重组质粒和含目的基因的重组质粒的区别
含义不同。重组质粒是一种动作,方法。目的基因的重组质粒是名词,表示一种物质。质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。
目的基因是指重组质粒吗
目的基因就是我们利用限制性内切酶获得的一段特定长度的DNA片段,这个片段可能是具有一定抗性、或者是控制一个优良性状的遗传信息等。重组质粒则是“体外将目的片段和经切割目的片段相同的限制性内切酶切割后的载体质粒连接后的重组质粒”,即目的片段+载体质粒片段。(因为DNA片段不能单独存在,一般都是保存于质粒中,所以要想两个不同的片段连接起来,必须用相同的内切酶对载体质粒、含目的DNA的质粒进行酶切后,二者才能连接。所以目的DNA只是个DNA片段,重组质粒是质粒,二者不同,原理如上~~~忘采纳~
根据目的基因构建重组质粒的步骤
(1)用限制酶将质粒切割开形成黏性末端,用DNA连接酶将目的基因与质粒连接起来. (2)质粒的实质是环状DNA,基本组成单位是脱氧核苷酸;由图中限制酶切割位置可知,目的基因插入的位置是氨苄青霉素抗性基因中. (3)步骤③是基因工程第三步:将目的基因导入大肠杆菌(受体细胞).为了促进该过程,用Ca 2+ 处理大肠杆菌,使之成为感受态细胞. (4)培养基C是选择培养基,培养基中有四环素,专一筛选含四环素抗性基因的大肠杆菌,能在C中生长的大肠杆菌有两种,分别是含有抗四环素基因、同时抗四环素基因和含氨苄青霉素基因的大肠杆菌. (5)D培养基中大肠杆菌能抵抗四环素和含氨苄青霉素,而E中只抗一种四环素,所以在E中对应区域(D中没有菌落的部位),该处为转基因大肠杆菌,结果如图: 故答案为: (1)限制酶 DNA连接酶 (2)脱氧核苷酸 氨苄青霉素抗性 (3)将重组质粒(目的基因)导入大肠杆 菌(受体细胞) Ca 2+ (4)2 (5)E 如下图所示(两点全圈出给分). (1)限制酶 DNA连接酶 (2)氨苄青霉素抗性 (3)将重组质粒导入大肠杆菌(受体细胞) Ca 2+ (4)含四环素抗性基因的大肠杆菌 2 (5)E
重组质粒是否整合到宿主基因组中
你问的第二个问题有点模糊啊,不明白“所有的情况”指的到底是那些情况。不过,可以先回答你第一个问题,答案是,有些质粒的确可以将基因整合进宿主的基因组中。例如,大肠杆菌有一种质粒叫做f质粒(fplasmid),又称f因子、致育因子或性因子,是大肠杆菌等细菌决定性别并有转移能力的质粒。其基因组含有与质粒复制和转移有关的许多基因,其中近1/3是tra区,另外有orit(转移起始点)、oris(复制起始点)、inc(不相容群)、rep(复制功能)和一些转座因子,后者可整合到宿主核染色体上的一定部位,并导致各种hfr菌株的产生。
质粒与目的基因连接得到几种重组质粒 质粒与目的基因连接得的重组质粒
1、质粒与目的基因连接得到2种重组质粒。 2、如果是双酶切,而且两个酶切位点不能形成自连,那么插入目的基因也只能获得一种重组质粒。 3、如果是单酶切,或者双酶切的两个酶切位点是同尾酶,那么插入目的基因能获得两种重组质粒。
重组质粒表达蛋白时质粒上的基因是否也表达了呢?所说的目的蛋白就是,目的基因表达的蛋白吗?
质粒存在细菌和真菌里,当提到取质粒基因用DNA剪切酶作用后得到的DNA序列段再与目的基因与DNA黏合酶作用下得到目的质粒基因,培养后植入发酵菌细胞中.发酵后就可以提取产物. 质粒上原有的基因也会表达,重组后的基因也会表达,目的蛋白和原有质粒基因蛋白、目的基因质粒基因蛋白.三者混合在一起,要进行筛选(筛选方法自然很多)得到目的蛋白质.
质粒与目的基因构建的重组质粒在受体细胞中有哪两种存在形式
一种是和普通质粒一样游离存在于受体细胞的细胞质内另外一种是插入受体细胞基因组,以前病毒形式存在。
基因工程中的,重组质粒上的复制原点有什么作用啊?
