关于基因表达,什么是过表达?
过表达,即表达过度,当基因表达(转录)的严格控制被打乱时,基因可能不恰当被“关闭”,或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生,大量蛋白质(protein)产物出现。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链或反义链;而不作为转录模板的链称为编码链或有义链,编码链与模板链互补,它与转录产物的差异仅在于DNA中的胸腺嘧啶(T)变为RNA中的尿嘧啶(U)。基因表达包括:转录,RNA剪接,翻译和翻译后修饰,进行调控来实现对基因表达的调控。基因调控赋予细胞对结构和功能的控制,基因调控是细胞分化、形态发生以及任何生物的多功能性和适应性的基础。在遗传学中,基因表达是基因型产生表型的最基本水平。存储在DNA中的遗传密码通过基因表达得到“翻译”,并且基因表达的特性产生生物体的表型。因此,基因表达的调节对于生物体的发育至关重要。以上内容参考:百度百科-基因表达
什么是基因表达模式分析
说白了就是分析基因如何表达的。基因表达模式,就是从DNA到蛋白质的过程,这个过程是如何进行的就是它的模式。
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控的方式: 1、DNA、染色体水平调控:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化; 2、转录水平调控:转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控; 3、转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等; 4、翻译水平调控:对mRNA稳定性的调控、反义RNA对翻译水平的调控等; 5、翻译后水平调控:蛋白质的剪切、化学修饰、转运等; 6、mRNA降解的调控。
基因表达调控定义是什么?基因表达最主要的调控点是什么.
对基因转录和翻译进行调控的过程,就叫做基因表达调控,具体 可以看下 调控点有很多,但是主要的调控点分为转录水平上的基因表达调控和翻译水平上的基因表达调控. 1.转录水平的调控:包括DNA转录成RNA时的是否转录及转录频率的调控,DNA的序列决定了DNA的空间构型,DNA的空间构型决定了转录因子是否可以顺利的结合到DNA的调控序列上,比如结合到TATA等序列上. 2.翻译水平的调控:翻译水平的调控又可以分成翻译前的调控和翻译后的调控. a、翻译前的调控主要是RNA编辑修饰.生物体对RNA进行编辑剪切,比如核糖体RNA剪切后变成28S/16S/5S.还有一些甲基化修饰等等. b、翻译后调控主要是蛋白的修饰,蛋白修饰后可以成为有功能的蛋白或者有隐藏功能的蛋白.
基因表达的意义是什么?
基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中,把储存在dna顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5%~10%。也就是说,某些特定奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞,另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞,这就是基因的差别表达。其本质是开放某些基因,关闭某些基因,导致细胞的分化。希望能帮助你。^__^
基因表达和基因本质不属于经典遗传学吧
这个界限比较模糊,要看哪一个层次。经典遗传学基因的概念:基因具有下列共性:(1)基因具有染色体的重要特征(即基因位于染色体上),能自我复制,相对稳定,在有私分裂和减数分裂时,有规律地进行分配;(2)基因在染色体上占有一定的位置(即位点),并且是交换的最小单位,即在重组时不能再分割的单位:(3)基因是以一个整体进行突变的,故它是一个突变单位;(4)基因是一个功能单位,它控制正在发育有机体的某一个或某些性状,如白花、红花等。总之,经典遗传学认为基因是一个最小的单位,不能分割,既是结构单位,又是功能单位。分子遗传学关于基因的概念:分子遗传学的发展揭示了遗传密码的秘密,使基因的概念落实到具体的物质上,即基因在DNA分子上,一个基因相当于DNA分子上的一定区段,它携带有特定的遗传信息。这类遗传信息或被转录为RNA,包括信使RNA、转移RNA、核糖体RNA;或者信使RNA被翻译成多肽链。另一方面,在精细的微生物遗传分析中查明,基因并不是不可分割的最小单位,而是远为复杂得多的遗传和变异的单位。随着现代遗传学的发展,在分子水平上,根据重组、突变和功能将基因分成3个单位:(1)突变子:就是指性状突变时产生突变的最小单位。一个突变子可以小到只有一个碱基对;(2)重组子:就是指性状重组时,可交换的最小单位。一个交换子可以只包含一个碱基对;(3)顺反子:表示一个起作用的单位,基本符合通常所述的基因的大小或略小。它包括它包括一段DNA与一个多肽链合成相对应,平均为500-1500个碱基对。经典遗传学作为结构单位的基因,实际上包含大量的突变子或重组子。经典遗传学认为基因是最小的结构单位已经不能成立了,然而关于基因是一个功能单位的概念仍然是正确的。基因的概念是(1)可转录一条完整的RNA分子,或编码一条多肽链;(2)功能上被顺反测验或互补测验所规定。也就是说,基因相当于一个顺反子,包含许多突变子和重组子。
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控的方式: 1、DNA、染色体水平调控:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化; 2、转录水平调控:转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控; 3、转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等; 4、翻译水平调控:对mRNA稳定性的调控、反义RNA对翻译水平的调控等; 5、翻译后水平调控:蛋白质的剪切、化学修饰、转运等; 6、mRNA降解的调控。
基因表达的意义是什么?
