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数量性状基因座和遗传标记的关系

2023-06-30 08:50:04
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数量性状基因定位的原理及方法

随着现代分子生物学的发展和分子标记技术的成熟 ,已经可以构建各种作物

的分子标记连锁图谱 .基于作物的分子的标记连锁图谱 ,采用近年来发展的数量性

状基因位点 (QTL)的定位分析方法,可以估算数量性状的基因位点树目、位置和

遗传效应。本文介绍了数量性状基因定位的原理以及分析方法。 每一种方法都有

自己的优点,但也存在相应的缺陷。

1 数量性状基因定位的原理

孟德尔遗传学分析非等位基因间连锁关系的基本方法是, 首先根据个体表现

型进行分组, 然后根据各组间的比例, 检验非等位基因间是否存在连锁, 并估计

重组率。 QTL 定位实质上就是分析分子标记与 QTL 之间的连锁关系,其基本原

理仍然是对个体进行分组,但这种分组是不完全的。

2 数量性状基因定位的方法

自然界存在生物个体的性状、品质等多为数量性状,它们受多基因的控制,

也易受环境影响。。多基因及环境的共同作用结果使得数量性状表现为连续变异 ,

基因型与表现型间的对应关系也难以确定。因此 ,长期以来 ,科学工作者只是借助

数理统计方法 ,将复杂的多基因系统作为一个整体 ,用平均值和方差来表示数量性

状的遗传特征 ,而对单个基因的效应及位置、 基因间的相互作用等无法深入了解 ,

从而限制了育种中数量性状的遗传操作能力。 20 世纪 80 年代以来发展的分子

标记技术为深入研究数量性状的遗传规律及其操作创造了条件 , 提高了植物育

种中目标数量性状优良基因型选择的可能性、 准确性及预见性。 下面主要介绍了

几种定位方法。

2.1 QTL 定位方法

连锁是 QTL 定位的遗传基础。 QTL 定位是通过数量性状观察值与标记间的

关联分析 ,即当标记与特定性状连锁时 ,不同标记基因型个体的表型值存在显著差

异,来确定各个数量性状位点在染色体上的位置、 效应, 甚至各个 QTL 间的相

关作用。因此 , QTL 定位实质上也就是基于一个特定模型的遗传假设 , 是统计学

上的一个概念 , 有可信度 (如 99% , 95%等) ,与数量性状基因有本质区别 ( 图 1)。

本文就目前主要应用的 QTL 定位方法的特点进行分述。

数量性状基因 环境 表型 特定模型 数量性状位点

图 1 QTL 与数量性状基因的关系

2. 2 区间作图法 ( interval mapping, IM)

Lander和 Botstein( 1989) 等提出 ,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基

因型变量的线性模型的基础上 , 利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意

一点可能存在的 QTL 进行似然比检测 ,进而获得其效应的极大似然估计。 其遗传

假设是 ,数量性状遗传变异只受一对基因控制 ,表型变异受遗传效应 ( 固定效应 )

和剩余误差 ( 随机效应 ) 控制,不存在基因型与环境的互作。 区间作图法可以估算

QTL 加性和显性效应值。 与单标记分析法相比 ,区间作图法具有以下特点 :能从支

撑区间推断 QTL 的可能位置 ;可利用标记连锁图在全染色体组系统地搜索 QTL,

如果一条染色体上只有一个 QTL,则 QTL 的位置和效应估计趋于渐进无偏 ; QTL

检测所需的个体数大大减少。但 IM 也存在不足 :回归效应为固定效应 ;无法估算

基因型与环境间的互作 (Q E) , 无法检测复杂的遗传效应 ( 如上位效应等 ) ;当相

邻 QTLs 相 距较 近时 , 由于 其作 图精度不 高 , QTLs 间相 互干 扰导 致 出 现

GhostQTL;一次只应用两个标记进行检查 , 效率很低。

2. 3 复合区间作图法 ( composite interval mapping, CIM)

CIM 是 Zeng( 1994)提出的结合了区间作图和多元回归特点的一种 QTL 作

图方法。其遗传假定是 ,数量性状受多基因控制。该方法中拟合了其他遗传标记 ,

即在对某一特定标记区间进行检测时 , 将与其他 QTL 连锁的标记也拟合在模型

中以控制背景遗传效应。 CIM 主要优点是 :由于仍采用 QTL 似然图来显示 QTL

的可能位置及显著程度 , 从而保证了 IM 作图法的优点 ;假如不存在上位性和

QTL 与环境互作 , QTL 的位置和效应的估计是渐进无偏的 ;以所选择的多个标记

为条件 (即进行的是区间检测 ) ,在较大程度上控制了背景遗传效应 ,从而提高了作

图的精度和效率。存在的不足是 :由于将两侧标记用作区间作图 ,对相邻标记区间

的 QTL 估计会引起偏离 ;同 IM 一样, 将回归效应视为固定效应 , 不能分析基因

型与环境的互作及复杂的遗传效应 (如上位效应等 ) ;当标记密度过大时 ,很难选择

标记的条件因子。

2.4 基 于 混 合 线 性 模 型 的 复 合 区 间 作 图 法 (mixed composite interval

mapping,MCIM)

朱军( 1998)提出了用随机效应的预测方法获得基因型效应及基因型与环境

互作效应 ,然后再用区间作图法或复合区间作图法进行遗传主效应及基因型与环

境互作效应的 QTL 定位分析。该方法的遗传假定是数量性状受多基因控制 ,它将

群体均值及 QTL 的各项遗传效应看作为固定效应 , 而将环境、 QTL 与环境、

分子标记等效应看为随机效应。由于 MCIM 将效应值估计和定位分析相结合 ,

既可无偏地分析 QTL 与环境的互作效应 ,又提高了作图的精度和效率。此外该模

型可以扩展到分析具有加 加、 加 显、 显 显上位的各种遗传主效应及其与

环境互作效应的 QTL。利用这些效应值的估计 , 可预测基于 QTL 主效应的普通

杂种优势和基于 QTL 与环境互作效应的互作杂种优势 ,因其具有广阔的应用前

景。

2. 5 其他 QTL 定位方法

主要有 Bayesian 作图 法、 双侧标记 回归法 ( flanking marker regression

analysis, FMRA) 、轮回选择回交定位法 ( recurrent selection and backcrossing,

RSB)、 多亲本作图法等。 Bayesian作图法 ( Satagopan et al , 1996) 亦是基于线性

模型作图方法 ,其过程是先推测 QTL 个数,再依据 Bayes因子决定最可能的 QTL

个数。它不仅可以用于普通数量性状的 QTL 定位 ,亦可定位复杂的二元性状

( binary trai t) (Yi and Xu, 2000) 。FMRA( Haley and Knott, 1992) 是应用回归方法 ,

搜索在全染色体组上任何两个标记间是否存在 QTL 并确定其最可能的位置和效

应。这一方法最大的优点是计算简单 ,所得结果与 IM 法的结果基本相同。轮回

选择在植物遗传改良中具有十分重要的作用。 RSB 定位法就是利用轮回选择构

建群体 ,充分发挥高密度分子标记连锁图及 QTL 与其附近标记不断重组的优势 ,

分解复的数量性状遗传结构 ,将 QTL 定位在 1 cM 之内。因此, 其 QTL 定位效率

及精度比 IM 及其衍生方法更高 ( Luo et al , 2002) 。多亲本作图法 ( Xu, 1998)是

IM 法在多亲本杂交群体中 QTL 定位分析的推广 , 它克服了其他作图方法中仅

限于利用在一个或几个性状上存在较大遗传差异的两个亲本的缺点 , 充分利用

了自然基因资源 ,并且对其他性状亦可进行有效检测。但利用这一模型必须解决

以下两个问题 :不同杂交组合的多态性位点的可能不一致性及同样的两个标记在

不同的组合间遗传距离可能也不相同。

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2020-8-6

为什么没有完备区间作图(ICIM)

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奇石珠宝真君

数量性状基因, 遗传标记, 重组值, 基因连锁, 酸性磷酸酯酶, 酵母pho80基因, 基因表达调控 key words: yeast pho80 gene acid phosphatase ...