是质粒在细菌中复制扩增所必需的元件。
省略构建重组质粒有何后果?会影响目的基因的复制,转录还是翻译?
省略构建重组质粒,会影响目的基因的翻译。翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达还包括转录)过程中的第二步(转录为第一步),翻译是根据遗传密码的中心法则,将成熟的信使RNA分子(由DNA通过转录而生成)中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻译为氨基酸序列。翻译过程需要的原料:mRNA、tRNA、20种氨基酸、能量、酶、核糖体。翻译的过程大致可分作三个阶段:起始、延长、终止。翻译主要在细胞质内的核糖体中进行,氨基酸分子在氨基酰-tRNA合成酶的催化作用下与特定的转运RNA结合并被带到核糖体上。生成的多肽链(即氨基酸链)需要通过正确折叠形成蛋白质,许多蛋白质在翻译结束后还需要在内质网上进行翻译后修饰才能具有真正的生物学活性。游离的碱基以mRNA为直接模板,tRNA为氨基酸运载体,核蛋白体为装配场所,共同协调完成蛋白质生物合成的过程。在翻译过程中mRNA上的每个三联体密码子对应tRNA上的一个三联体反密码子,且这个反密码子只对应一个氨基酸,但是一个氨基酸可有多组密码子(密码子具有简并性)来表示。一个激活的tRNA进入核糖体的A位(A位用于接受氨基酸,可记忆为Accept)与mRNA相配,肽酰转移酶在邻近的氨基酸间建立一个肽键,此后在P位(peptidyl-tRNA site,即肽酰基位点,也叫做“供点”)上的氨基酸离开它的tRNA与A位上的tRNA结合,核糖体则相对于mRNA向前滑动,原来在A位上的tRNA移动到P位上,原来在P位上的空的tRNA移动到E位(释放位点,记忆为Emission)上,然后在下一个tRNA进入A位之前被释放。当核糖体沿着mRNA分子移动到A位出现终止密码子时,没有相应的氨酰tRNA与之对应,一种释放因子(Release Factor,RF)与终止密码子及核糖体A位结合,另一种释放因子随之结合,改变肽酰转移酶的特异性,催化P位肽酰tRNA水解,从而使肽链从核糖体上释放。希望我能帮助你解疑释惑。
人类的基因组有多少,是不是最多的
当然不是最多的,无论是基因组的大小还是基因的数量上看,人类基因组都不是最多的.不过,人类基因组的一些转录后、翻译后的修饰是非常普遍,并且类型繁多,估计这些因素也是决定了人类的功能的.人类的基因组大小只有3.2Gb,而比如红豆杉的基因组就有11Gb左右.
什么是基因组大小与C值的矛盾?造成这种矛盾的因素有哪些?
C value paradox是指基因组大小和生物的复杂性之间的关系。从低等生物,如微生物,到高等生物,如人类,随着基因组复杂性的增加,基因组的大小也呈现增加的趋势。但是后来发现在生物复杂性相似的物种中,基因组大小可以相差非常大。例如,植物中拟南芥只有100多个Mb,而和同为高等植物的百合基因组大小可以相差100倍。造成矛盾的原因现在基本认为是倍性和重复序列的多少造成的。如果满意请采纳。谢谢支持!