基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5%~10%。也就是说,某些特定奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞,另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞,这就是基因的差别表达。其本质是开放某些基因,关闭某些基因,导致细胞的分化。希望能帮助你。^__^
基因表达量是什么
基因是DNA,中心法则的定义是从DNA到RNA到蛋白。基因表达量的高低,最终使用蛋白的量来衡量的
什么是基因表达调控?
分为转录水平上的基因表达调控和翻译水平上的基因表达调控。1.转录水平的调控:包括DNA转录成RNA时的是否转录及转录频率的调控,DNA的序列决定了DNA的空间构型,DNA的空间构型决定了转录因子是否可以顺利的结合到DNA的调控序列上,比如结合到TATA等序列上。 2.翻译水平的调控:翻译水平的调控又可以分成翻译前的调控和翻译后的调控。 a、翻译前的调控主要是RNA编辑修饰。生物体对RNA进行编辑剪切,比如核糖体RNA剪切后变成28S/16S/5S.还有一些甲基化修饰等等。 b、翻译后调控主要是蛋白的修饰,蛋白修饰后可以成为有功能的蛋白或者有隐藏功能的蛋白
基因表达的过程
问题一:基因表达实验流程是什么? 1、获取目的基因 2、目的基因与载体相连 3、含有目的基因的载体导入宿主细胞(原核或真核) 4、转录水平的鉴定:提取total RNA,可选用realtime-PCR或reverse transcription PCR鉴定 5、蛋白水平鉴定:Western blot 等 问题二:图甲所示为基因表达过程,图乙为中心法则,①~⑤表示生理过程.下列叙述正确的是( )A.图甲所示为 A、甲图中,转录和翻译同时进行,属于原核生物的基因表达过程,而原核生物没有染色体,故A错误;B、红霉素影响核糖体在mRNA上的移动,所以影响基因的翻译过程,故B错误;C、图乙中①是DNA复制、②是转录过程、③是翻译过程、④是RNA的复制,⑤是逆转录过程,图甲是基因控制蛋白质的合成过程,即转录和翻译,为图乙中的②③过程,故C错误;D、图乙中涉及碱基A与U配对的过程为②③④⑤,①过程中只有A与T配对,故D正确.故选:D. 问题三:dna的翻译过程 DNA转录翻译到蛋白质的详细过程 第一步:DNA双链解开,DNA双链的碱基得以暴露 第二步:游离的核糖核苷酸随机地与DNA的碱基互补时,两者以氢键结合 第三步:新结合的核糖核苷酸连接到正在合成的mRNA分子上 第四步:合成的mRNA从DNA链上释放.而后,DNA双链恢复 第五步:mRNA进入细胞质,与核糖体结合.携带甲硫氨酸的tRNA,通过与碱基AUG互补配,进入位点1. 第六步:携带组氨酸的tRNA以同样的方式进入位点2 第七步:甲硫氨酸通过与组氨酸形成肽键而转移到占据位点2的tRNA上 第八步:核糖体读取下一个密码子,原占据位点1的tRNA离开核糖体,占据位点2的tRNA进入位点1,一个新的携带氨基酸的tRNA进入位点2,继续肽链的合成.重复步骤五、六、七,直到核糖体读取到mRNA的终止密码.
基因表达过度是什么?
过表达,即表达过度,当基因表达(转录)的严格控制被打乱时,基因可能不恰当被“关闭”,或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生,大量蛋白质(protein)产物出现。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链或反义链;而不作为转录模板的链称为编码链或有义链,编码链与模板链互补,它与转录产物的差异仅在于DNA中的胸腺嘧啶(T)变为RNA中的尿嘧啶(U)。扩展资料基因表达包括以下依次发生的事件:(1)DNA分子作为一个模板合成相关的单链分子,称为核糖核酸(RNA)。和DNA一样,RNA包括位于糖-磷酸骨架上的碱基。新合成的RNA分子中的碱基序列由DNA模板上的碱基序列决定,由此,编码的信息从DNA分子转到RNA分子中,这个过程称为转录。(2)RNA分子加工,并且被转运到称为核糖体的蛋白质复合体,蛋白质复合体是蛋白质合成开始的地方。(3)蛋白质合成,氨基酸序列由RNA分子指定,这个过程称为翻译。在这个过程的最后,DNA分子中编码的信息已通过RNA分子转移到蛋白质生产机器,并且被用来生产蛋白质。参考资料来源:百度百科-表达过度参考资料来源:百度百科-基因表达
什么是基因表达水平
所谓基因表达,就是从DNA到mRNA再到蛋白的一个过程,基因表达水平一般是通过该基因转录的mRNA的多少来衡量的。每个基因转录产生的mRNA的量,是受到时空等多种因素调控的,个体在不同的生长发育阶段,或者不同的组织水平,基因转录出mRNA的量都是不一样的。例如,当某种植物长期生长在高盐的环境里,该植物体内与抗盐相关的基因的表达量就会增加,以适应这种高盐环境,是植物能够生存下来,这时植物抗盐相关的基因表达水平就相对高,希望我的回答能够帮你弄清这个问题,呵呵!