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遗传标记名词解释是什么?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。也有用着丝粒作为遗传标记的。形态学标记:形态标记是指肉眼可见的或仪器测量动物的外部特征,以这种形态性状、生理性状及生态地理分布等待征为遗传标记,研究物种间的关系、分类和鉴定。形态学标记研究物种是基于个体性状描述,得到的结论往往不够完善,且数量性状很难剔除环境的影响,需生物统计学知识进行严密的分析。但是用直观的标记研究质量性状的遗传显得更简单、更方便。此法仍是一种有效手段并发挥着重要作用。以上内容参考:百度百科——遗传标记
2023-06-29 08:51:151

什么是遗传标记?请比较形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记的优缺点。

【答案】:遗传标记指能够稳定遗传的、易于识别的等位性基因位点的遗传多态性形式。遗传标记包括形态标记、细胞学标记、生化标记和分子标记等。形态标记是指用肉眼能够直接观察到的一些表型特征,其优点是简单直观,经济方便,容易观察记载。其缺点是形态标记的数量少,可以直接鉴别的形态标记有限,同时许多形态标记还受到环境、生育期、基因的显隐性关系以及基因互作等影响。细胞学标记是指由于染色体数目和结构的变异从而会引起生物的某些表型性状的异常,另外,染色体核型和带型分析同样可以用来测定基因所在的染色体及相对位置,它们都可以作为一个标记来进行遗传和基因定位研究。其优点是能够直接在细胞学水平上观察染色体数目和结构的变化,缺点是细胞学标记需要花费较大的人力和较长的时间来培育,同时很多物种由于染色体数目和结构变异导致其对环境的适应能力较差,如发育不良或育性较差等而难以较好的保存材料。生化标记主要包括贮藏蛋白和同功酶标记,其差异是由决定酶蛋白本身的等位基因的差异造成的,因此同功酶的谱带的差异分析实质上是对编码该蛋白等位基因位点的分析。其优点是共显性标记,其结果是直接反应基因的差异,受环境影响较小,但其具有组织和发育的特异性等条件限制。分子标记能直接反应基因组DNA上的差异,其特点是无表型效应,以DNA形式表现,不受组织、发育和环境条件的影响;共显性标记;数量多至无限;多态性高;中性标记,且标记之间不存在互作等干扰,从而广泛应用于遗传图谱的构建、基因发掘和定位、基因克隆、种质资源与进化以及育种等诸多领域。其缺点需要抽提DNA检测,涉及到仪器设备较多,且费用较高。
2023-06-29 08:51:281

遗传标记

遗传标记 Genetic Marker遗传标记的定义 遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。 遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。 遗传标记包括形态学标记(morphological marker)、细胞学标记(cytological marker)、生物化学标记(biochemical marker)、免疫学标记(Immune Genetic Markers)和分子标记(molecular marker)五种类型。遗传标记的发展 自从19世纪中期,奥地利学者孟德尔首创了将形态学性状作为遗传标记的应用先例以来,遗传标记得到发展和丰富。形态学标记、细胞学标记、生化标记、免疫学标记等一直被广泛应用,然而这些标记都无法直接反映遗传物质的特征,仅是遗传物质的间接反映,且易受环境的影响,因此具有很大的局限性。DNA作为遗传物质的载体,是研究动物遗传特性的一个重要指标。20世纪80年代以来,随着分子生物学技术和分子遗传学的迅速发展,分子克隆及DNA重组技术的日趋完善,研究者对基因结构和功能研究的进一步深入,在分子水平上寻找DNA的多态性,以此为标记进行各种遗传分析。DNA分子标记直接反映DNA水平上的遗传变异,能稳定遗传,信息量大,可靠性高,消除了环境影响。DNA水平的遗传标记自产生以来得到广泛应用。遗传标记的种类◆形态学标记 (Morphological Markers) 形态标记是指肉眼可见的或仪器测量动物的外部特征 (如毛色、体型、外形、皮肤结构等),以这种形态性状、生理性状及生态地理分布等待征为遗传标记,研究物种间的关系、分类和鉴定。形态学标记研究物种是基于个体性状描述,得到的结论往往不够完善,且数量性状很难剔除环境的影响,需生物统计学知识进行严密的分析。但是用直观的标记研究质量性状的遗传显得更简单、更方便。目前此法仍是一种有效手段并发挥着重要作用。◆细胞学标记 (Cytological Genetic Markers ) 细胞遗传标记是指对处理过的动物个体染色体数目和形态进行分析,主要包括:染色体核型和带型及缺失、重复、易位、倒位等。一个物种的核型特征即染色体数目、形态及行为的稳定是相对的,故可作为一种遗传标记来测定基因所在的染色体及在染色体上的相对位置,染色体是遗传物质的载体,是基因的携带者,染色体变异必然会导致生物体发生遗传变异,是遗传变异的重要来源。通过比较动物与其近缘祖先的染色体数目和结构,追溯动物的起源和演化,检测动物的遗传特性,为动物育种提供较好的方法。◆生物化学标记 (Biochemical Genetic Markers ) 生化遗传标记是以动物体内的某些生化性状为遗传标记,主要指血型、血清蛋白及同工酶。 20世纪60年代以来,蛋白电泳技术作为检测遗传特性的一种主要方法得到了广泛的应用。蛋白电泳所检测的主要是血浆和血细胞中可溶性蛋白和同工酶中氨基酸的变化,通过对一系列蛋白和同工酶的检测,就可为动物品种内的遗传变异和品种间的亲缘关系提供有用的信息川。但是,蛋白和同工酶都是基因的表达产物,非遗传物质本身,它们的表现易受环境和发育状况的影响;这些因素决定了蛋白电泳具有一定的局限性,但是蛋白电泳技术操作简便、快速及检测费用相对较低,日前仍是遗传特性研究中应用较多的方法之一。生化遗传标记经济、方便,且多态性比形态学标记和细胞遗传标记丰富。已被广泛应用于物种起源与分类研究和动物育种中。◆免疫学标记 (Immune Genetic Markers) 免疫学标记是以动物的免疫学特征为遗传标记,主要指:红细胞抗原、白细胞抗原、胸腺细胞抗原等。早在1900年,Ehrlich和Morgenroth指出山羊红细胞表面存在抗原,并证明这些抗原具有个体差异;20世纪80年代初,人们转向白细胞抗原的研究,即主要组织相容性复合体(MHC), MHC的重要特性与疾病及生理性状具有重要关系。根据动物个体淋巴细胞抗原特异性,研究品种间、个体间、抗病力强弱的差异及亲子关系等。◆分子标记 (Molecular Genetic Markers) 分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态标记、同工酶标记、细胞标记相比,DNA 分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的农艺性状的选择十分便利;基因组变异极其丰富,分子标记的数量几乎是无限的;在生物发育的不同阶段,不同组织的 DNA 都可用于标记分析;分子标记揭示来自 DNA 的变异;表现为中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无连锁;检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展,现在 DNA 分子标记技术已有数十种,广泛应用于作物遗传育种、基因组作图、基因定位、植物亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。图片为AFLP (扩增片段长度多态性,Amplified Fragment Length Polymorphism,一种分子标记) 的银染检测结果
2023-06-29 08:51:351