为什么可以用kmer估计基因组的大小
比如长度为L的基因组,kmer大小为k,则k的所有可能个数为:(L -K)+1,通过评估kmer大小和数量分布就可以估算出物种大小。详细参考:http://bioinformatics.uconn.edu/genome-size-estimation-tutorial/
是否可以根据基因组大小或基因数量判断生物体的复杂程度,请举例说明
不可以。根据基因组的大小或基因的数量来判断生物体的复杂程度。基因组是指一个生物体内所有遗传信息的总和,人是自然界进化的最复杂的动物,人的基因组最大,但人的基因数量并不是最多的。他们之间可能有关系,但并不能直接用来判断。一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但最终科学家将人类基因总数定在3万左右,不超过4万,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,却能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义;也说明人类的基因较其他生物体而言,更有强大的作用,人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。
如何确定叶绿体基因组反向重复区的大小
如何确定叶绿体基因组反向重复区的大小叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA(cpDNA)是双链环状,缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核区。例如甜菜的叶细胞中每个类核体有4~8个拷贝的cpDNA,而每个叶绿体有4~18个类核体,每个细胞中约有40叶绿体。每个细胞总共有约6000cpDNA分子。在衣藻中(chlamydomonas)(单细胞生物)在细胞中一个叶绿体含有500~1500 cpDNA分子。 烟草和水稻(Oryza sativa)叶绿体全序列分析表明cpDNA基因组成有以下特点: 1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy seguence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy seguence, LSC)组成; 2.IRA和IRB长各10-24Kb,编码相同,方向相反。 3.cpDNA启动子和原核生物的相似,有的基因产生单顺反子的mRNA,有的为多顺反子mRNA; 4.尽管cpDNA大小各不相同,但基因组成是相似的,而且所有基因的数目几乎是相同的,它们大部分产物是类囊体的成分或和氧化还原反应有关(表20-7); 5.其tRNA基因(IRA、IRB上各有7个,LSC上有23个,共37个)中有内合子存在,最长者达2526bp,此和原核tRNA不同。有的内合子位于D环上,此和原核tRNA不同。有的内含子位于D环上,此和真核生物核tRNA内含子常位于反密码子环上也不相同; 6.所有叶绿体基因转录的mRNA都由叶绿体核糖体翻译。 并不是所有的叶绿体都含有IR,IR上含有4种rRNA基因,根据它们排列的情况叶绿体可分为3类:I类是IR 序列,4种rRNA各有2个拷贝,对称分布在IR上cpDNA也较大,如玉米、烟草、水稻、菠菜、地钱、衣藻(C.Yreinhardi),大部分叶绿体都属此类。II类:无反向重复IR,而在cpDNA一侧16S,23S以正向串联重复的形式(各3个拷贝)排列。如少数低等植物,裸藻(Euglena gracilis);III类:无IR和DR,rRNA只有一拷贝,如豌豆(Posum satirum)等。这可能在进化的过程中DNA片段的重复和倒位而造成的。
基因组的大小是随基因,染色体的复制等因素而改变的,如果时间越长基因组就会无限的增大吗?
不会无限增大,基因组一般的定义是单倍体细胞中的全套染色体为一个基因组,或是单倍体细胞中的全部基因为一个基因组,所以之多发生分裂的时候会加倍,而不会无限增大的。当然其特性也不会发生多少变化,更深入的,你可以参考其定义。
物种越高等其基因组就越大两者成正比关系
物种越高,等其基因组就越大,两者成正比关系。是正确的。“物种越高等,其基因组就越大,两者成正比关系”是一个常见的科学现象。简单来说,高等物种的基因组通常比低等物种更庞大。这是因为在进化过程中,高等物种经历了更多的基因复制、突变、选择和拼接等过程,从而形成了更加复杂的基因组。这些复杂的基因组也为高等物种提供了更多的形态、表型和适应性可能性,使它们能够更好地适应环境,生存下去。当然,基因组大小的增长并不是绝对的,也不是所有的高等物种都具有更大的基因组。不同物种之间存在许多特殊的进化适应策略,基因组大小仅仅是其中之一。物种基因的检验方法通常有以下几种:1、PCR法:PCR是利用酶的体外扩增技术。它通过特异的引物(小分子的DNA序列),扩增出DNA的某一特定序列,例如古菌、细菌等微生物的基因。2、水平转移实验法:水平转移实验法是将基因从一种物种转移到另一种物种的实验方法。通过将外源DNA质粒加入到宿主细胞中,使外源基因序列得以表达。这种方法能够用来研究基因序列的相似性和物种间的关系。3、单倍体检测法:通过收集物种体内的DNA样本,将其制备成单倍体样本,然后通过染色体分析、核酸杂交等方法,测定不同物种的基因组大小以及从中分离出特定的基因序列。4、基因测序技术:利用新一代测序技术,能够对物种基因组的整个序列进行测定,并对基因组的结构、进化发育等进行深入探究。5、确定物种的遗传距离:通过对物种基因组序列的分析,确定基因组序列的相似性,从而确定血缘关系及亲缘关系的距离,这也是判定物种基因组的方法之一。这些方法都是常用的物种基因的检验方法。不同的方法有不同的适用场景和检验效果,选择合适的方法进行检验,能够为物种基因的研究和应用提供有效的支持。
毕赤酵母基因组大小
约为12Mb。只有6种染色体,比其他复杂生物要小得多,不能通过性繁殖来遗传,在基因组上的冗余减少,使基因组相对较小。毕赤酵母是一种古老的啤酒酵母,常用于甜食和发酵制作中,具有12000多种基因,可控制这种原核真菌的多种功能,基因组包含碳水化合物代谢、信号转导、细胞壁和酶的合成,以及酿酒工艺中的众多酵素的合成。
果蝇的基因组大小是多少呢?