怎样控制基因表达
蛋白泛素化修饰或者用siRNA(或shRNA)干涉处理。DNA和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。转录水平调控:转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。转录后水平调控:真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。扩展资料:首先要构建增进转录的载体;为使克隆的目的基因得到有效的表达,必须将目的基因置于强的启动子控制之下:应用乳糖启动子,色氨酸启动子,λ噬菌体左向转录启动子等构建了较为理想的载体。通过修饰调整使目的基因处于正确转译相位。调节SD序列与转译起始位点之间的距离,使克隆基因最有效地表达。除了以大肠杆菌作为表达外源基因的宿主外,在枯草杆菌中也表达产生了乙型肝炎病毒核心抗原、口蹄疫病毒的主要抗原、人的β干扰素以及分泌型的人胰岛素原C肽。参考资料来源:百度百科-基因表达方法
基因表达的产物是什么
基因产物是基因表达过程中形成的RNA或蛋白质。基因表达产物的多少常用来衡量一个基因的表达活性,如果一个基因的表达产物异常减少的话,这种基因产物的数量异常常常预示着疾病基因的存在。基因(遗传因子)是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖,演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。
怎样调控基因表达?
蛋白泛素化修饰或者用siRNA(或shRNA)干涉处理。DNA和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。转录水平调控:转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。转录后水平调控:真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。扩展资料:首先要构建增进转录的载体;为使克隆的目的基因得到有效的表达,必须将目的基因置于强的启动子控制之下:应用乳糖启动子,色氨酸启动子,λ噬菌体左向转录启动子等构建了较为理想的载体。通过修饰调整使目的基因处于正确转译相位。调节SD序列与转译起始位点之间的距离,使克隆基因最有效地表达。除了以大肠杆菌作为表达外源基因的宿主外,在枯草杆菌中也表达产生了乙型肝炎病毒核心抗原、口蹄疫病毒的主要抗原、人的β干扰素以及分泌型的人胰岛素原C肽。参考资料来源:百度百科-基因表达方法
什么叫做基因表达水平(gene expression level)
这个level有量化的含义,在比较不同组织、不同时期同一种基因表达量多少的时候需要这个概念.另外需要指出的是,gene expression在某些情况下并不单单指从DNA到protein的表达,有时候也泛指从DNA到RNA的转录.
基因表达调控的层次及意义?
分为转录水平上的基因表达调控和翻译水平上的基因表达调控。1.转录水平的调控:包括DNA转录成RNA时的是否转录及转录频率的调控,DNA的序列决定了DNA的空间构型,DNA的空间构型决定了转录因子是否可以顺利的结合到DNA的调控序列上,比如结合到TATA等序列上。 2.翻译水平的调控:翻译水平的调控又可以分成翻译前的调控和翻译后的调控。 a、翻译前的调控主要是RNA编辑修饰。生物体对RNA进行编辑剪切,比如核糖体RNA剪切后变成28S/16S/5S.还有一些甲基化修饰等等。 b、翻译后调控主要是蛋白的修饰,蛋白修饰后可以成为有功能的蛋白或者有隐藏功能的蛋白。
基因表达实验流程是什么?
1、获取目的基因2、目的基因与载体相连3、含有目的基因的载体导入宿主细胞(原核或真核)4、转录水平的鉴定:提取total RNA,可选用realtime-PCR或reverse transcription PCR鉴定5、蛋白水平鉴定:Western blot 等
什么是基因表达
基因表达是指基因指导下的蛋白质合成过程。生物体生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需要的各种酶和蛋白质的基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则要在特定的反应式表达。基因表达的用运利用基因芯片研究干旱胁迫下玉米基因表达。玉米是全球第一大作物、中国第二大作物,而干旱是影响其产量的重要限制因素。开花期是玉米需水临界期,对干旱胁迫反应最敏感,此时逢干旱会使产量下降幅度最大。张教授的课题组以开花期玉米为材料,分别对其进行短期和长期的干旱胁迫,采用全基因组芯片研究了顶叶中基因的表达情况。扩展资料:基因表达的意义:有助于肺癌的早期诊断众所周知,吸烟是肺癌的风险因子,因此吸烟者被认为是肺癌的高风险人群。吸烟者的正常上皮细胞的基因表达模型是否可用于肺癌存在状态的一种生物标志呢?Avrum Spira和同事进行了这一研究。在预测患者是否会向癌症发展时,他们研究的生物标志的准确率达到90%。对病毒种类检测基因表达调控的指挥系统有很多种,不同生物使用不同的信号来指挥基因调控。原核生物和真核生物之间存在着相当大差异。原核生物中,营养状况、环境因素对基因表达起着十分重要的作用;而真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平、发育阶段等是基因表达调控的主要手段,营养和环境因素的影响则为次要因素。参考资料来源:百度百科-基因表达百度百科-基因表现
基因表达包括哪两个过程
基因表达包含转录和翻译两个过程。⒈转录:以一条DNA链为膜板合成一条mRNA,此过程在细胞核内完成后,mRNA通过核孔进入细胞质;⒉翻译:以这条mRNA为膜板,tRNA携带氨基酸与之进行碱基互补配对,然后经脱水缩合,形成一条肽链,该过程在核糖体上进行,肽链再经过旋转缠绕最后形成蛋白质。基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。同一基因在不同组织能生成不同的基因产物来源于不同组织的类似蛋白,可以由同一基因编码产生,这种现象首先是由于基因中的增强子等有组织特异性,它能与不同组织中的组织特异因子结合,故在不同组织中同一基因会产生不同的转录物与转录后加工作用。
概述基因表达主要包括哪些过程
基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。基因表达的过程:1、转录过程:在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程;2、翻译过程:以mRNA作为模板,tRNA作为运载工具,在有关酶、辅助因子和能量的作用下将活化的氨基酸在核糖体上装配为蛋白质多肽链的过程。
基因表达的三个阶段是怎样的?
