化的氧分子或者顺反异构作用与发色团,致使荧光猝灭。荧光是荧光蛋白最特别的特点,而其中的发色团起着主要的作用。在 α-螺旋上的 65、66、67位氨基酸——丝氨酸、酪氨酸、甘氨酸经过环化、脱氢等作用后形成发色团。发色团形成过程是由外周栅栏上的残基催化,底物只需要氧气。这暗示绿色荧光蛋白被广泛用于不同物种的潜力:在不同物种中能独立表达成有功能的蛋白,而不需要额外的因子。不过,现在依然在讨论准确的过程。发色团上的共轭 π键能吸收激发光能量,在很短的时间后,以波长更长的发射光释放能量,形成荧光。扩展资料:由于荧光蛋白能稳定在后代遗传,并且能根据启动子特异性地表达,在需要定量或其他实验中慢慢取代了传统的化学染料。更多地,荧光蛋白被改造成了不同的新工具,既提供了解决问题的新思路,也可能带来更多有价值的新问题。在细胞生物学与分子生物学中,绿色萤光蛋白(GFP)基因常用做报告基因(reporter gene)。绿色萤光蛋白基因也可以克隆到脊椎动物(例如:兔子)上进行表现,并拿来映证某种假设的实验方法。通过基因工程技术,绿色萤光蛋白(GFP)基因能转进不同物种的基因组,在后代中持续表达。现在,绿色萤光蛋白(GFP)基因已被导入并表达在许多物种,包括细菌,酵母和其他真菌,鱼(例如斑马鱼),植物,苍蝇,甚至人等哺乳动物的细胞。参考资料来源:百度百科-绿色荧光蛋白
绿色荧光蛋白(GFP)的基因序列有多大
最开始是 238 个氨基酸的肽链,约 25KDa。然后按一定规则,11 条β-折叠在外周围成圆柱状的栅栏;圆柱中,α-螺旋把发色团固定在正几乎中心处。发色图被围在中心,能避免偶极化的水分子、顺磁化的氧分子或者顺反异构作用与发色团,致使荧光猝灭。荧光是荧光蛋白最特别的特点,而其中的发色团起着主要的作用。在 α-螺旋上的 65、66、67位氨基酸——丝氨酸、酪氨酸、甘氨酸经过环化、脱氢等作用后形成发色团。发色团形成过程是由外周栅栏上的残基催化,底物只需要氧气。这暗示绿色荧光蛋白被广泛用于不同物种的潜力:在不同物种中能独立表达成有功能的蛋白,而不需要额外的因子。不过,现在依然在讨论准确的过程。发色团上的共轭 π键能吸收激发光能量,在很短的时间后,以波长更长的发射光释放能量,形成荧光。扩展资料:由于荧光蛋白能稳定在后代遗传,并且能根据启动子特异性地表达,在需要定量或其他实验中慢慢取代了传统的化学染料。更多地,荧光蛋白被改造成了不同的新工具,既提供了解决问题的新思路,也可能带来更多有价值的新问题。在细胞生物学与分子生物学中,绿色萤光蛋白(GFP)基因常用做报告基因(reporter gene)。绿色萤光蛋白基因也可以克隆到脊椎动物(例如:兔子)上进行表现,并拿来映证某种假设的实验方法。通过基因工程技术,绿色萤光蛋白(GFP)基因能转进不同物种的基因组,在后代中持续表达。现在,绿色萤光蛋白(GFP)基因已被导入并表达在许多物种,包括细菌,酵母和其他真菌,鱼(例如斑马鱼),植物,苍蝇,甚至人等哺乳动物的细胞。参考资料来源:百度百科-绿色荧光蛋白
怎样快速找到基因序列的开放阅读框
可以先到NCBI的数据库去找,里面会有基因的详细信息,有一些软件分析的时候也会给出已知的基因的ORF。如果没有就要自己分析了,一般是有ATG作为起始密码子,在这个ATG前有3种终止密码子中的一个。
怎样快速找到基因序列的开放阅读框
开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译(每条链三种,对应三种不同的起始密码子)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。
酶的基因序列的多态性研究有何意义
遗传多态性(genetic polymorphism) 同一群体中两种或两种以上变异类型并存的现象,其中最少的一种类型也并非由于反复突变才得以维持,并且变异类型不包括连续性变异如人的高度等。 平衡型多态 人类的ABO血型由一个座位上3个复等位基因所控制(...5537
基因序列的内含子是什么?
内含子是基因内的间隔序列,不出现在成熟的RNA分子中,在转录后通过加工被切除。大多数真核生物的基因都有内含子。需注意的是,在古细菌中也有内含子。在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。大多数真核结构基因中的间插序列(interveningsequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子这个术语表示)经加工被从初级转录本中准确除去,才产生有功能的RNA。基因的编码部分称外显子。内含子常比外显子长,且占基因的更大比例。真核基因所含内含子的数目、位置和长度不尽相同,如鸡卵清蛋白基因的外显子被7个内含子隔开,鸡卵伴清蛋白基因有17个内含子,α-珠蛋白基因有2个内含子,卵粘蛋白基因有6个内含子等。又称沉默DNA(silentDNA)。真核基因中的非翻译区,它不被表达于蛋白质分子或成熟的mRNA中。内含子把单个真核基因分成许多不连续的区域。内含子也可见于某些前核基因组,但较为少见,且也有许多调节功能。由核RNA转录产生的为不均一核RNA(hnRNA)含有内含子,经特殊的酶(如ribozyme)作用切去内含子序列,然后剩余的外显子(exon)被连接酶拼接成为成熟的mRNA。
怎样查基因序列
1 打开NCBI主页 2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称 3 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。 4 再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择GENEBANK。 5 最下面就是他的基因序列 当然也可以参考页面上提供的CDS区域范围来看。
ncbi的基因序列是从哪一端开始的
是5‘端到3"端
请高手给详细解释一下基因序列的信息
这个是使用seqin在Genebank上提交的基因组注释格式gene1..1751基因的起始、终结位点/gene="FSHB"基因的名称/note="folliclestimulatinghormone,betapolypeptide"关于这个名称的相关注释/db_xref="GeneID:281171"基因的IDCDS70..459基因中编码一段蛋白产物的序列/translation="MKSVQFCFLFCCWRAICCRSCELTNITITVEKEECGFCISINTTWCAGYCYTRDLVYRDPARPNIQKTCTFKELVYETVKVPGCAHHADSLYTYPVATECHCSKCDSDSTDCTVRGLGPSYCSFREIKE"蛋白序列翻译结果其他都是一些重复的,你可以去看一下关于NCBI的介绍
基因序列和编码序列有什么区别
CDS是编码序列Codingsequence的缩写。DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应。CDS是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语。ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。 基本区别(1)开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列;不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。 (2)CDS,是编码一段蛋白产物的序列。 (3)cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。 (4)反之,每个orf不一定都是cds。 希望对您有所帮助
怎样找到基因序列(请告诉详细步骤)O(∩_∩)O谢谢
NCBI,若有序列号则直接输入查找。没有可以通过查找物种以及基因名称在NCBI中查找。步骤:1.打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez2. 上方有搜索条,默认为PUBMED,打开下拉菜单,选择Gene,在右侧输入"基因名称"AND"物种名称", 点击搜索3. 如基因序列收录,应该在搜索结果里,找到点击打开说的比较简单,如你没搜到,可以给我发消息
怎么用基因id查询基因序列?