遗传标记和分子标记有哪些相同概念?

遗传标记(genetic:markers)是研究生物遗传变异规律及其物质基础的重要手段,是指可追踪染色体、染色体某一节段或者某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。长期以来,遗传育种学家通过各种宏观或微观的遗传标记来研究生物的遗传和变异现象,揭示其内在的规律,并以此指导或辅助动植物育种,取得了丰硕的成果。遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征,在经典遗传学中,遗传多态性是指等位基因的变异。在现代遗传学中,遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异,是指可追踪或鉴别的染色体、染色体某一节段、某个基因座位(locus)在家系中传递的易于识别的而且是可遗传的实体。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。
2023-06-29 08:51:421

遗传作图的分子标记有哪些

遗传作图的分子标记有基因标记和DNA标记。具体如下:1、基因标记在经典遗传学中,研究一种性状的遗传必须要求同一性状至少2种不同的存在形式或称表型。起初只有那些能通过视觉区分的基因表型用于研究。2、DNA标记基因之外的作图工具统称为DNA标记。与基因标记一样,DNA标记必须有至少两个等位基因才是有用的。有三种类型的DNA序列特征可以满足这一要求:限制性片段长度多态性、简单序列长度多态性、单核苷酸多态性。
2023-06-29 08:51:491

细胞遗传标记包括什么?

细胞遗传标记是遗传标记的一种,指对处理过的动物个体染色体数目和形态进行分析,主要包括:染色体核型和带型及缺失、重复、易位、倒位等。一个物种的核型特征即染色体数目、形态及行为的稳定是相对的,故可作为一种遗传标记来测定基因所在的染色体及在染色体上的相对位置,染色体是遗传物质的载体,是基因的携带者,染色体变异必然会导致生物体发生遗传变异,是遗传变异的重要来源。通过比较动物与其近缘祖先的染色体数目和结构,追溯动物的起源和演化,检测动物的遗传特性,为动物育种提供较好的方法。
2023-06-29 08:51:561

遗传标记有几个特征?

遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。
2023-06-29 08:52:041

基因的遗传标记主要有哪几种类型?

遗传标记主要有4种类型,即形态标记(morphological:markers)、细胞学标记(cytological:markers)、生化标记(biochemical:markers)和分子标记(molecular:markers)四种类型。在植物遗传育种研究中可被利用的遗传标记应具备以下几个条件:①多态性高;②遗传稳定,表现共显性;③对农艺性状影响小;④能检测整个基因组;⑤经济方便,容易观察记载。
2023-06-29 08:52:111

在人类基因组中有哪些遗传标记?用它们能为科研和应用做什么服务?

遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记 和分子标记五种类型。形态学标记 形态标记是指肉眼可见的或仪器测量动物的外部特征 (如毛色、体型、外形、皮肤结构等),以这种形态性状、生理性状及生态地理分布等待征为遗传标记,研究物种间的关系、分类和鉴定。形态学标记研究物种是基于个体性状描述,得到的结论往往不够完善,且数量性状很难剔除环境的影响,需生物统计学知识进行严密的分析。但是用直观的标记研究质量性状的遗传显得更简单、更方便。目前此法仍是一种有效手段并发挥着重要作用。 细胞学标记 细胞遗传标记是指对处理过的动物个体染色体数目和形态进行分析,主要包括:染色体核型和带型及缺失、重复、易位、倒位等。一个物种的核型特征即染色体数目、形态及行为的稳定是相对的,故可作为一种遗传标记来测定基因所在的染色体及在染色体上的相对位置,染色体是遗传物质的载体,是基因的携带者,染色体变异必然会导致生物体发生遗传变异,是遗传变异的重要来源。通过比较动物与其近缘祖先的染色体数目和结构,追溯动物的起源和演化,检测动物的遗传特性,为动物育种提供较好的方法。 生物化学标记 生化遗传标记是以动物体内的某些生化性状为遗传标记,主要指血型、血清蛋白及同工酶。 20世纪60年代以来,蛋白电泳技术作为检测遗传特性的一种主要方法得到了广泛的应用。蛋白电泳所检测的主要是血浆和血细胞中可溶性蛋白和同工酶中氨基酸的变化,通过对一系列蛋白和同工酶的检测,就可为动物品种内的遗传变异和品种间的亲缘关系提供有用的信息川。但是,蛋白和同工酶都是基因的表达产物,非遗传物质本身,它们的表现易受环境和发育状况的影响;这些因素决定了蛋白电泳具有一定的局限性,但是蛋白电泳技术操作简便、快速及检测费用相对较低,日前仍是遗传特性研究中应用较多的方法之一。生化遗传标记经济、方便,且多态性比形态学标记和细胞遗传标记丰富。已被广泛应用于物种起源与分类研究和动物育种中。 免疫学标记 免疫学标记是以动物的免疫学特征为遗传标记,主要指:红细胞抗原、白细胞抗原、胸腺细胞抗原等。早在1900年,Ehrlich和Morgenroth指出山羊红细胞表面存在抗原,并证明这些抗原具有个体差异;20世纪80年代初,人们转向白细胞抗原的研究,即主要组织相容性复合体(MHC), MHC的重要特性与疾病及生理性状具有重要关系。根据动物个体淋巴细胞抗原特异性,研究品种间、个体间、抗病力强弱的差异及亲子关系等。 分子标记 分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态标记、同工酶标记、细胞标记相比,DNA 分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的农艺性状的选择十分便利;基因组变异极其丰富,分子标记的数量几乎是无限的;在生物发育的不同阶段,不同组织的 DNA 都可用于标记分析;分子标记揭示来自 DNA 的变异;表现为中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无连锁;检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展,现在 DNA 分子标记技术已有数十种,广泛应用于作物遗传育种、基因组作图、基因定位、植物亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。 态学标记、细胞学标记、生化标记、免疫学标记等一直被广泛应用,然而这些标记都无法直接反映遗传物质的特征,仅是遗传物质的间接反映,且易受环境的影响,因此具有很大的局限性。DNA作为遗传物质的载体,是研究动物遗传特性的一个重要指标。20世纪80年代以来,随着分子生物学技术和分子遗传学的迅速发展,分子克隆及DNA重组技术的日趋完善,研究者对基因结构和功能研究的进一步深入,在分子水平上寻找DNA的多态性,以此为标记进行各种遗传分析。DNA分子标记直接反映DNA水平上的遗传变异,能稳定遗传,信息量大,可靠性高,消除了环境影响。DNA水平的遗传标记自产生以来得到广泛应用。通过对DNA的研究,对于单基因病,采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新思路,导致了亨廷顿舞蹈病、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。对于心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性痴呆、精神分裂症)、自身免疫性疾病等多基因疾病是目前疾病基因研究的重点。基因诊断、基因治疗和基于基因组知识的治疗、基于基因组信息的疾病预防、疾病易感基因的识别、风险人群生活方式、环境因子的干预都是DNA为我们的医学事业所做出的贡献。
2023-06-29 08:52:224