1、复制(duplication)是在分子进化过程中产生新的遗传物质的主要机制。它可以定义为遗传物质的任何复制行为。复制的常见来源包括异位重组、逆转录、异倍性、多倍性和滑链错配等。2、转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。3、翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达还包括转录)过程中的第二步(转录为第一步),翻译是根据遗传密码的中心法则,将成熟的信使RNA分子(由DNA通过转录而生成)中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻译为氨基酸序列。转录特点转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体mRNA。在体内,转录是基因表达的第一阶段,并且是基因调节的主要阶段。转录可产生DNA复制的引物,在反转录病毒感染中也起到重要作用。转录仅以DNA的一条链作为模板。被选为模板的单链叫模板链,又称无义链;另一条单链叫非模板链,又称编码链、有义链、信息链。DNA上的转录区域称为转录单位(transcription unit)。RNA聚合酶合成RNA时不需引物,但无校正功能。
基因表达名词解释是什么?
基因表达就是基因转录及翻译的过程。基因表达水平一般是通过该基因转录的mRNA的多少来衡量的,每个基因转录产生的mRNA的量,是受到时空等多种因素调控的,个体在不同的生长发育阶段。基因表达可以简单分为两个过程:转录和翻译。真核细胞的转录发生在细胞核中,DNA被用作制造信使RNA(mRNA)的模板。在细胞质中进行翻译,mRNA中包含的信息用于制造多肽链。基因表达的翻译过程:翻译的目的是为了快速准确地产生多肽,从复合体上分离后,多肽链需要进行修饰才能行使其生理功能。在不同的细胞其中,不同的多肽链被进行不同的修饰。举个例子,为了产生分泌到胃肠道内的消化酶,多肽链需要先在内质网被修饰,然后经过高尔基体,以分泌囊泡的形式通过细胞膜进入到消化道内。以上内容参考:百度百科-基因表达
基因表达包括
基因表达包括:转录和翻译基因(遗传因子)是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖,演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。它也是决定生命健康的内在因素。因此,基因具有双重属性:物质性(存在方式)和信息性(根本属性)。带有遗传信息的DNA片段称为基因,其他的DNA序列,有些直接以自身构造发挥作用,有些则参与调控遗传信息的表现。组成简单生命最少要265到350个基因。(这涉及基因工作组的力量,人类的基因工作组与果蝇的基本相似)。19世纪60年代,奥地利遗传学家格雷戈尔·孟德尔就提出了生物的性状是由遗传因子控制的观点,但这仅仅是一种逻辑推理。20世纪初期,遗传学家摩尔根通过果蝇的遗传实验,认识到基因存在于染色体上,并且在染色体上是呈线性排列,从而得出了染色体是基因载体的结论。1909年丹麦遗传学家约翰逊(W. Johansen,1859~1927)在《精密遗传学原理》一书中正式提出“基因”概念。
什么是基因表达模式分析
什么是基因表达模式分析 说白了就是分析基因如何表达的。基因表达模式,就是从DNA到蛋白质的过程,这个过程是如何进行的就是它的模式。 什么是基因表达的系列分析? 基因表达系列分析 1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术,能同时对上千个转录物进行研究。 1. SAGE的原理和实验路线。 1.1 SAGE的原理 SAGE的主要依据有两个。第一,一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的资讯,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物(49),而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。第二,如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行测序,并将得到的短序列核苷酸顺序以连续的资料形式输入计算机中进行处理,就能对数以千计的mRNA转录物进行分析。 1.2 SAGE的实验路线。 如图1所示:(1) 以biotinylated oligo(dT)为引物反转录合成cDNA,以一种限制性内切酶(锚定酶 Anchoring Enzyme, AE)酶切。