果蝇是4对染色体 共有1万至1.5万个基因,
鸭子基因组大小
1900bp。鸭子基因组是由八个外显子和七个内含子组成,大小是1900bp。鸭,雁形目鸭科(Anatidae)鸭亚科(Anatinae)水禽的统称,或称真鸭。物种简介全国三大名鸭:高邮鸭、北京鸭、绍兴鸭。
基因组大小单位Mb是多少,包括多少碱基对啊
1Mb=1,000,000bp1、M是millone的缩写,源于意大利早期意大利百万富翁(millone)(意大利语里米尔),来自米勒(mille),再加上“suffix-one”的后缀one,就形成了millone,通常缩写为m或M。2、碱基对(bp):一对相互匹配的碱基(即A—T,G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。扩展资料1、kb是DNA的一个常用的长度单位,指某段DNA分子中含有一千个碱基对,英文全称为Kilobase(kb),即千碱基对。生物学上描述DNA常用的kb、nt、bp表示。1kb=1000bp2、碱基对的意义:形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。3、染色体是由脱氧核糖核酸、蛋白质和少量核糖核酸组成的线状或棒状物,是生物主要遗传物质的载体。在细胞间期核中,以染色质丝形式存在。在细胞分裂时。染色质丝经过螺旋化、折叠、包装成为染色体,为显微镜下可见的具不同形状的小体。参考资料来源:百度百科-KB参考资料来源:百度百科-碱基对参考资料来源:百度百科-百万
大肠杆菌的基因组大小是多少bp
1、分析得知:全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;平均的基因大小有27kbp;其中G+C含量偏低,仅占38%,而2号染色体中G+C的含量最多;到目前仍有9%的碱基对序列未被确定,19号染色体是含基因最丰富的染色体,而13号染色体含基因量最少等等(具体信息可参见cmbi特别报道:生命科学的重大进展)。2、目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能,在已知基因中酶占10.28%,核酸酶占7.5%,信号传导占12.2%,转录因子占6.0%,信号分子占1.2%,受体分子占5.3%,选择性调节分子占3.2%,等。发现并了解这些功能基因的作用对于基因功能和新药的筛选都具有重要的意义。3、基因数量少得惊人:一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但Celera公司将人类基因总数定在2.6383万到3.9114万个之间,不超过40,000,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,而能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义,也说明人类的基因较其他生物体更"有效",人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。这将对我们目前的许多观念产生重大的挑战,它为后基因组时代中生物医学的发展提供新的非凡的机遇。但由于基因剪切,EST数据库的重复以及一些技术和方法上的误差,将来亦可能人类的基因数会多于4万。4、人类单核苷酸多态性的比例约为1/1250bp,不同人群仅有140万个核苷酸差异,人与人之间99.99%的基因密码是相同的。并且发现,来自不同人种的人比来自同一人种的人在基因上更为相似。在整个基因组序列中,人与人之间的变异仅为万分之一,从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上的区别。5、人类基因组中存在"热点"和大片"荒漠"。在染色体上有基因成簇密集分布的区域,也有大片的区域只有“无用DNA”——不包含或含有极少基因的成分。基因组上大约有1/4的区域没有基因的片段。在所有的DNA中,只有1%-1.5%DNA能编码蛋白,在人类基因组中98%以上序列都是所谓的“无用DNA”,分布着300多万个长片断重复序列。这些重复的“无用”序列,决不是无用的,它一定蕴含着人类基因的新功能和奥秘,包含着人类演化和差异的信息。经典分子生物学认为一个基因只能表达一种蛋白质,而人体中存在着非常复杂繁多的蛋白质,提示一个基因可以编码多种蛋白质,蛋白质比基因具有更为重要的意义6、男性的基因突变率是女性的两倍,而且大部分人类遗传疾病是在Y染色体上进行的。所以,可能男性在人类的遗传中起着更重要的作用。7、人类基因组中大约有200多个基因是来自于插入人类祖先基因组的细菌基因。这种插入基因在无脊椎动物是很罕见的,说明是在人类进化晚期才插入我们基因组的。可能是在我们人类的免疫防御系统建立起来前,寄生于机体中的细菌在共生过程中发生了与人类基因组的基因交换。8、发现了大约一百四十万个单核苷酸多态性,并进行了精确的定位,初步确定了30多种致病基因。随着进一步分析,我们不仅可以确定遗传病、肿瘤、心血管病、糖尿病等危害人类生命健康最严重疾病的致病基因,寻找出个体化的防治药物和方法,同时对进一步了解人类的进化产生重大的作用。9、人类基因组编码的全套蛋白质(蛋白质组)比无脊椎动物编码的蛋白质组更复杂。人类和其他脊椎动物重排了已有蛋白质的结构域,形成了新的结构。也就是说人类的进化和特征不仅靠产生全新的蛋白质,更重要的是要靠重排和扩展已有的蛋白质,以实现蛋白质种类和功能的多样性。有人推测一个基因平均可以编码2-10种蛋白质,以适应人类复杂的功能。