用你要查的基因的ID。在NCBI等数据库库中,每个基因都有一个编号,即ID,就像每个人有一个身份证一样。如果你不知道其ID 也可以输入基因名称搜寻的。
知道在染色体上的位置,如何查出那段基因序列
到NCBI网站,查人的基因组,找到关注的染色体就可以。在染色体上获取目的基因要用到限制性核酸内切酶,根据目的基因的基因序列来选择相应的限制性核酸内切酶,限制性核酸内切酶就能切割出所需的目的基因了,并且根据切割的末端又可以分为粘性末端和平末端。用于DNA基因组物理图谱的组建;基因的定位和基因分离;DNA分子碱基序列分析;比较相关的DNA分子和遗传工程。限制性核酸内切酶是由细菌产生的,其生理意义是提高自身的防御能力。限制酶一般不切割自身的DNA分子,只切割外源DNA。扩展资料:DNA分子类似“计算机磁盘”,拥有信息的保存、复制、改写等功能。将人体细胞核中的23对染色体中的DNA分子连接起来拉直,其长度大约为0.7米,但若把它折叠起来,又可以缩小为直径只有几微米的小球。因此,DNA分子被视为超高密度、大容量的分子存储器。基因芯片经过改进,利用不同生物状态表达不同的数字后还可用于制造生物计算机。基于基因芯片和基因算法,未来的生物信息学领域,将有望出现能与当今的计算机业硬件巨头――英特尔公司、软件巨头――微软公司相匹敌的生物信息企业。参考资料来源:百度百科-基因
已知部分基因序列,如何获得全长基因?
基因是遗传物质基本的功能单位,分离和克隆目的基因是研究基因结构、揭示基因功能及表达的基础,因此,克隆某个功能基因是生物工程及分子生物学研究的一个重点。经典克隆未知基因的方法比如通过筛选文库等有个共同的弊病, 即实验操作繁琐, 周期较长、工作量繁重,且不易得到全长序列。又由于在不同植物中目的基因mRNA丰度不同,所以获得目的基因的难易程度又不一样,特别是对于丰度比较低的目的基因即使使用不用的方法也不一定能获得成功。近年来随着PCR技术的快速发展和成熟.已经有多种方法可以获得基因的全长序列, 比如经典的RACE技术,染色体步移法和同源克隆法等,本文主要综述几种重要的克隆方法的原理和运用,并且比较分析这几种方法的优缺点,为你的实验节约时间和成本。 1. RACE技术 1985年由美国PE-Cetus公司的科学家Mulis等[1]发明的PCR技术使生命科学得到了飞跃性的发展。1988年Frohman等[2] 在PCR技术的基础上发明了一项新技术, 即cDNA末端快速扩增技术( rapid amplification of cDNA ends, RACE), 其实质是长距PCR( long distance, PCR)。通过PCR由已知的部分cDNA 序列, 获得5′端和3′端完整的cDNA, 该方法也被称为锚定PCR ( anchored PCR) [3] 和单边PCR( one-sidePCR) [4]。RACE技术又分为3"RACE和5"端RACE。3′RACE 的原理是利用mRNA 的3′端天然的poly(A) 尾巴作为一个引物结合位点进行PCR, 以Oligo( dT) 和一个接头组成的接头引物( adaptor primer, AP)反转录mRNA得到加接头的第一链cDNA。然后用一个正向的基因特异性引物( gene-specific primer, GSP) 和一个含有接头序列的引物分别与已知序列区和poly(A) 尾区退火, 经PCR扩增位于已知序列区域和poly( A) 尾区之间的未知序列,若为了防止非特异性条带的产生, 可采用巢式引物( nested primer) 进行第二轮扩增, 即巢式PCR( nested PCR) [5,6]。5"RACE跟3"RACE原理基本一样,但是相对于3"RACE来说难度较大。 5"-RACE受到诸多因素的影响而常常不能获取全长,因此研究者都着手改进它。这些措施主要是通过逆转录酶、5"接头引物等的改变来实现的,因此出现了包括基于“模板跳转反转录”的SMART RACE技术( switching mechanism at 5′ end of RNA transcript) [7] , 基于5′脱帽和RNA酶连接技术的RLM-RACE技术(RNA ligase mediated RACE)[8], 利用RNA连接酶为cDNA第一链接上寡聚核苷酸接头的SLC RACE技术(single strand ligation to single-stranded cDNA)[9] , 以及以内部环化的cDNA第一链为模板进行扩增的自连接或环化RACE技术(self-ligation RACE or circular RACE)[10],和通过末端脱氧核苷酸转移酶( TdT)加尾后引入锚定引物的锚定RACE技术( anchored RACE)[11]。 1.1基于‘模板跳转"的SMART RACE技术 SMART-RACE技术的最大特点是5′ RACE过程中的“模板跳转”现象,即当反转录进行到mRNA模板的5′末端时,反转录酶表现出末端转移酶活性,在第一链cDNA的3′端加上3-5 个残基(主要是dC) ,随后第一链cDNA与3′端含几个dG的寡核苷酸引物退火,使反转录反应发生跳移,以引物中寡核苷酸为模板继续进行,最终反转录所得产物必然包含完整的mRNA5′末端序列及引物序列,可直接用于RACE-PCR获得完整地5′ cDNA末端。由于上述过程无需接头连接,而且直接以第一链cDNA作为模板进行RACE-PCR ,因此更加简便、快捷。另外,SMART -RACE还采用了降落PCR、抑制PCR、LD - PCR 等先进扩增技术,提高了PCR扩增的敏感性和真实性,降低了非特异的产物背景,因此该技术已被广泛应用于cDNA末端快速扩增,尤其是5"端的克隆。 1.2末端脱氧核苷酸转移酶( TdT)加尾技术 传统的5′RACE反应是以TdT对第一链cDNA进行同聚物加尾来引发第二链cDNA的合成[12] ,这种方法经常会导致RACE反应失败或产生一些副产品。其主要原因是同聚物加尾反应难以控制,TdT 加尾时不能区分cDNA是否是全长,非全长cDNA分子被加尾后将在随后的PCR反应中得到优先扩增,从而产生大量的非特异性产物背景,并且TDT的加尾效率比较低[13]。目前许多研究这对其进行了改进。 夏瑞等[11]提出了一种改良的TDT加尾克隆基因5"端的方法。