锚定酶要求至少在每一种转录物上有一个酶切位点,一般4碱基限制性内切酶能达到这种要求,因为大多数mRNA要长于256碱基(44)。通过链霉抗生物素蛋白珠收集cDNA3′端部分。对每一个mRNA只收集其polyA尾与最近的酶切位点之间的片段。(2) 将cDNA等分为A和B两部分,分别连线接头A或接头B。每一种接头都含有标签酶(Tagging Enzyme TE)酶切位点序列(标签酶是一种Ⅱ类限制酶,它能在距识别位点约20碱基的位置切割DNA双链)。接头的结构为引物A/B序列+标签酶识别位点+锚定酶识别位点。(3) 用标签酶酶切产生连有接头的短cDNA片段(约9~10碱基),混合并连线两个cDNA池的短cDNA片段,构成双标签后,以引物A和B扩增。(4) 用锚定酶切割扩增产物,抽提双标签(Ditga)片段并克隆、测序。一般每一个克隆最少有10个标签序列,克隆的标签数处于10~50之间。(5) 对标签资料进行处理。在所测序列中的每个标签间以锚定酶序列间隔,如图1中锚定酶采用Nia Ⅲ限制性内切酶,则以CATG/GTAC序列确定标签的起始位置和方向。 图1 基因表达系列分析(SAGE)示意 锚定酶(AE)和标签酶(TE)是NiaⅢ、FokI X和O分别表示不同标签的核苷酸顺序 由于双标签体的长度基本相同,不会导致扩增的偏态性,同时数量和种类极大的转录物使同一种标签连线成双标签体的可能性极小,这保证了克隆中的每一个标签代表一种转录物在当前细胞状态下的一个单位的转录产物,因此通过计算机软体的分析能够得到上千种基因表达产物的标签序列以及丰裕度。 虽然SAGE技术能够尽可能全面地收集生物组织的基因表达资讯,但也不能完全保证涵盖所有的低丰度的mRNA。另外标签体的连线可能因接头的干扰造成克隆所包含的标签体过少和克隆序列末端不能高效地连入载体。Powell利用磁性生物素珠特异吸附引物,避免了接头的干扰(Powell 1998)。 2. SAGE的优点和应用 SAGE是一项快捷、有效的基因表达研究技术,任何具备PCR和手动测序器具的实验室都能使用这项技术,结合自动测序技术能够在3个小时内完成1000个转录物的分析。另外使用不同的锚定酶(识别5~20碱基的Ⅱ类核酸内切酶),使这项技术更具灵活性。 首先SAGE可应用于人类基因组研究。1995年 Velculescu 等选择B *** F I和Nia Ⅲ分别作为标签酶和锚定酶,使用计算机对9碱基标签资料进行分析并对GenBank检索。在分析的1000个标签中,95%以上的标签能够代表唯一的转录物。转录水平依标签出现频率分为4类:① 超过三次 共380个,占45.2%;② 出现三次 共45个,占5.4%;③ 出现两次 共351个,占7.6%;④ 仅出现过一次 共840个,占41.8%。所以SAGE能够快速、全范围提取生物体基因表达资讯,对已知基因进行量化分析。SAGE也能应用于寻找新基因。虽然SAGE的标签仅包括9个碱基,但加上锚定酶的位点序列(4个碱基)共可确认13碱基序列。如果一个标签检索已知序列时没有同源序列,13碱基片段就可作为探针筛选cDNA文库得到cDNA克隆。 其次,SAGE可用于定量比较不同状态下的组织细胞的特异基因表达。Stephen L等(1997)利用SAGE技术比较小鼠胚囊纤维细胞基因表达。小鼠胚囊纤维细胞能产生对温度敏感的P53肿瘤抑制蛋白,就可通过SAGE分析,比较两种不同温度下基因表达的差异。从约15 000个分析的基因中,发现有14个基因的表达依赖于P53蛋白,有3个基因的表达与P53蛋白的失活显著相关。Zhang等(1997)比较正常细胞和肿瘤细胞基因表达的300000个转录物发现:在分析的4500种转录物中,至少有500种在两种细胞组织中的表达有显著差异。 第三,由于SAGE能够同时最大限度的收集一种基因组的基因表达资讯,转录物的分析资料可用来构建染色体表达图谱(Chromosomal expression map)。Victor等分析了酵母基因组的基因表达,从60633个转录物中发现了4655个基因(表达水平分布在0.3~2.0/细胞),其中1981个基因已被确认了功能,2684个还未被报道过。利用基因的表达资讯与基因组图谱融合绘制的染色体表达图谱,使基因表达与物理结构连系起来,更利于基因表达模式的研究。(Velculescu,1997) SAGE是基因表达定性和定量研究的一种有效工具,非常适合于比较不同发育状态或疾病状态的生物基因表达。另外SAGE能够接近完整地获得基因组表达资讯,能够直接读出任何一种型别细胞或组织的基因表达资讯。SAGE技术的应用将大大加快基因组研究的进展,但必须和其它技术相互融合、互为补充,才能最大可能地进行基因组基因表达的全面研究。 什么是基因表达? 是指生物体将一个基因所携带的遗传资讯转变为具有生物性的多肽链的过程。 