遗传标记的特点及应用

遗传学中通常将可识别的等位基因称为遗传标记。包括(1)形态标记:是指那些能够明确显示遗传多态的外观性状,如株高、粒色等的相对差异。(2)细胞学标记:是指能够明确显示遗传多态的细胞学特征。如染色体结构上和数量上的遗传多态性等。(3)蛋白质标记:非酶蛋白质和酶蛋白质。在非酶蛋白质中,用得较多的是种子贮藏蛋白;酶蛋白质主要是同功酶。(4)DNA标记:也称也称DNA多态性标记、DNA分子标记,是DNA水平上遗传多态性的直接反映。
2023-06-29 08:52:291

遗传标记的种类

分子标记(Molecular Genetic Markers)是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态标记、同工酶标记、细胞标记相比,DNA 分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的农艺性状的选择十分便利;基因组变异极其丰富,分子标记的数量几乎是无限的;在生物发育的不同阶段,不同组织的 DNA 都可用于标记分析;分子标记揭示来自 DNA 的变异;表现为中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无连锁;检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展,现在 DNA 分子标记技术已有数十种,广泛应用于作物遗传育种、基因组作图、基因定位、植物亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。
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20世纪80年代以来,DNA分子标记技术被广泛用于植物的遗传多样性和遗传关系研究。相对其他标记类型来说,DNA分子标记是一种较为理想的遗传标记类型,其原因包括:(1)核苷酸序列变异一般在选择上是中性的,至少对非编码区域是这样;(2)由于直接检测的是DNA序列,标记本身不存在基因型与环境互作;(3)植物细胞中存在三种基因组类型(核基因组、叶绿体基因组和线粒体基因组),用DNA分子标记可以分别对它们进行分析。目前,DNA分子标记主要可以分为以下几大类,即限制性片段长度多态性、随机扩增多态性DNA、扩增片段长度多态性、微卫星或称为简单序列重复、单核苷酸多态性。每种DNA分子标记均有其内在的优缺点,它们的应用随不同的具体情形而异。在遗传多样性研究方面,应用DNA分子标记技术的报道已不胜枚举。
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2023-06-29 08:53:311

遗传标记技术中aflp是指

AFLP技术是基于PCR反应的一种选择性扩增限制性片段的方法。由于不同物种的基因组DNA大小不同,基因组DNA经限制性内切酶酶切后,产生分子量大小不同的限制性片段。使用特定的双链接头与酶切DNA片段连接作为扩增反应的模板,用含有选择性碱基的引物对模板DNA进行扩增,选择性碱基的种类、数目和顺序决定了扩增片段的特殊性,只有那些限制性位点侧翼的核苷酸与引物的选择性碱基相匹配的限制性片段才可被扩增。扩增产物经放射性同位素标记、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,然后根据凝胶上DNA指纹的有无来检验多态性[5]。Vos等(1995)曾对AFLP的反应原理进行了验证,结果检测到的酶切片段数与预测到的酶切片段数完全一致,充分证明了AFLP技术原理的可靠性。进行AFLP分析时,一般应用两种限制性内切酶在适宜的缓冲系统中对基因组DNA进行酶切,一种为低频剪切酶,识别位点为六碱基的rare cutter;另一种为高频剪切酶,识别位点为四碱基的frequent cutter。双酶切产生的DNA片段长度一般小于500bp,在AFLP反应中可被优先扩增,扩增产物可被很好地分离,因此一般多采用稀有切点限制性内切酶与多切点限制性内切酶相搭配使用的双酶切。目前常用的两种酶是4个识别位点的Mse I和6个识别位点的EcoR I。AFLP接头和引物都是由人工合成的双链核苷酸序列。接头(Artificial adapter)一般长14~18个碱基对,由一个核心序列(Core sequence)和一个酶专化序列(Enzyme-specific sequence)组成。常用的多为EcoR I和Mse I接头,接头和与接头相邻的酶切片段的碱基序列是引物的结合位点。
2023-06-29 08:53:381

共显性遗传到底是什么情况

这个是大学《遗传学》书上的内容.所谓遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因.在重组实验中多用于测定重组型和双亲型.共显性遗传标记是指在2个样本基因,显示相同的标记,则两个基因相同或极相似,这个遗传标记称为共显性遗传标记.多用在亲本和子代之间的比较,证明亲本基因是否纯合.
2023-06-29 08:54:051

遗传图的发展历程

遗传图是以在某个遗传位点上具有多个等位基因的遗传标记作为路标,以遗传学上的距离即两个遗传位点之间进行交换、重组的百分率cM作为图距,反映基因遗传效应的基因组图。建立人类遗传图的关键是要有足够的高度多态的遗传标记。但是,目前所知的具多态性的性状不多,等位基因的数目有限,信息量不足。这样,就限制了人类基因组的遗传分析工作。所幸DNA重组技术的建立提供了新一代的遗传标记。第一代的DNA标记是RFLP(限制性片段长度多态性)分析。这些RFLP片断可被某些限制性内切酶特异识别并切割。DNA序列的改变甚至是一个碱基的改变,将会改变限制性内切酶酶切片段的长度变化,并可通过一种称为凝胶电泳的方法来方便地显示这种长度的多态性。RFLP在整个基因组中都存在,根据对RFLP片段的多态性分析,可对某些疾病进行诊断并将与疾病有关的基因进行定位。但RFLP提供的信息量有限,在检测RFLP片段时需用到放射性同位素,不太安全。第二代遗传标记是被称为简短串联重复片段的STR。在检测RFLP的过程中,人们发现有一种类型是由于DNA重复序列造成的。这些DNA重复序列在人类基因组中有很多拷贝,它们可以头对头或头对尾地串联成一簇,分布于基因组的各个位点。在某一位点上,不同数量的重复序列(VNTR)也可以提供不同的长度片断。有的VNTR重复单位长度为6-12个碱基,称为小卫星;有的VNTR重复单位为2-6个碱基,称为微卫星或简短串联重复(STR)。STR具有高度多态性,同一遗传位点数目变化很大,在群体中也可形成多达几十种的等位基因,这是其他遗传标记所不能比拟的;此外,还可以利用PCR的DNA体外扩增技术,实现操作机器自动化。至1996年初,所建立的遗传图已含有6000多个以STR为主体的遗传标记,平均分辨率即两个遗传标记间的平均距离为0.7分摩,这个距离大致对应于0.7Mb的物理距离。人类的遗传图一直落后于其他物种的遗传图,今天,人类终于也有了自己的一张较为详尽的遗传图。想一想,有6000多个遗传标记作为路标,把基因组分成6000多个区域,只要以连锁分析的方法,找到某一表现型的基因与其中一种遗传标记邻近(即紧密连锁)的证据,就可以把这一基因图定位于这一标记所界定的区域内。这样,如果想确定与某种已知疾病有关的基因,即可根据决定疾病性状的位点与选定的遗传标记间的遗传距离,来确定与疾病相关的基因在基因组中的位置。
2023-06-29 08:54:191