其首先用1个15 bp左右的特异反转录引物代替通用反转录引物Olig( dT) n对模板cDNA进行初步筛选,使合成的cDNA更靠近目的基因的5′端。其次, 两个上游引物采取巢式策略取代一般的poly( dG)n或poly ( dC)n,从而控制第二轮PCR的退火温度, 保证扩增的特异性。并且在PCR过程中采用了如锚定PCR、巢式PCR、降落PCR等方法增加扩展产物的特异性。这些新的改进使得到目的条带的概论增加,并且反转录引物不需要磷酸化, 从而大大节约实验成本。 2.染色体步移法 染色体步行(chromosome walking)是指由生物基因组或基因组文库中的已知序列出发逐步探知其旁邻的未知序列或与已知序列呈线性关系的目的序列核苷酸组成的方法和过程14]。对于基因组测序已经完成的少数物种(水稻、拟南芥等)来说,可以轻松地从数据库中找到已知序列的侧翼序列。但是这毕竟只是研究少数模式植物时的情况,对于自然界中种类繁多的其植物而言,在不知道它们的基因组DNA序列以前,想要知道一个已知区域两侧的DNA序列,只能采用染色体步移技术。因而,染色体步移技术在现代分子生物学研究中占有举足轻重的地位,是结构基因组研究以及功能基因组研究的基础。 目前,分离侧翼序列的染色体步移方法主要有两种,一是结合基因组文库为主要手段的染色体步移技术,构建基因组文库进行染色体步移尽管步骤比较繁琐,但是适于长距离步移,可以获得代表某一特定染色体的较长连续区段的重叠基因组克隆群。随着亚克隆文库条件构建条件的优化及测序技术的进步,这种方法也将更加快捷,准确。另一个是基于PCR扩增为主要手段的染色体步移技术。基于PCR扩增为主要手段的染色体步移技术步移距离相对较短,但是操作比较简单,尤其适合于已知一段核苷酸序列的情况下进行的染色体步移。反向PCR、外源接头介导PCR和热不对称交错PCR(TAIl-PCR)等就是建立在PCR技术基础上的染色体步行技术,为扩增已知序列旁侧的未知DNA片段提供了捷径.这些方法的建立可以不必经过烦琐的建库和筛选过程而获得全长基因序列. 2.1连接介导PCR 连接介导聚合酶链反应是以连接反应为基础的单侧PCR技术,首先通过基因组DNA酶切,在酶切后的DNA片段的一端连接上一个公共连接子,而后用这个连接子为引物与另一个基因特异引物进行扩增,得到了包含连接子在内的基因序列。连接介导PCR又分为连接载体的PCR、连接单链接头的PCR和连接双链接头PCR。此方法原理简单,操作方便。 2.1.1连接载体的PCR 连接载体的PCR是利用已知基因组DNA序列设计的特异引物和载体通用引物进行扩增获得目的片段的一项PCR技术。操作方法是首先用内切酶酶切基因组DNA和载体质粒DNA,得到小片段DNA和线形字体序列,然后用T4连接酶把载体序列与DNA小片段相连接,以连接产物为模板,以一个基因特异引物和载体引物进行扩展,通过克隆测序得到未知的侧翼序列。 2.1.2连接单链接头的PCR 连接单链接头的PCR又叫锅柄PCR,是连接单链接头PCR的典型代表,因其以一个类似锅柄结构的DNA分子为模板而得名[18]。其基本原理是:将基因组总DNA 用能产生5" 端突出末端的内切酶切割;接着连上一条单链的寡核苷酸,其具有两个特点,其一是5"端和限制性片段的突出末端互补,其二是除此以外的序列必须和已知序列中一段完全同源;在PCR 的复性阶段,外源接头就会和其链内同源序列配对而成一个末端部分封闭的分子内环状结构,在TaqDNA 聚合酶的作用下,沿着3" 端将单链部分完全补平后而形成一个锅柄结构,因此这种方法也被称为锅柄PCR。由于其末端是一个反向重复序列,故最后只需一条引物即可完成对目标区段的扩增。 2.1.3连接双链接头PCR 双链接头法也称为adapter介导的PCR法[ 19,20]。其主要过程为首先用能够产生粘性末端的限制性内切酶消化基因组DNA,然后将末端配对的接头和限制性片段连接,以其作模板,用接头引物和已知序列特异引物进行PCR扩增,即可获得包含侧翼序列的目标片段。显然,这类方法存在一个问题:即如何抑制接头到接头的非目标扩增。因此许多研究者由对其进行了改进,出现了抑制PCR,多功能接头PCR和T接头PCR[21]。 2.2热不对称交错PCR(TAIl-PCR) 热不对称性PCR (thermal asymmetric interlaced PCR, TAIL-PCR)就是建立在PCR技术基础上的染色体步移技术,为扩增已知序列旁侧的未知DNA 片段提供了捷径。该技术由Liu和Whitter于1995年首先研究并报道[22]。以基因组DNA为模板,使用高退火温度的长特异引物和短的低退火温度的简并引物,通过特殊的热不对称(高严谨性PCR和低严谨性PCR交替)循环程序,有效扩增特异产物。该技术具有简单快速、特异性高、分离出的DNA 序列可以用于图位克隆、遗传图谱绘制和直接测序等优点,近年来,被分子生物学研究者广泛应用,成为分子生物学研究中非常实用的基因侧翼序列克隆技术,同时在植物基因克隆方面也取得了很大进展。 TAIL-PCR技术的基本原理是利用目标序列旁的已知序列设计3个嵌套的特异性引物(special prime ,简称sp1 ,sp2 ,sp3 ,约20 bp) ,用它们分别和1个具有低Tm值的短的(14 bp) 随机简并引物(Arbitrary degenerate prime 简称AD)相组合,以基因组DNA作为模板,根据引物的长短和特异性的差异设计不对称的温度循环,通过分级反应来扩增特异引物。 TAIL-PCR包括3轮PCR反应。第1轮PCR反应包括5次高严谨性反应、1次低严谨性反应、10次较低严谨性反应和12次热不对称的超级循环。首先5次高严谨性的反应,使长的高退火温度的特异引物SPl与已知的序列退火并延伸,目标序列扩增成直线性型上升,由AD引物结合产生的非特异性产物的浓度则较低。而后进行1次低退火温度的反应,目的是使简并引物结合到较多的目标序列上,接下来10次较低严谨性的反应可以使两种引物均能与模板退火,从而使原来由高严谨性循环所产生的单链靶DNA复制成双链DNA,为下一轮线性扩增模板做准备。最后是进行12次热不对称的TAIL循环(超级循环即高特异性和低特异性循环交替),目的片段得以指数性地扩增,扩增的量大大超过了非目标片段。经过上述一系列的反应得到了不同浓度的3种类型产物:TAIL-PCR中间会出现3 种类型的产物。