基因表达 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传资讯经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子.生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。 1.转录过程 在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录(transcription).在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链(template strand),或反义链(antisensestrand);而不作为转录模板的链称为编码链(coding strand),或有义链(sense strand).在双链DNA中与转录模板互补的一条DNA链即编码链,它与转录产物的差异仅在于DNA中T变为RNA中的U.在含许多基因的DNA双链中,每个基因的模板链并不总是在同一条链上,亦即一条链可作为某些基因的模板链的,也可是另外一些基因的编码链。 转录后要进行加工,转录后的加工包括: (1)剪接:一个基因的外显子和内含子都转录在一条原始转录物RNA分子中,称为前mRNA(pre-mRNA),又称核内异质RNA(heterogenuous nuclear RNA,huRNA)。因此前mRNA分子既有外显子顺序又有内含子顺序,另外还包括编码区前面及后面非翻译顺序。这些内含子顺序必须除支而把外显子顺序连线起来,才能产生成熟的有功能的mRNA分子,这个过程称为RNA剪接(RNa splicing)。剪下发生在外显子的3"末端的GT和内含子3"末端与下一个外显子交界的AG处。 (2)加帽:几乎全部的真核 mRNa 端都具“帽子”结构。虽然真核生物的mRNA的转录以嘌呤核苷酸三磷酸(pppAG或pppG)领头,但在5"端的一个核苷酸总是7-甲基鸟核苷三磷酸(m7GpppAGpNp)。mNRA5"端的这种结构称为帽子(cap)。不同真核生物的mRNA具有不同的帽子。 mRNA的帽结构功能:①能被核糖体小亚基识别,促使mRNA和核糖体的结合;②m7Gppp结构能有效地封闭RNa 5"末端,以保护mRNA免疫5"核酸外切酶的降解,增强mRNA的稳定 (3)加尾:大多数真核生物的mRNA 3"末端都有由100~200个A组成的Poly(A)尾巴。Poly(A)尾不是由DNA编码的,而是转录后的前mRNA以ATP为前体,由RNA末端腺苷酸转移酶,即Ploy(A)聚合酶催化聚合到3"末端。加尾并非加在转录终止的3"末端,而是在转录产物的3"末端,由一个特异性酶识别切点上游方向13~20碱基的加尾识别讯号AAUAAA以及切点下游的保守顺序GUGUGUG,把切点下游的一段切除,然后再由Poly(A)聚合酶催化,加上Poly(A)尾巴,如果这一识别讯号发生突变,则切除作用和多聚腺苷酸化作用均显著降低。mRNAPoly(A)尾的功能是:①可能有助mRNA从核到细胞质转运;②避免在细胞中受到核酶降解,增强mRNA的稳定性。 2.翻译过程真核细胞的转录以及加工都是细胞核内进行,但翻译过程则在细胞质中进行。 以mRNA作为模板,tRNA作为运载工具,在有关酶、辅助因子和能量的作用下将活化的氨基酸在核糖体(亦称核蛋白体)上装配为蛋白质多肽链的过程,称为翻译(translation),这一过程大致可分为3个阶段: (1)肽链的起始:在许多起始因子的作用下,首先是核糖体的小亚基和mRNA上的起始密码子结合,然后甲酰甲硫氨酰tRNA(tRNA fMet)结合上去,构成起始复合物。通过tRNA的反密码子UAC,识别mRNA上的起始密码子AUG,并相互配对,随后核糖体大亚基结合到小亚基上去,形成稳定的复合体,从而完成了起始的作用。 (2)肽链的延和长:核糖体上有两个结合点——P位和A位,可以同时结合两个氨酰tRNA。当核糖体沿着mRNA从5"→3"移动时,便依次读出密码子。首先是tRNAfMet结合在P位,随后第二个氨酰tRNA进入A位。此时,在肽基转移酶的催化下,P位和A位上的2个氨基酸之间形成肽键。第一个tRNA失去了所携带的氨基酸而从P位脱落,P位空载。A位上的氨酰tRNA在移位酶和GTP的作用下,移到P位,A位则空载。核糖体沿mRNA 5"端向3"端移动一个密码子的距离。第三个氨酰tRNA进入A位,与P位上氨基酸再形成肽键,并接受P位上的肽链,P位上tRNA释放,A位上肽链又移到P位,如此反复进行,肽链不断延长,直到mRNA的终止密码出现时,没有一个氨酰tRNA可与它结合,于是肽链延长终止。 (3)肽链的终止:终止讯号是mRNA上的终止密码子(UAA、UAG或UGA)。