遗传标记的发展

自从19世纪中期,奥地利学者孟德尔首创了将形态学性状作为遗传标记的应用先例以来,遗传标记得到发展和丰富。形态学标记、细胞学标记、生化标记、免疫学标记等一直被广泛应用,然而这些标记都无法直接反映遗传物质的特征,仅是遗传物质的间接反映,且易受环境的影响,因此具有很大的局限性。DNA作为遗传物质的载体,是研究动物遗传特性的一个重要指标。20世纪80年代以来,随着分子生物学技术和分子遗传学的迅速发展,分子克隆及DNA重组技术的日趋完善,研究者对基因结构和功能研究的进一步深入,在分子水平上寻找DNA的多态性,以此为标记进行各种遗传分析。DNA分子标记直接反映DNA水平上的遗传变异,能稳定遗传,信息量大,可靠性高,消除了环境影响。DNA水平的遗传标记自产生以来得到广泛应用。
2023-06-29 08:54:441

遗传图谱怎么画

遗传图的画法如下:1、开始——绘图——选择矩形和椭圆,分别画一个正方形和圆形—形状填充选择白色。同样分别画一个黑色的正方形和圆形。2、开始——绘图——文本框—在白色形状右侧插入文本框并输入:正常男女。在黑色形状右侧插入文本框并输入:患病男女。3、插入——形状——直线—用直线画出遗传系谱上下层次结构图,复制矩形和圆形放置在直线指向相应位置。4、开始——绘图——文本框—在层次结构图从上至下每一层分别输入:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,表示第几代人。5、开始——绘图——文本框—在每一代人中分别输入123这样的序号。遗传图谱是某一物种的染色体图,显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。由遗传重组测验结果推算出来的、在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列(基因位点的排列)图。Genetic map,遗传图或遗传连锁图是以基因连锁、重组交换值构建的图谱,图距为cM(厘摩),1%交换值为1cM,约相当于1000kb。人基因组全长约3300cM,如两个标记之间相距1cM,则需3300个标记,如相距2~5cM,则需660~l650个标记。
2023-06-29 08:54:571

遗传标记的功能,应用

遗传标记的提出已有近半个世纪,其定义随着它的不断发展而渐渐趋于完善。目前较完整的表述是指易于识别,遵守孟德尔遗传模式,具有个体特异性或其分布规律具有种质特征的某一类表型特征或遗传物质。其种类包括:形态标记、细胞学标记、生化及分子标记等。遗传标记在动物遗传育种研究中起到极大的推动作用,尤其是分子标记,由于自身显著的优势,近年来应用范围愈来愈广泛。在水禽育种中,生化标记的应用技术逐渐趋于成熟,关于分子标记的应用报道则较少。各种遗传标记多用于研究水禽起源、系统进化及经济性状的相关性;分析群体间遗传结构;预测杂种优势和进行标记辅助选择等。
2023-06-29 08:55:441

snp遗传标记为什么可以用于群体遗传

  snp遗传标记为什么可以用于群体遗传  全称Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括转换、颠换、缺失和插入,形成的遗传标记,其数量很多,多态性丰富。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2:1。  SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP ,人类基因组上的SNP 总量大概是3 ×10E6 个 。因此,SNP成为第三代遗传标志,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。
2023-06-29 08:55:511

亲子鉴定遗传标记的选择标准

亲子鉴定是STR分型检测技术在生活中的应用。可以说除了同卵多胞胎,地球上所有人加起来没有一个相同的。该技术对遗传标记的选择原则有:1、较高的个人识别几率,通常大于0.9;观察杂合度大于70%;2、在染色体上的位置相距较远,确保无连锁;3、与其他遗传标记复合检测时易于得到结果,且具有重要性;4、低stutter产物;5、低突变率;6、估计的等位基因长度在90-500bp,片段越小越适合DNA降解检材。为达到充分利用产物的目的,法医DNA分析中使用不同染色体的STR遗传标记,避免遗传间的连锁。
2023-06-29 08:56:001

关于林木遗传图谱构建的问题?

你看看这本书吧林木遗传连锁图谱构建研究进展与发展方向选自《遗传》2003年11月25卷6期中文版摘要:本文就目前国内外林木连锁遗传图谱领域的研究进展进行了综述,指出了该领域研究中存在的主要问题,即一方面是作图个体的数量有限,另一方面是采用的标记以随机标记为主,导致了建成的图谱以及利用图谱获得的数量性状基因位点(QTLs)信息具有杂交组合特异性,造成了QTLs的可信度和在林木遗传改良以及标记辅助选择中的实用性降低等现象。针对存在的问题,讨论了根据林木生物学特点选择合适遗传标记的意义,指出进行林木比较作研究的重要性和必要性。文中接着较为详尽地介绍了国外重要林木表达序列标签(EST)测序项目的研究进展,论述了功能已知和种间高度保守的表达序列标签多态性(ESTP)标记的由来,阐述了获得ESTP标记的主要方法,并指出应当利用ESTP标记进行林木遗传图谱构建、QTL定位和比较作图的研究。文中最后讨论了未来林木遗传图谱构建和QTL定位研究的发展方向,并探讨了我国在该领域取得重大进展的突破口,指出我国应首先进杨树尤其是中国乡土杨树树种该方面的研究。
2023-06-29 08:56:071

多态遗传标记 意思(polymorphic genetic marker)

是指一个标记在群体中存在着多样性(即多态),这样在分析群体时才能有用。例如在基因克隆的定位群体中,一个分子标记必须在F2群体中有多态性,在F2种有分离,才能用来做定位标记。
2023-06-29 08:56:141