类型1是特异引物和任意引物之间扩增的产物(即目标产物;类型2是单独由特异引物扩增的产物;类型3是单独由任意引物引发的产物。该方法由3步连续的PCR扩增过程构成。经过第一阶段的PCR扩增后,类型2产物的分子数目在3种产物中最多,类型1产物稍低。在第二阶段的扩增中,类型1产物的分子数逐渐升至最高,类型2分子数目基本保持不变,而类型3的分子数目仍然保持很低。在第三阶段结束后,基本上只有类型1产物,即目的产物。 TAIL-PCR的技术难点,首先是引物设计,和一般的PCR反应相比,TAIL-PCR反应对引物的要求较高,引物的设计很是重要。特异性引物和简并引物的选择直接影响扩增的效果。特异引物设计:3个嵌套的特异性引物长度一般在20~30 bp之间,Tm 值一般设为58~68℃。SP1、SP2 和SP3之间最好相距100 bp以上以便在电泳时更容易区分3轮PCR产物。简并引物是按照物种普遍存在的蛋白质的保守氨基酸序列设计的,相对较短,长度一般是14 bp左右,Tm值介于30~48℃之间。AD引物是否最佳与它的简并度、引物长度和核苷酸序列组成有很大关系。 目前一些研究这又对TAIL-PCR进行了该进,比如省去了10个中等严谨度的PCR循环,3次PCR循环中的变性时间由5 s延长到了30 s,更有利于DNA彻底解链,第3次循环增加了热不对称交织PCR,更有利于特异目的片段的富集,把较低特异性反应的温度从44℃降到29℃等,以利于更好的扩增目的片段。 3 .RACE技术与染色体步移方的比较 3.1 SMART-RACE与末端脱氧核苷酸转移酶( TdT)加尾技术的比较 SMART-RACE技术是目前一种比较成熟的技术,它能够最大限度地提高在反转录反应中获取全长cDNA的可能,成功率高,可以节约时间并且操作程序简单,但是于价格过于昂贵, 试验成本增加, 而且对RNA质量要求很高。TdT加尾扩增法的优化改良, 成功率和稳定性都得到较大的提高,改良的TdT末端加尾扩增法综合了多项PCR扩增方法如锚定PCR、巢式PCR、降落PCR等, 原理简单易懂, 操作性强,能够满足一般基因克隆的要求。 3.2连接介导PCR与TAIL-PCR的比较 连接介导PCR原理简单,但其需要DNA内酶切酶切,而内酶切又比较昂贵,增加实验的成本。并且酶切的好坏,接头处理方法是否得当而影响接头与DNA小片段的连接效率,从而导致失败。TAIL-PCR不需要进行DNA酶切而直接用DNA做模板进行扩增,仅仅只需要三轮PCR扩增,就可以得到目的条带。简单、特异性高、高灵敏度、快速、不涉及连接反应这就是TAIL-PCR的优点,但是TAIL-PCR也有缺点,主要是TAIL-PCR 反应需要较多的引物组合。此外,由于AD引物存在有限的结合位点,对于个别的侧翼序列,即使使用不同的简并引物也难以扩增到阳性结果。目前已经有学者提出用RAPD的引物替代AD引物的观点,由于RAPD引物数量很多,所以可以解决AD引物存在有限的结合位点的不足。 4.总结 RACE是一种快速、有效的克隆基因全长cDNA的有效方法。基因的3"端通过RACE技术非常容易得到,但是5"端却比较难,即使用比较昂贵的5"端RACE试剂盒也不一定能得结果。而基于PCR扩增的染色体步移法,却有得天独厚的优势,它不仅仅能用于基因全长的获得而且还可以得到基因5"端的启动子序列。模板仅仅只要基因组DNA就行,原理简单易懂,操作方法也简单易行,并且非常的廉价,适用于不同水平和不同层次的研究者。笔者通过TAIL-PCR技术成功得到了芒果LFY基因的全长及其启动子序列。
求大肠杆菌基因序列
大肠杆菌有不同的菌株,其基因组序列是不同的,你可以用准确的菌株名在NCBI的Genome数据库中搜索,以实验室常用的工程大肠杆菌BL21株为例,其基因组的序列和信息在以下链接中非常详细:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome?Db=genome&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=24757其基因组的序列和图片(包括编码区)在这个链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/253322479?report=graph你可以拷贝全部序列,或者部分序列,编码区连氨基酸对应的密码子都标好了,非常方便。其基因组中各个基因的序列在下面这个链接,要那个基因,就点相应的链接(文件大,需耐心等待):http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP001665有什么问题可给我留言。
基因序列比较怎么分析?
看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配!
基因序列和引物序列的关系
PCR一对引物的序列与目的基因中的两段序列(分别为正链与反链)呈互补关系。这种关系看图一目了然,文字半天也说不清楚。请楼主直接搜索PCR原理图片。引物如果冻干状态可以在-20oC保存很久。如果用TE缓冲液溶解后需要分装,仍保存在-20oC,用时取一小支,稀释到使用倍数,避免重复解冻
蛋白质的基因序列和氨基酸序列有什么区别
蛋白质是由氨基酸连接并经过加工在空间中形成不同空间结构才产生具有生物功能的蛋白质。也就是说机体在产生蛋白质前是先通过 机体在一定时间,一定部位选择性的表达特定基因(mRNA),真核生物编码一种氨基酸都对应一个密码子,在rRNA的参与下通过tRNA转录处所要表达的氨基酸,连接成多肽,再在经过编辑,剪切等过程加工成成熟多肽,通过各种细胞器加工,分泌产生成熟蛋白质。即 蛋白质是由对应氨基酸不同排布形成,归根结底都是由基因表达的不同阶段的产物。 这个只是大概的过程 完整的基因表达产生蛋白质的过程是相当的复杂 ,目前有的具体加工过程只是推理换为得到验证,甚至有些过程换有待科学工作者去深入研究。
基因序列是模板链还是编码链
是编码链.用错链对引物设计有影响,因为核苷酸结构不对称,分三端和五端. 所以5"-ATCGXXXXXXXXXXXXXX 和 3‘-ATCGXXXXXXXXXXXXXX是两个不同的引物分子. 引物设计软件都使用编码链,所以楼主不用烦了直接复制粘贴好了哇.