当核糖体沿着mRNA移动时,多肽链不断延长,到A位上出现终止讯号后,就不再有任何氨酰tRNA接上去,多肽链的合成就进入终止阶段。在释放因子的作用下,肽酰tRNA的的酯键分开,于是完整的多肽链和核糖体的大亚基便释放出来,然后小亚基也脱离mRNA。 (4)翻译后加工(postranslational processing):从核糖体上释放出来的多肽需要进一步加工修饰才能形成具有生物活性的蛋白质。翻译后的肽链加工包括肽链切断,某些氨基酸的羟基化、磷酸化、乙酰化、糖基化等。真核生物在新生手肽链翻译后将甲硫氨酸裂解掉。有一类基因的翻译产物前体含有多种氨基酸顺序,可以切断为不同的蛋白质或肽,称为多蛋白质(polyprotein)。例如胰岛素(insulin)是先合成86个氨基酸的初级翻译产物,称为胰岛素原(proinsulin),胰岛素原包括A、B、C三段,经过加工,切去其中无活性的C肽段,并在A肽和B肽之间形成二硫键,这样才得到由51个氨基酸组成的有活性的胰岛素。 3.外显子与内含子表达过程中的相对性 从内含子与外显子的定义来看,两者是不能混淆的,但是真核生物的外显子也并非都“显”(编码氨基酸),除了tRNA基因和rRNA基因的外显子完全“不显”之外,几乎全部的结构基因的首尾两外显子都只有部分核苷酸顺序编码氨基酸,还有完全不编码基酸的外显子,如人类G6PD基因的第一外显子核苷酸顺序。 现在已发现一个基因的外显子可以是另一基因的内含子,反之亦然。以小鼠的淀粉酶基因为例,来源于肝的与来源于唾液腺的是同一基因。淀粉酶基因包括4个外显子,肝生成的淀粉酶不保留外显子1,而唾液腺中的淀粉酶则保留了外显子1的50bp顺序,但把外显子2与前后两段内含子一起剪下掉,经过这样剪接,外显子2就变成唾液淀粉酶基因中的内含子。 4.同一基因在不同组织能生成不同的基因产物 来源于不同组织的类似蛋白,可以由同一基因编码产生,这种现象首先是由于基因中的增强子等有组织特异性,它能与不同组织中的组织特异因子结合,故在不同组织中同一基因会产生不同的转录物与转录后加工作用。此外真核生物基因可有一个以一的poly(A)位点,因此能在不同的细胞中产生具有不同3"末端的前mRNA,从而会有不同的剪接方式。由于大多数真核生物基因的转录物是先加poly(A)尾巴,然后再行剪接,因此不同组织、细胞中会有不同的因子干预多聚腺苷酸化作用,最后影响剪接模式。 基因表达就是转录和翻译.转录发生在细胞核中,翻译发生在细胞质中的核糖体上. 基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传资讯经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。 基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传资讯经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。 基因表达包含转录(DNA到RNA)和翻译(RNA到蛋白质)两步。 基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传资讯经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。 全基因组基因表达分析包括lncrna吗 因此,lncRNA未来能否作为分子靶标成功应用于临床诊断和癌症治疗、细胞分化及发育等密切相关; 应急功能,尤其是与衰老相关的疾病有密切关系,例如心血管疾病、阿尔兹海默症:LncRNA可作为细胞内各种讯号招募蛋白形成复合物参与免疫反应和宿主防御。 LncRNA与疾病:LncRNA与人类的许多疾病LncRNA在生物体内的功能主要分为三大类: 生物学功能:LncRNA与表观遗传调控、转录调控,不像mRNA的翻译需要严格按照三联体密码子的使用法则一样,单个密码子的移码突变就会导致蛋白功能的丧失,lncRNA的保守区段可能仅在一段较短的区域内,这些较短区域对于结构或序列特异性相互作用较为关键、转录后调控、癌症等、miRNA调控:在lncRNA的基因组序列两端各设计1个gRNA,致使整个lncRNA区段或大部分片段序列缺失,从而实现lncRNA的敲除。 由于大多数长链非编码RNA在物种之间没有明显的序列保守性,对lncRNA进行碱基替换、插入或缺失部分序列时仍能表现出其原有的生物学活性。 技术原理 LncRNA敲除原理。因此lncRNA功能的缺失需要通过删除这段保守的区域来完成,将是其日后发展的难点与热点、糖尿病 基因表达分析与基因组测序与什么联络 基因表达分析是看表达量的,基因组测序是看基因组的突变情况,有无缺失,突变等,一个是定量的一个是定性的,可以理解为
“基因表达”、“基因差别表达”、“基因选择性表达”都是什么意思?