遗传标记基因在基因工程载体中承担哪些功能

基因工程中标记基因必不可少,基因工程的核心步骤,构建基因表达载体,中用标记基因检测重组质粒是否已经导入受体细胞中,从而区分己导入细胞和未导入细胞。(标记基因通常是抗生素基因。)标记基因的功能是鉴定目的基因是否导入受体细胞 没有鉴定是否成功导入质粒的 鉴定目的基因是否导入受体细胞有四个层次 1 直接鉴定受体细胞中是否有目的基因 用DNA分子杂交 2 鉴定目的基因是否转录 分子杂交(mRNA) 3 目的基因是否表达 抗原-抗体 (蛋白质) 4 看受体细胞发育成的个体是否表现出相关性状目的基因的检测和鉴定是在确定目的基因已经导入受体细胞后,而不知道基因是否可以稳定维持和表达其遗传特性而进行的操作。标记基因的作用是:“为了鉴别受体细胞中是否含有目的基因,从而将含有目的基因的细胞筛选出来。(也就是说是,鉴别和筛选含有目的基因的细胞)”。所以基因工程的第四步“目的基因的检测和鉴定”没有用到标记基因。标记基因的作用不是目的基因的检测和鉴定,而是鉴别和筛选含有目的基因的细胞。
2023-06-29 08:56:211

DNA亲子鉴定能判断出是父子关系还是兄弟

dna的鉴定不是说像一般人想象的那样有一个明确的结果,而是靠实验数据进行分析的,具体是看遗传的染色体对应点,通常一对一认定只能确定有血亲关系,所以可能出现你所说的其实儿子是父亲的。
2023-06-29 08:56:301

什么技术有助于测出人类基因组碱基对的全序列?

第1代标记经典的遗传标记,例如ABO血型位点标记,HLA位点标记。70年中后期,限制性片段长度多态性(RFLP),位点数目大于105,用限制性内切酶特异性切割DNA链,由于DNA的一个“点”上的变异所造成的能切与不能切两种状况,可产生不同长度的片段(等位片段),可用凝胶电泳显示多态性,从片段多态性的信息与疾病表型间的关系进行连锁分析,找到致病基因。如Huntington症。但每次酶切2-3个片段,信息量有限。第2代标记1985年,小卫星中心(minisatellite core)、可变串联重复VNTR(variable number of tandem repeats)可提供不同长度的片段,其重复单位长度为6至12个核苷酸 ,1989年微卫星标记(microsatellite marker)系统被发现和建立,重复单位长度为2~6个核苷酸,又称简短串联重复(STR)。第3代标记1996年MIT的Lander ES又提出了SNP(single nucleotide polymorphysm)的遗传标记系统。对每一核苷酸突变率为10-9,双等位型标记,在人类基因组中可达到300万个,平均约每1250个碱基对就会有一个。3~4个相邻的标记构成的单倍型(haplotype)就可有8~16种。物理图谱物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。DNA物理图谱是指DNA链的限制性酶切片段的排列顺序,即酶切片段在DNA链上的定位。因限制性内切酶在DNA链上的切口是以特异序列为基础的,核苷酸序列不同的DNA,经酶切后就会产生不同长度的DNA片段,由此而构成独特的酶切图谱。因此,DNA物理图谱是DNA分子结构的特征之一。DNA是很大的分子,由限制酶产生的用于测序反应的DNA片段只是其中的极小部分,这些片段在DNA链中所处的位置关系是应该首先解决的问题,故DNA物理图谱是顺序测定的基础,也可理解为指导DNA测序的蓝图。广义地说,DNA测序从物理图谱制作开始,它是测序工作的第一步。制作DNA物理图谱的方法有多种,这里选择一种常用的简便方法──标记片段的部分酶解法,来说明图谱制作原理。用部分酶解法测定DNA物理图谱包括二个基本步骤:⑴完全降解选择合适的限制性内切酶将待测DNA链(已经标记放射性同位素)完全降解,降解产物经凝胶电泳分离后进行自显影,获得的图谱即为组成该DNA链的酶切片段的数目和大小。⑵部分降解以末端标记使待测DNA的一条链带上示踪同位素,然后用上述相同酶部分降解该DNA链,即通过控制反应条件使DNA链上该酶的切口随机断裂,而避免所有切口断裂的完全降解发生。部分酶解产物同样进行电泳分离及自显影。比较上述二步的自显影图谱,根据片段大小及彼此间的差异即可排出酶切片段在DNA链上的位置。下面是测定某组蛋白基因DNA物理图谱的详细说明。完整的物理图谱应包括人类基因组的不同载体DNA克隆片段重叠群图,大片段限制性内切酶切点图,DNA片段或一特异DNA序列(STS)的路标图,以及基因组中广泛存在的特征型序列(如CpG序列、Alu序列,isochore)等的标记图,人类基因组的细胞遗传学图(即染色体的区、带、亚带,或以染色体长度的百分率定标记),最终在分子水平上与序列图的统一。基本原理是把庞大的无从下手的DNA先“敲碎”,再拼接。以Mb、kb、bp作为图距,以DNA探针的STS(sequence tags site)序列为路标。1998 年完成了具有52,000个序列标签位点(STS),并覆盖人类基因组大部分区域的连续克隆系的物理图谱。构建物理图的一个主要内容是把含有STS对应序列的DNA的克隆片段连接成相互重叠的“片段重叠群(contig)”。用“酵母人工染色体(YAC)作为载体的载有人DNA片段的文库已包含了构建总体覆盖率为100%、具有高度代表性的片段重叠群”,近几年来又发展了可靠性更高的BAC、PAC库或cosmid库等。序列图谱随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。大规模测序基本策略 逐个克隆法对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。全基因组鸟枪法在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装(美国Celera公司)。
2023-06-29 08:57:001

抚顺市亲子鉴定的原理是什么?

通过DNA检测分析来做亲子鉴定,其原理来自于孟德尔的遗传规律。DNA是人类遗传的基本载体,DNA遗传标记通过遗传终身不变。DNA存在于细胞核内的染 色体上,人类为维持种族的延续,必须把他们的遗传信息(DNA)稳定地传递给下一代。每个人体细胞有23对(46条)成对的染色体,其分别来自父亲和母 亲。夫妻之间各自提供的23条染色体,在受精后相互配对,构成了23对(46条)孩子的染色体,如此循环往复构成生命的延续。由于人体约有30亿个核苷酸 构成整个染色体系统,而且在生殖细胞形成前的互换和组合是随机的,所以除同卵双胞胎以外,没有任何两个人具有完全相同的核苷酸序列,这就是人的遗传多态 性。尽管遗传多态性的存在,但每一个人的染色体必然也只能来自其父母,这就是DNA亲子鉴定的理论基础。
2023-06-29 08:57:084

完整的遗传图解

遗传图谱(geneticmap)定义:某一物种的染色体图谱(也就是我们所知的连锁图谱),显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。以下为遗传图解p:高茎╳矮茎dddd↓↓配子:ddf1:dd高茎↓配子:ddddd高茎1/4dd高茎1/4ddd高茎1/4dd矮茎1/4f2基因型:dd:dd:dd=1:2:1表现型:高茎:矮茎=3:1
2023-06-29 08:57:223