已知某蛋白质的氨基酸序列,如何确定其基因序列?说一下详细的过程
这个不能准确的确定基因序列。因为基因转录成的mRNA上的密码子具有简并性,也就是说多个密码子可以编码同一种氨基酸。比如CUU、CUA、CUG、CUC均编码亮氨酸。反过来,你知道蛋白质序列中有亮氨酸,但你却不知道亮氨酸到底是CUU、CUA、CUG、CUC这四个中谁编码的。所以根据氨基酸序列反推出来的基因序列有很多条。如果真要得到一种基因序列的话就只能先查密码子表推出mRNA,再根据碱基互补配对原则反推出基因的序列,注意mRNA上的U就是基因中的T,它们都与A配对。
已知基因编码怎么查基因序列
基因编码是一些数据库对基因的编号,大家一般使用权威数据库的编号。只要知道基因编码,登录对应的数据库就可以查询基因序列等信息。
如何根据氨基酸序列查询基因序列?
一个就是你直接blast 蛋白序列,找到与你的所需要的那个基因的序列另外就是直接search那个肽链的名字如胸腺肽Thymosin,就会出来结果,找到Homo sapiens,打开就会有一条肽链,看看是不是你需要的,那上面有一个CDS,点就会出来编码的序列
基因序列分析为什么会出现
因为有了DNA测序技术,产生基因序列数据
(基因)和(基因序列)不是一回事吗?
基因是由遗传效应的DNA或者是RNA序列,基因序列相当于是基因中的核酸的排列顺序。欢迎追问
如何使用 NCBI 查找基因序列,mRNA,Promoter
1、在NCBI上查找基因的mRNA序列。2、Messenger RNA (mRNA)——信使核糖核酸信使核糖核酸携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。信使RNA从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA)。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序。mRNA存在于原核生物和真核生物的细胞质及真核细胞的某些细胞器(如线粒体和叶绿体)中。
高中生物,根据氨基酸序列,推断出基因序列,是根据什么原理?
氨基酸有一个或者是多个密码子与之对应!按照这种对应关系即可推理出密码子的序列!而依据转录时DNA的互补配对原则可以推出DNA(基因)序列!注意一个氨基酸序列可能会有多个DNA序列!这是由于密码子的简并(一个氨基酸可能有多个密码子)
如果有一天人真的可以改变基因序列了我们可以利用它来做什么?
如果有一天我们真的能够改变人类身体上的基因序列,那么人类可以用它来做很多的事情,到时候世界会大乱,有好的人自然就有坏的人,有阳光自然就已经有这个技术,如果真的成熟了能用来做好事,自然就能用来做坏事。用来做好事,它可以帮助我们治愈很多身体的疾病我们身体的一切功能都是受到基因的影响的,比如说高度近视会导致的遗传,能够改变基因序列,这就是个很简单的事情,就不会发生各种各样的遗传病了,然后身体的免疫能力,身体的各项心跳指数等生理特征都可以通过基因序列来得到一定的调整,把它调整到人体最适合长寿的那个状态,人体的整体寿命会有一个很大的增长。用来做坏事那就控制不住了我们要知道我们现在身体所拥有的破坏能力,身体的正常状态都是受到基因的控制的,如果我们改变一下某个基因序列,是不是可以让人的肌肉获得更强大的发育,先天性的就是这样,人是不是可以一拳打死一头牛的那种状态,让人的皮肤变得更加坚硬,让人的骨骼变得更加坚硬,拥有更强大的破坏能力,这是个很可怕的,因为这种技术成熟了,就意味着能够改变身体上大部分的基因,能用来做好事,用来做坏事也同样可以。随着技术的进步不可避免带来争议技术到底用来造福人类还是说用来搞破坏,这不是我们所能决定的,因为有好人就有坏人,坏人之中智商高的有能力的也不在少数,不是所有的犯罪分子都像小说中都像电视剧中所表现那样低智商,有很多犯罪分子智商真的非常高的,所以这些东西我们不得不提前思考。
基因序列的方向?
既然已经有了推荐答案,就补充回答几点吧:首先,楼主的问题没有那么混乱的,不要紧张。补充瑜玥的回答:两个基因的编码框有重叠是存在的,无论是同链重叠还是异链重叠。而且个人认为从基因组的大小和进化的角度来看,这也应该是可以存在的。这个在pubmed上可以找到不少文献,不具体说了,给篇综述(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18410680)其次,针对楼主的追问。箭头指代的确实是基因的读取方向。我想楼主不太清楚的地方应该是DNA双链是反向平行的;而RNA的转录合成由于RNA聚合酶的特性,是从3‘到5"端读取DNA,合成的RNA是从5‘到3"。所以说楼主提到的方向问题(3‘-5")没有错,只不过DNA双链反向平行的特性决定了转录RNA的方向有可能不同向。 所以楼主说的“DNA的两条链中有一条是模板链,但是不是说两条链中任何一条链,任何时候都不绝对是模板链,而要看某个基因了,那个基因在那条链上,就以那条链做模板,基因在另一条互补链上,表达的时候就要更换模板”是对的。但其实不存在更换模板的问题,转录开始时RNA聚合酶结合到DNA上的时候方向就选定了(当然这一点好像最近有一些新的进展争议,我的说法不一定严格,但意思应该还是对的),所以不要想像有个什么跳跃更换的过程,两条链是平等的,就是一个选择问题,不存在转录到一半跳到另一条链上之类的事情。 我就不用楼主的“基因序列的方向”这种说法了,既然两条DNA链是反向平行的,那么选择不同的链,转录合成RNA的前进方向也就不同,所以需要用箭头表示出来。在用NCBI、UCSC等基因组浏览器时,在看基因的时候,你也是可以看到箭头的,方向有可能相同,也有可能不同。 回到楼主的pBR22这个质粒,楼主在网上看到解释是对的,只不过个人不太喜欢它的用词。其实基因无所谓在那条链上,实际研究中常用的是“转录方向”,我会说启动子的转录方向和抗性基因的转录方向相反。所以这样看来楼主追问中提到的两种说法表达的意思是一致的。
全球已有超8万个新冠病毒基因序列,“基因序列”指什么?