1、 基因表达(gene expression):是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。同一基因在不同组织能生成不同的基因产物来源于不同组织的类似蛋白,可以由同一基因编码产生,这种现象首先是由于基因中的增强子等有组织特异性,它能与不同组织中的组织特异因子结合,故在不同组织中同一基因会产生不同的转录物与转录后加工作用。2、 基因差别表达:指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5%~10%。也就是说,某些特定奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞,另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞,这就是基因的差别表达。其本质是开放某些基因, 关闭某些基因,导致细胞的分化。3、 基因选择性表达:由于细胞分化发生于 生物体的整个生命进程中,所以基因的选择性表达在生命过程各阶段都在体现。不仅如此,基因的选择性表达在单细胞原核、真核生物生长发育中,甚至病毒的 生命活动中都明显表现,这充分体现了基因的选择性表达的普遍性。什么是基因?因(遗传因子、遗传基因)指携带有遗传信息的DNA序列,是控制性状的基本遗传单位,亦即一段具有功能性的DNA序列。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表现。人类约有两万至两万五千个基因。染色体在体细胞中是成对存在的,每条染色体上都带有一定数量的基因。一个基因在细胞有丝分裂时有两个对列的位点,称为等位基因,分别来自父与母辈。按照其控制的性状,又可分为显性基因和隐性基因。一般来说,生物体中的每个细胞都含有相同的基因,但并不是每个细胞中的每个基因所携带的遗传信息都会被表达出来。不同部位和功能的细胞,能将遗传信息表达出来的基因也不同。参考资料搜狗百科:http://baike.sogou.com/v712473.htm?fromTitle=基因选择性表达
基因表达的意义是什么?
基因表达调控(geneexpressionregulationandcontrol)是指通过生物体内的调控系统来调节和控制体内蛋白质的含量与活性,使之在特定的时间、特定的空间、并以一定的强度出现,以适应机体生长、发育和繁殖的需要。基因表达调控的生物学意义:(一)适应环境、维持生长和增殖;(二)维持个体发育与分化
基因表达的过程,具体些
首先,DNA上的基因前面有其相应的启动子,那个是RNA聚合酶的识别和结合位点,RNA聚合酶的作用下,以DNA分子的一条链为模版,四种游离的核糖核苷酸为原料,遵循碱基互补配对原则,进行转录,地点在细胞核内,转录的结果就是产生一条mRNA,然后mRNA通过核孔进入细胞质,与核糖体结合,开始翻译过程,mRNA上的相邻三个碱基为一个密码子,与一个带有对应氨基酸的tRNA,通过碱基互补配对结合,然后tRNA离开,那个氨基酸通过脱水缩合的方式与下一个tRNA上的氨基酸结合,最终形成肽链,一条或多条肽链经过一定的盘曲折叠形成具有一定空间结构的蛋白质。呼呼,累死咯......好多字
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平:1.DNA、染色体水平调控:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。3.转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。4.翻译水平调控:对mRNA稳定性的调控、反义RNA对翻译水平的调控等。5.翻译后水平调控:蛋白质的剪切、化学修饰(磷酸化、乙酰化、糖基化等)、转运等。6.mRNA降解的调控。
(基因表达)为什么转录翻译后胸腺嘧啶就消失了,在之后就没出现过了,为什么密码子表只有AUGC没有T?
这是转录,不是DNA的复制。基因转录是以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,合成RNA的过程。转录出来的是mRNA,是信使RNA,它的作用就是为蛋白质的合成提供模板的。T是胸腺嘧啶,只存在于DNA中,在RNA中是U,尿嘧啶。因为基因是通过不同的蛋白质来表达的,而蛋白质又是以mRNA为模板合成出来的,所以遗传密码就以mRNA中的碱基序列来表示了。就是说,在遗传密码表中,只有U,没有T了。遗传密码表
组蛋白的修饰是怎么样影响基因表达的
在哺乳动物基因组中,组蛋白则可以有很多修饰形式.。一个核小体由两个H2A,两个H2B,两个H3,两个H4组成的八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成.组成核小体的组蛋白的核心部分状态大致是均一的,,游离在外的N-端则可以受到各种各样的修饰,,包括组蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化,ADP核糖基化等等.,这些修饰都会影响基因的转录活性。组蛋白的甲基化修饰:组蛋白被甲基化的位点是赖氨酸和精氨酸.赖氨酸可以分别被一、二、三甲基化,精氨酸只能被一、二甲基化.在组蛋白H3上,共有5个赖氨酸位点可以被甲基化修饰.一般来说,,组蛋白H3K4的甲基化主要聚集在活跃转录的启动子区域。组蛋白H3K9的甲基化同基因的转录抑制及异染色质有关。EZH2可以甲基化H3K27,,导致相关基因的沉默,,并且与X-Chromosomeinactivation相关.。H3K36的甲基化同基因转录激活相关。
组蛋白的修饰是怎么样影响基因表达的
组蛋白甲基化诱导了DNA的甲基化:组蛋白甲基化是招募DNA甲基化酶DNMT的信号,在异染色质蛋白HP1的协助下,DNA发生甲基化。DNA的甲基化又诱导组蛋白的去乙酰化:甲基CpG结合蛋白MeCP2可以特定地结合到甲基化的DNA.上,在组蛋白去乙酰化酶的作用下,将组蛋白.上的乙酰基去掉。而组蛋白去乙酰化状态是异染色质的特征,是基因失活的表现。去乙酰化的染色质具有一个更浓缩的结构。结果基因转录被抑制。去乙酰化的染色质可以在组蛋白乙酰基转移酶HAT的作用下而发生组蛋白乙酰化,转录进行。但是这个过程可以被组蛋白去乙酰化酶HDAC逆转。HDAC又可以被抑制因子抑制。于是转录又被激活