DNA有多个位点的基因型不符合遗传规律是什么意思

DNA有多个位点的基因型不符合遗传规律是什么意思根据孟德尔遗传的分离和自由组合定律,亲代基因型决定子代基因型,他们之间基因型关系如表1所示.在没有基因突变、分型错误的前提下:①孩子的一对等位基因必定是一个来自父亲,一个来自母亲;②孩子不可能带有双亲均没有的等位基因.这两点是亲权鉴定的基本原理.也就是说,在肯定孩子的某个等位基因为生父基因,而假设父并不带此等位基因时,不能排除他为孩子的生父.对于父系遗传的Y染色体,子代的分型必定与父亲的相同,而且同一父系的所有个体的分型一致;对于母系遗传的线粒体DNA,子代的分型必定与母亲的相同,而且同一母系的所有个体的分型一致.仅根据上述遗传定律假设父与孩子之间在一个遗传标记上不符合遗传规律就可以排除其父子关系,但由于突变等多种原因的存在,一个基因座不符合遗传规律,可能是由突变等原因造成的,而且有文献已报道在真实的家系中存在两个遗传标记的突变,因此一个遗传标记的不符不能否定其亲缘关系[2].通过分子遗传学分析,在亲权鉴定中,3个以上STR基因座不符合遗传规律时,可排除亲子关系;当1或2个STR基因座不符合遗传规律时,增加检测手段,仍未发现新的不符合遗传规律的遗传标记,且RCP值大于99.99%的,可以肯定亲子关系.
2023-06-29 08:57:371

遗传标记技术中aelp是指

1. 什么是遗传标记技术遗传标记技术是一种用来鉴定物种基因差异的分子生物学技术。遗传标记是指位于基因组中固定位置或遗传标记基因上的特定DNA序列,它们不参与基因编码,但可以被用来辨别不同个体基因型。在遗传学研究中,遗传标记能够提供非常重要的信息,例如亲缘关系、种群结构以及遗传演化等等。2. AELP的定义及意义AELP全称"Aelurostrongylus abstrusus Excretory/Secretory Larval Protein",是指一种从弓形虫寄生于猫肺组织中采集的特定蛋白质。该蛋白通过Polyethylene glycol(PEG)病毒清除过程分离出来,并用于免疫蚤传控制。AELP属于一种遗传标记,其检测能揭示猫肺弓形虫感染情况,对指导流行病学认识和药物研究具有重要意义。3. AELP技术的原理及特点AELP技术的原理是通过PCR扩增目标序列,然后进行约束酶切。在进行电泳分离后,可对扩增产物进行检测。AELP作为一种遗传标记技术,其检测具有灵敏度高、特异性好、简便易行等特点。同时,该技术可以在猫免疫调查、药物研究以及临床诊断中得到广泛应用。4. AELP技术在实际应用中的作用在实际应用中,AELP技术可以用于检测猫弓形虫感染情况,从而帮助了解猫肺弓形虫的流行情况。此外,通过对不同地区猫群体的检测,可以更好地掌握弓形虫在全国范围内的分布状况。在药物研究领域,AELP技术可以作为一种标记方法,用于对药物的疗效进行评估。同时,该技术也是研究猫弓形虫遗传变异的重要手段。5. AELP技术的不足及未来研究方向虽然AELP技术有很多优点,但也存在一些缺陷。例如,AELP技术只能检测出猫肺弓形虫的感染情况,而无法判断感染的程度和细胞免疫的状况。同时,该技术受到环境、检测材料以及PCR条件等因素的影响,可能会产生假阴性或假阳性的结果。未来,AELP技术可以结合其他标记方法,如SNP、STR等,进一步提高检测水平和准确性。同时,也可以通过建立更为完整、全面的基因库,探索更多遗传标记,为遗传标记技术的研究提供更加基础性的支持与实践。
2023-06-29 08:57:441

遗传标记基因的作用是什么

可以作为基因工程中检测基因表达载体是否成功导入受体细胞的指标。
2023-06-29 08:57:524

遗传作图的DNA分子标记

DNA 分子标记大多是以DNA片段电泳谱带形式表现的。依其遗传特性可分为显性和共显性标记2种;依多态性检测手段可分为以Southern杂交技术为核心的分子标记和以PCR技术为核心的分子标记;根据在基因组中出现的频率,又可分为低拷贝序列和重复序列标记。限制性片段多态性RFILP是第—种用于研究的DNA标记。限制性核酸内切酶是一种在特定序列上切割DNA分子的酶,用它处理一个DNA分子时,即产生限制片段。这种序列特异性意味着用一种限制酶处理一种DNA分子总会产生同样的片段。但对于基因组DNA来说,并不总是这样。这是因为有些限制位点具多态性,以两种等位形式存在。一种等位形式有正确的限制位点序列,能被酶切开;另一等位形式的序列有改变,从而该限制位点不能被识别。后者的结果是在核酸内切酶处理后,两个相邻的限制片段仍然连接在一起,从而导致了长度多态性(如图1)。这就是一个RFLP的例子。如同用基因作为标记一样,RFLP在基因组图谱上的位置可以通过追踪其等位基因的遗传而得到。人类基因组中大约有100000个RFLP,但是理所应当的每个RFLP只能有两种等位形式(有或没有这个位点),这就限制了RFLP在人类基因作图上的应用价值,因为一个家庭的所有成员很可能都是某一个RFLP的纯合子。(简单来说,它不能区分纯合子和杂合子)。随机扩增片段长度多态性标记(Random Amplified Polymorphic DNA ,RAPD)RAPD技术是由Williams等首先创立的一种DNA分子标记技术,利用单一的10个碱基寡核苷酸作为引物,对基因组DNA进行PCR扩增。经琼脂糖凝胶电泳来检测DNA序列多态性。扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism ,AFLP)AFLP是Zeabeau 等(1993)发明的一项技术,它既有RFLP的可靠性,又有RAPD的方便性。其基本原理是通过PCR 扩增基因组DNA片段,扩增产物的变性聚丙烯酰胺电泳显示扩增片段长度多态性,其中引物=接头+酶切位点+2~3个核苷酸。AFLP技术分析流程:⑴DNA 模板制备;⑵提取样本DNA 经浓度和质量检测后,一般采用双酶(EcoRI和MSEI或PstI或TaqI)酶切, 在基因组DNA上产生低频和高频切口;⑶选择性扩增酶切片段。酶切后,限制性片段在T4连接酶作用下与特定接头连接,形成带有接头的特异性片段;⑷PCR前扩增,一般用带一个选择性引物进行预扩增,反应条件与常规PCR反应基本一致;⑸利用放射性同位素标记或荧光标记PCR 引物;⑹在Taq聚合酶作用下完成94 ℃变性30s ,65 ℃淬火30s,72 ℃延伸60s,PCR扩增36个循环;⑺PCR产物在含尿素聚丙烯酰胺上电泳;⑻将电泳后的凝胶转移到吸附滤纸上,经干胶仪进行干胶处理;⑼在X光片上感光,数日后冲洗胶片并进行结果分析。AFLP反应起始一般高温复性(一般65 ℃),因此只有那些与3"端严格配对的片段才能得到扩增,选择性很强。实验结果稳定,重复性好,呈典型的孟德尔式遗传,每个AFLP可以获得50~100条谱带信息,多态性强。微卫星(Microsatellite)微卫星是指以几个(1~6 bp) 核苷酸为单位,多次串联重复序列,也称之为简单重复序列(single sequence repeats ,SSR) 、短串联重复序列(short tandem repeats ,STR)或简单序列长度多态性(single sequence length polymorphism ,SSL P)。广泛分布于真核生物基因组中,大约每隔10~50bp就有一个微卫星,由于重复次数和重复程度的不完全而造成每一个位点的多态性。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)基因组中存在单个的点突变,且数量极大,有些也对产生RFLP,但许多并个能。这是囱为它们所处的序列不能被限制件内切核酸酶所识别。在人类基因组中,据认为有200000个以上的SNP(single nucleotidc polymorphism)位干基因内.而且有更多的SNP位于非基因的DNA中。每个SNP只有两个等位基因,所以这些标记在人类绘制遗传图谱方面又与RFLP同样的缺点:对于一个SNP,很可能—个家族的所有成员都是纯合子。SNP的优点是它数目庞大,而且对SNP分型所用的方法不需凝胶电泳。这非常重要,因为已证明凝胶电泳很难实现自动化,所以使用它的检测方法相对缓慢而且费力。由于SNP以寡核苷酸杂交分析(oligonucleotide hybidization analysis)为基础,故其检测更快速。寡核苷酸是在试管中合成的通常小于50个核苷酸的短单链DNA分子。在适当的条件下,一个寡核苷酸与另一个DNA分子仅在可形成完全的碱基配对结构时才能杂交。如果有一个错配,寡核昔酸上就有一个位置不能形成碱基对。则不能杂交(图1)。因此寡核苷酸杂交能区分一个SNP的两个等位基因。筛选策略包括:DNA芯片(DNA chip)技术DNA芯片是一块面积为2cm平方或更小的硅片,以高密度排列方式携带有许多不同的寡核苷酸。待测DNA用荧光标记后加到芯片的表面。用荧光显微镜观察杂交情况,显示荧光信号的位置即表示该处的寡核苷酸与待测DNA发生了杂交。因此一个实验中可以量化许多SNP。动态等位基因特异的杂交(dynamic allele-specific hybridization,DASH) 在这种技术中,杂交在溶液中进行,比如在96孔微量滴定板的一个孔中进行G荧光标记只能与双链DNA结合,因此只有发生了杂交才能检测到信号。开始,杂交在允许有错配的条件下进行。在这个阶段,无论待测DNA含有哪一种SNP等位基因,寡核苷酸都能与之杂交。由于错配的杂交产物不如完全杂交产物稳定,故在较低温度解链.因此可以通过升高温度来区分等位基因。这样就可以从使杂交依赖性荧光信号消失的温度来判定待测DNA中存在哪一种等位基因。
2023-06-29 08:57:591