今年,全球面临着巨大的困难和挑战,因为我们碰到了新冠病毒。这种病毒也是第一次被人们发现,它有着较强的变异性和传播性,目前已在全球蔓延开来,累计确诊新冠患者已达两千多万,累计死亡病例达到81万。形势似乎越来越严峻,甚至产生了毒株变异,疫苗的研发,也显得迫在眉睫。在8月21日,世卫组织举行新冠肺炎例行发布会,世卫组织总干事发表了演讲。一、变异不影响传染性世卫组织卫生部表示,目前全球已有超过八万个新冠病毒基因序列,大部分变异不会影响病毒的传染性和严重性。世卫组织已成立专门工作组,确认不同的变异,并研究其可能对病毒行为产生的影响。并希望可以能在两年之内结束新冠大流行,充分利用包括疫苗在内的抗疫工具。二、什么是基因序列那到底什么是基因序列呢?基因序列是使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。部分DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构,任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。三、疫情前的自我保护俄罗斯是世界上首个正式注册新冠疫苗的国家,但是根据调查显示,准备接种国产新冠疫苗的俄罗斯民众只占四成,不打算接种的居然占到五成,俄罗斯民众对于新冠疫苗的安全性还是比较担忧的。所以当疫苗的安全性还没有完全得到保证的时候,我们更应该做好自我保护。尽量不去人流密集的场所;出门戴口罩,养成勤洗手、多测体温以及给房屋通风的习惯;在居家隔离期间,也要保持适当的锻炼,增强自己的抵抗力。保护好我们自己,其实也是为疫情出了一份力。
如何分析基因序列
1、双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来。 2、多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配。
到底什么是碱基序列 什么是基因序列啊
1.碱基序列:碱基序列通常是指核苷酸序列,包括核糖核酸序列和脱氧核糖核酸序列(即DNA序列和RNA序列)2.基因序列:基因序列是指具有遗传效应的DNA片段.并非所有DNA都是基因.所以基因序列就只是指具有遗传效应的DNA序列(即能翻译出蛋白质的DNA序列)3.基因重组是原有基因的重新组合,并没有产生新基因,而是产生了新的基因型4.基因突变是染色体上某一位点基因上碱基的而改变,突变的结果产生了新的基因(等位基因)5.染色体变异是指染色体结构和数目发生变化
基因序列是什么?
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息 。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列,是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中,一般常用的算法主要有三个:(1) 空位种子片段索引法,首先将读段切分,并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引,再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位,通过轮换种子考虑允许出现错配)的各种可能的位置组合;无论在发育期还是在成人体内,既有大量的新细胞产生,也有大量的旧细胞死亡,这是生物体的一种自然现象。为了维持机体组织中适宜的细胞数量,在细胞分裂和细胞死亡之间需要一种精确的动态平衡。由于这种生成与死亡的有序流程,在胚胎和成人期便维持着人体组织的适宜细胞数量。而这种精密地控制细胞的消亡过程就称为程序性细胞死亡。正常的生命需要细胞分裂以产生新细胞,并且也要有细胞的死亡,由此人体和生物的器官才得以维持平衡。
怎么找基因序列?
据基因的构成原理寻找基因序列,如下:A、C、G和T分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶。每个字母代表一种碱基,两个碱基形成一个碱基对,碱基对的配对规律是固定的,即是:A-T,C-G。典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。关于它的生物功能,则依赖于上下文的序列,一个序列可能被正读,反读;包含编码或者无编码。DNA序列也可能包含“junk DNA”。注:带有遗传讯息的DNA片段称为基因,其他的DNA序列,有些直接以自身构造发挥作用,有些则参与调控遗传讯息的表现。组成简单生命最少要265到350个基因。扩展资料:基因诊断当环境中的有害物质进入受精卵或母体,当父母有一定的共同血缘或有一定相同数目的遗传基因关系,在这些情况下,后代的基因组里的基因会发生缺陷,产生疾病。通过使用基因芯片等技术分析人类基因组,可找出致病的遗传缺陷基因区域。癌症、糖尿病等,都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴测试液,医生们能预测药物对病人的功效,可诊断出药物在治疗过程中的不良反应,还能当场鉴别出病人受到了何种细菌、病毒或其他微生物的感染。利用基因芯片分析遗传基因,将使10年后对糖尿病的确诊率达到50%以上。未来人们在体检时,由搭载基因芯片的诊断机器人对受检者取血,转瞬间体检结果便可以显示在计算机屏幕上。利用基因诊断,医疗将从千篇一律的“大众医疗”的时代,进一步精确到依据个人遗传基因而异的“定制医疗”的时代,也可以抽羊水进行产前基因诊断。参考资料来源:百度百科-DNA序列
什么是基因序列
简单说就是碱基的排列,组合成不同的密码子,再转录成不同的氨基酸,通过氨基酸排列顺序形成不同的蛋白质,组成各种器官和组织
基因序列和编码序列有什么区别
CDS是编码序列Coding sequence的缩写。DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应。CDS是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语。ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。 基本区别(1)开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列;不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。 (2) CDS,是编码一段蛋白产物的序列。 (3) cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。 (4)反之,每个orf不一定都是cds。 希望对您有所帮助
怎么找基因序列?
我一般是在NCBI上面找,世界上有三个大的数据库,NCBI是其中一个,美国的,这个我觉得是最好的。在上边查找基因序列方法是:首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search就行。然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样,寻找你要的基因序列就行了。注意的是,要确定你的基因名称是否是统一的,我以前就是找一个基因费了很多事,之后发现是自己没有用通用的。找到基因序列,蛋白序列就很容易了,因为结果中会显示该基因的蛋白序列。你也可以在开始search的时候选protein,找到的就是蛋白序列了。多尝试就好了,其实很简单,英文不错的话,更简单。要有耐心。只要已经测过序的基因上边都有,而且这是最全的基因库。其他的不用考虑,找不到就只能考虑上边本人的经验。
怎么找基因序列?
我一般是在NCBI上面找,世界上有三个大的数据库,NCBI是其中一个,美国的,这个我觉得是最好的。在上边查找基因序列方法是:首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search就行。然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样,寻找你要的基因序列就行了。注意的是,要确定你的基因名称是否是统一的,我以前就是找一个基因费了很多事,之后发现是自己没有用通用的。找到基因序列,蛋白序列就很容易了,因为结果中会显示该基因的蛋白序列。你也可以在开始search的时候选protein,找到的就是蛋白序列了。多尝试就好了,其实很简单,英文不错的话,更简单。要有耐心。只要已经测过序的基因上边都有,而且这是最全的基因库。其他的不用考虑,找不到就只能考虑上边本人的经验。
基因组序列和基因序列的不同?
基因组序列:包含所有基因组染色体在内的所有DNA序列,不仅仅包含所有的基因序列。按照染色体序号 编写章节。是一本仅仅包含“ATCG”四个字母的天书,看起来很无聊的。。。基因序列:一般是指功能基因的序列,从起始密码子开始到终止密码子结束的一段DNA序列,同样 也只含有“ATCG”四个字母,序列要短小的多。(基因组:含有一套完整遗传信息的集合,即配子的遗传物质,人类基因组包含:22条常染色体+X+Y )
怎么从NCBI上查某个基因序列?
1、打开NCBI百度搜索键入“NCBI”,点击“搜索”,第一个就是官方主页,点击打开。2、关键字查找以H9亚型流感病毒HA基因下载为例,说明详细过程。既然要下载基因序列,需要在栏目内找到“Nucleotide”(核苷酸),搜索栏内填入“Avian influenza virus H9 HA”,点击“search”。3、添加限定词点击搜索后,我们看到页面中间显示了很多关于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列,如果其中的一个符合你的要求,就可以下载。如何不符合的要求,可以继续在搜索条内添加限定,比如添加“2010”,即2010年分离到的病毒。3、序列选定找到目标基因序列后,我们要将其下载下来。以给出第一个序列为例,点击序列前面的“小方格”,将其选定。4、下载序列选定后,点击页面右上角的“Send to”,选择“file”,再将format选择为“FASTA”格式,点击“Create file”,将序列下载到自定的文件夹内。5、用DNAStar打开下载的序列为FASTA格式,需要使用相关的软件打开,小编经常使用的是DNAStar中的Editseq,这个功能还是很强大的。
植物的基因序列
植物基因组通常具有较高的重复序列,且很多为多倍体,因此组装植物基因组具有一定的挑战性。双子叶模式植物拟南芥、单子叶模式植物水稻基因组序列分别在2000年、2005年公布,它们都是基于BAC克隆及sanger法测序的方法获得的,至今在植物基因组序列中其质量依然是最好的。二代测序技术的出现及发展,极大地加快了植物基因组的研究进程,已经有超过200种植物获得了基因组序列,但是由于二代测序读长短,大部分的基因组组装结果都不高,含有数千个scaffolds;虽然基因区相对完整,但是富含转座元件的区域都装得比较碎,且明显低估了这些区域的比例,仅有少部分组装到了染色体水平。近年来,随着三代PacBio、Oxford Nanopore测序技术的发展,可以获得较长的DNA片段,采用一定的组装软件,较为容易获得高质量的组装结果,尤其是在提高序列的完整性及重复序列组装方面有了很大的改善。不过到目前为止,依然只有少数植物基因组组装的完整性较好,contig N50>5Mb的只有6个;另外即使是基于长读长reads得到较长的contigN50(>1Mb),要想获得染色体水平的序列依然是不太容易的。下面,小编通过Nature Plant一篇文献“Chromosome-scale assemblies of plant genomes using nanopore long reads and optical maps”了解下如何通过采用三代测序加上optical maps、Illumina二代数据及遗传图谱的策略获得染色体级别的植物基因组序列吧。组装结果文章研究了三个物种,分别为双子叶芸薹属的B. rapa(yellow sarson,Z1),B.oleracea(broccoli, HDEM)及单子叶芭蕉属的Musa schizocarpa(banana),这3个物种B.rapa Chiifu、B. oleracea To1000、Musa acuminate Pahang-HD曾采用short-reads策略获得了基因组序列,不过序列多为片段化(contig N50<50kb)。
基因序列的特征
双链,双螺旋,碱基互补配对
如何得到已知蛋白序列的对应的基因序列
到这个网页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed在靠近最上方的下拉箭头,点击,选中Gene。然后在右侧的空格处输入基因的名称(英文). 点回车就可以了。会得到好几个结果,属于不同物种,人的是[Homo sapiens(human)]
基因序列
>guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3 (GUCY1A3)atgttctgcacgaagctcaaggatctcaagatcacaggagagtgtcctttctccttactggcaccaggtcaagttcctaacgagtcttcagaggaggcagcaggaagctcagagagctgcaaagcaaccgtgcccatctgtcaagacattcctgagaagaacatacaagaaagtcttcctcaaagaaaaaccagtcggagccgagtctatcttcacactttggcagagagtatttgcaaactgattttcccagagtttgaacggctgaatgttgcacttcagagaacattggcaaagcacaaaataaaagaaagcaggaaatctttggaaagagaagactttgaaaaaacaattgcagagcaagcagttgcagcaggagttccagtggaggttatcaaagaatctcttggtgaagaggtttttaaaatatgttacgaggaagatgaaaacatccttggggtggttggaggcacccttaaagattttttaaacagcttcagtacccttctgaaacagagcagccattgccaagaagcaggaaaaaggggcaggcttgaggacgcctccattctatgcctggataaggaggatgattttctacatgtttactacttcttccctaagagaaccacctccctgattcttcccggcatcataaaggcagctgctcacgtattatatgaaacggaagtggaagtgtcgttaatgcctccctgcttccataatgattgcagcgagtttgtgaatcagccctacttgttgtactccgttcacatgaaaagcaccaagccatccctgtcccccagcaaaccccagtcctcgctggtgattcccacatcgctattctgcaagacatttccattccatttcatgtttgacaaagatatgacaattctgcaatttggcaatggcatcagaaggctgatgaacaggagagactttcaaggaaagcctaattttgaagaatactttgaaattctgactccaaaaatcaaccagacgtttagcgggatcatgactatgttgaatatgcagtttgttgtacgagtgaggagatgggacaactctgtgaaaaaatcttcaagggttatggacctcaaaggccaaatgatctacattgttgaatccagtgcaatcttgtttttggggtcaccctgtgtggacagattagaagattttacaggacgagggctctacctctcagacatcccaattcacaatgcactgagggatgtggtcttaataggggaacaagcccgagctcaagatggcctgaagaagaggctggggaagctgaaggctacccttgagcaagcccaccaagccctggaggaggagaagaaaaagacagtagaccttctgtgctccatatttccctgtgaggttgctcagcagctgtggcaagggcaagttgtgcaagccaagaagttcagtaatgtcaccatgctcttctcagacatcgttgggttcactgccatctgctcccagtgctcaccgctgcaggtcatcaccatgctcaatgcactgtacactcgcttcgaccagcagtgtggagagctggatgtctacaaggtggagaccattggcgatgcctattgtgtagctgggggattacacaaagagagtgatactcatgctgttcagatagcgctgatggccctgaagatgatggagctctctgatgaagttatgtctccccatggagaacctatcaagatgcgaattggactgcactctggatcagtttttgctggcgtcgttggagttaaaatgccccgttactgtctttttggaaacaatgtcactctggctaacaaatttgagtcctgcagtgtaccacgaaaaatcaatgtcagcccaacaacttacagattactcaaagactgtcctggtttcgtgtttacccctcgatcaagggaggaacttccaccaaacttccctagtgaaatccccggaatctgccattttctggatgcttaccaacaaggaacaaactcaaaaccatgcttccaaaagaaagatgtggaagatggcaatgccaattttttaggcaaagcatcaggaatagattag>guanylate cyclase 1, soluble, beta 3 (GUCY1B3)atgtacggatttgtgaatcacgccctggagttgctggtgatccgcaattacggccccgaggtgtgggaagacatcaaaaaagaggcacagttagatgaagaaggacagtttcttgtcagaataatatatgatgactccaaaacttatgatttggttgctgctgcaagcaaagtcctcaatctcaatgctggagaaatcctccaaatgtttgggaagatgtttttcgtcttttgccaagaatctggttatgatacaatcttgcgtgtcctgggctctaatgtcagagaatttctacagaaccttgatgctctgcacgaccaccttgctaccatctacccaggaatgcgtgcaccttcctttaggtgcactgatgcagaaaagggcaaaggactcattttgcactactactcagagagagaaggacttcaggatattgtcattggaatcatcaaaacagtggcacaacaaatccatggcactgaaatagacatgaaggttattcagcaaagaaatgaagaatgtgatcatactcaatttttaattgaagaaaaagagtcaaaagaagaggatttttatgaagatcttgacagatttgaagaaaatggtacccaggaatcacgcatcagcccatatacattctgcaaagcttttccttttcatataatatttgaccgggacctagtggtcactcagtgtggcaatgctatatacagagttctcccccagctccagcctgggaattgcagccttctgtctgtcttctcgctggttcgtcctcatattgatattagtttccatgggatcctttctcacatcaatactgtttttgtattgagaagcaaggaaggattgttggatgtggagaaattagaatgtgaggatgaactgactgggactgagatcagctgcttacgtctcaagggtcaaatgatctacttacctgaagcagatagcatactttttctatgttcaccaagtgtcatgaacctggacgatttgacaaggagagggctgtatctaagtgacatccctctgcatgatgccacgcgcgatcttgttcttttgggagaacaatttagagaggaatacaaactcacccaagaactggaaatcctcactgacaggctacagctcacgttaagagccctggaagatgaaaagaaaaagacagacacattgctgtattctgtccttcctccgtctgttgccaatgagctgcggcacaagcgtccagtgcctgccaaaagatatgacaatgtgaccatcctctttagtggcattgtgggcttcaatgctttctgtagcaagcatgcatctggagaaggagccatgaagatcgtcaacctcctcaacgacctctacaccagatttgacacactgactgattcccggaaaaacccatttgtttataaggtggagactgttggtgacaagtatatgacagtgagtggtttaccagagccatgcattcaccatgcacgatccatctgccacctggccttggacatgatggaaattgctggccaggttcaagtagatggtgaatctgttcagataacaatagggatacacactggagaggtagttacaggtgtcataggacagcggatgcctcgatactgtctttttgggaatactgtcaacctcacaagccgaacagaaaccacaggagaaaagggaaaaataaatgtgtctgaatatacatacagatgtcttatgtctccagaaaattcagatccacaattccacttggagcacagaggcccagtgtccatgaagggcaaaaaagaaccaatgcaagtttggtttctatccagaaaaaatacaggaacagaggaaacaaagcaggatgatgactga建议你去ncbi上自己看看,找找。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=retrieve&dopt=full_report&list_uids=2982&log$=databasead&logdbfrom=nuccorehttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=retrieve&dopt=full_report&list_uids=2983&log$=databasead&logdbfrom=nuccore
ncbi数据库怎么查找基因序列
在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和completecds序列的结果都可以,如下点击进入序...
16S rRNA基因序列是什么
16S rRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。16S rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长(包含约50个功能域)。随着PCR技术的出现及核酸研究技术的不断完善,16S rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具。数据库的不断完善,应用该技术可以实现对病原菌进行快速、微量、准确简便地分类鉴定和检测。该技术主要有三个步骤:首先是基因组DNA的获得,其次是16S rRNA基因片段的获得,最后是进行16S rRNA基因序列的分析。16S RNA 即 16S ribosomal RNA,是原核核糖体30S小亚基的组成部分。16S中的"S"是一个沉降系数,亦即反映生物大分子在离心场中向下沉降速度的一个指标,值越高,说明分子越大。16S rRNA具有多项功能。1.对于核糖体蛋白的固定起到脚手架的作用。2.3"末端包含反向的SD序列,用来与mRNA的AUG起始密码子结合。16S rRNA的3"端与S1、S21的结合被发现与蛋白质合成的开始有关系。3.与23S进行交互,帮助两个核糖体子单元的结合。(50S+30S)4.在A site 稳定密码子与反密码子的正确配对。
基因序列和碱基序列有什么不同
碱基序列通常是指核苷酸序列,包括核糖核酸序列和脱氧核糖核酸序列(即DNA序列和RNA序列)DNA序列就是指DNA链的脱氧核糖核苷酸的排列顺序基因是指具有遗传效应的DNA片段。并非所有DNA都是基因。所以基因序列就只是指具有遗传效应的DNA序列(即能翻译出蛋白质的DNA序列)
基因序列是dna序列还是rna
严格意义上来说,基因序列是具有遗传效应的DNA序列。但有部分RNA病毒,其遗传物质是RNA,此时的基因序列又可以看作是RNA序列。
通常说的DNA序列和基因序列是同一回事吗?
个人觉得不是哦!基因是指携带有遗传信息的DNA或RNA序列,是控制性状的基本遗传单位。所以DNA序列属于基因序列的一部分咯!!呵呵,,,小弟愚见
基因序列是什么
基因序列就是使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。基因序列中的字母只有四种,即A、C、G、T,分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶,任意长度大于4的一串核苷酸被称做一个序列,每个字母代表一种碱基,两个碱基形成一个碱基对,碱基对的配对规律是固定的,即A-T,C-G。
怎么找基因序列?
据基因的构成原理寻找基因序列,如下:A、C、G和T分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶。每个字母代表一种碱基,两个碱基形成一个碱基对,碱基对的配对规律是固定的,即是:A-T,C-G。典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。关于它的生物功能,则依赖于上下文的序列,一个序列可能被正读,反读;包含编码或者无编码。DNA序列也可能包含“junk DNA”。注:带有遗传讯息的DNA片段称为基因,其他的DNA序列,有些直接以自身构造发挥作用,有些则参与调控遗传讯息的表现。组成简单生命最少要265到350个基因。扩展资料:基因诊断当环境中的有害物质进入受精卵或母体,当父母有一定的共同血缘或有一定相同数目的遗传基因关系,在这些情况下,后代的基因组里的基因会发生缺陷,产生疾病。通过使用基因芯片等技术分析人类基因组,可找出致病的遗传缺陷基因区域。癌症、糖尿病等,都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴测试液,医生们能预测药物对病人的功效,可诊断出药物在治疗过程中的不良反应,还能当场鉴别出病人受到了何种细菌、病毒或其他微生物的感染。利用基因芯片分析遗传基因,将使10年后对糖尿病的确诊率达到50%以上。未来人们在体检时,由搭载基因芯片的诊断机器人对受检者取血,转瞬间体检结果便可以显示在计算机屏幕上。利用基因诊断,医疗将从千篇一律的“大众医疗”的时代,进一步精确到依据个人遗传基因而异的“定制医疗”的时代,也可以抽羊水进行产前基因诊断。参考资料来源:百度百科-DNA序列
碱基序列和DNA序列和基因序列有什么不同
碱基序列和DNA序列和基因序列有什么不同碱基序列通常是指核苷酸序列,包括核糖核酸序列和脱氧核糖核酸序列(即DNA序列和RNA序列)DNA序列就是指DNA链的脱氧核糖核苷酸的排列顺序基因是指具有遗传效应的DNA片段.并非所有DNA都是基因.所以基因序列就只是指具有遗传效应的DNA序列(即能翻译出蛋白质的DNA序列)