法医dna分析使用的dna遗传标记有哪些

目前主流的遗传标记为短串联重复序列(STR)。这类标记具有遗传稳定性高、高度多态性、易于复合扩增等优点。另外,单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失多态性(Indel)也可应用于法医学DNA分析,但其普及率偏低,没有被广泛使用。
2023-06-29 08:58:121

VNTR是第几代标记

VNTR是第二代遗传标记。基因组多态主要包括散在重复序列(如AluI序列等)、可变数目的串联重复多态序列(variablenumberOftandemrepeat,VNTR)、SNP和大片段DNA拷贝数多态性(copynumberpolymorphisms,CNP)。VNTR是第二代遗传标记,包括卫星DNA、小卫星DNA(minisatelliteDNA)和微卫星DNA(microsatelliteDNA)。其中,微卫星DNA又称为短串联重复序列(simpletandemrepeats,STR),主要表现为2—6个核苷酸的串联重复,因此杂合度和信息度高。由于其位点在人类基因组中分布较广,且符合孟德尔遗传规律,是很好的遗传标记。
2023-06-29 08:58:191

ig的遗传标记位于

ig的遗传标记位于A.V、VLC1、CLC2VL、CLC3。主要表现在Ig分子上的CH和CL上一个或数个氨基酸的差异,目前已在IgG和IgA重链(γ和α)及κ型轻链恒定区内发现有决定同种异型抗原特异性的遗传标志。
2023-06-29 08:58:261

遗传标记有哪些?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚,但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物,虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因,也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中,遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。
2023-06-29 08:58:451

遗传标记有几类?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚,但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物,虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因,也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中,遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。
2023-06-29 08:58:521

遗传标记有几类?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚,但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物,虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因,也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中,遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。
2023-06-29 08:58:591

遗传标记是指哪种基因?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚,但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物,虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因,也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中,遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。
2023-06-29 08:59:061

遗传标记是指哪种基因?

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚,但应突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物,虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因,也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中,遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称选择性基因)二类。
2023-06-29 08:59:131

遗传标记的定义

遗传标记Genetic Marker指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记(morphological marker)、细胞学标记(cytological marker)、生物化学标记(biochemical marker)、免疫学标记(Immune Genetic Markers)和分子标记(molecular marker)五种类型。
2023-06-29 08:59:201

遗传标记有几个特征?

遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。
2023-06-29 08:59:321

为什么DNA分子标记是一种较为理想的遗传标记类型?

20世纪80年代以来,DNA分子标记技术被广泛用于植物的遗传多样性和遗传关系研究。相对其他标记类型来说,DNA分子标记是一种较为理想的遗传标记类型,其原因包括:(1)核苷酸序列变异一般在选择上是中性的,至少对非编码区域是这样;(2)由于直接检测的是DNA序列,标记本身不存在基因型与环境互作;(3)植物细胞中存在三种基因组类型(核基因组、叶绿体基因组和线粒体基因组),用DNA分子标记可以分别对它们进行分析。目前,DNA分子标记主要可以分为以下几大类,即限制性片段长度多态性、随机扩增多态性DNA、扩增片段长度多态性、微卫星或称为简单序列重复、单核苷酸多态性。每种DNA分子标记均有其内在的优缺点,它们的应用随不同的具体情形而异。在遗传多样性研究方面,应用DNA分子标记技术的报道已不胜枚举。
2023-06-29 08:59:421

4、载体遗传标记筛选法最常用的两种方法是什么?

序列特异性筛选法和亲和筛选法。遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称非选择性基因)二类。
2023-06-29 08:59:481

遗传标记在遗传学研究中有什么应用

遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、免疫学标记和分子标记五种类型。遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称非选择性基因)二类。
2023-06-29 09:00:231

细胞遗传标记包括哪些内容?

细胞遗传标记是遗传标记的一种,指对处理过的动物个体染色体数目和形态进行分析,主要包括:染色体核型和带型及缺失、重复、易位、倒位等。一个物种的核型特征即染色体数目、形态及行为的稳定是相对的,故可作为一种遗传标记来测定基因所在的染色体及在染色体上的相对位置,染色体是遗传物质的载体,是基因的携带者,染色体变异必然会导致生物体发生遗传变异,是遗传变异的重要来源。通过比较动物与其近缘祖先的染色体数目和结构,追溯动物的起源和演化,检测动物的遗传特性,为动物育种提供较好的方法。
2023-06-29 09:00:501

遗传标记的介绍

遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。也有用着丝粒作为遗传标记的。在微生物遗传学中遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记(或称非选择性基因)二类。
2023-06-29 09:00:571