什么影响基因组大小
细胞大小:细胞大小与基因组大小成正比环境选择压力限制细胞大小,进而限制基因组大小
番茄基因组大小
番茄基因组大小为799.09Mb。中国农业大学园艺学院研究组利用多种新测序技术和优化的组装算法,获得了精准度高、序列完整番茄基因组大小为799.09Mb。
人类全基因组测序?
问题一:个人全基因组重测序需花费多少钱? 人类基因组大小3G, 重测序一般需要测定至少20x以上的数据(数据乘数高的话对于信息分析是有海的),也就是说一般需要测定60G的数据,如果1G按照5000元算的话,需要30万元。 不过要看你的目的,现在illumina推出的my-seq测1个人的好像只需要几万。 问题二:人类基因组测序:目前到底发现了多少个基因 全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;平均的基因大小有27kbp 目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能 基因数量少得惊人:一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但Celera公司将人类基因总数定在2.6383万到3.9114万个之间,不超过40,000,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,而能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义,也说明人类的基因较其他生物体更"有效",人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。 问题三:个人基因组测序有哪些意义 理论上说,知道了序列,就可以确定这个人的基因,从而能够知道这个人的表型特征,或者对那些病是易感的,以后有可能得什么病,以及对将来对孩子的遗传等等… 但目前来说,个人的全基因组还没有什么用,因为现在我们对基因组中序列的信息了解的还太少,如SNP相关疾病,多基因遗传病等。在科研上全基因组测序,可以为我们提供数据库,以便分析相关的特征。 随着代号为AK1的韩国人的测序成功,目前世界上只有5个人进行了,全基因组测序,另外四个是:一名非洲优鲁巴人、基因研究的先驱詹姆斯u30fb沃森、克里格u30fb文特和一名代号为YH的中国人。 问题四:“人类基因组计划”对人类全部染色体的基因进行测序,你认为该计划测定人类染色体数应该是( )A.16 人体内每个细胞内有23对染色体;包括22对常染色体和一对性染色体,性染色体包括:X染色体和Y染色体.含有一对X染色体的受精卵发育成女性,而具有一条X染色体和一条Y染色体者则发育成男性.即男性染色体的组成:22对常染色体+XY,女性染色体的组成:22对常染色体+XX,因此人类基因组计划要测定的人类染色体数应该是22条常染色体和两条性染色体X和Y,即24条.故选:B.
硅藻基因组大小
硅藻是一类单细胞的海洋硅质浮游植物,其基因组大小因不同的物种而异。已经测定的硅藻基因组大小范围较广,从22Mb到106Mb不等。以下是一些典型硅藻基因组的大小:1、假海鞘:34Mb。2、三角褐指藻:27Mb。3、中肋骨条藻:42.8Mb。4、隐小环藻:23.9Mb。5、硅壳果:214Mb。
基因组大小与物种进化等级高低间有什么规律?
基因组的大小与生物的复杂程度是否有关系基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量.在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小.通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value.通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量.不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述.不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力.
酵母菌基因组大小是多少?
酿酒酵母 12Mb = 1.2X10^7bp有16条染色体
蓝细菌基因组大小,有多少个基因
细菌基因组的变化很大,基因组大小从几百kb(千碱基对)到十几个Mb(兆碱基对),其变化幅度超过了20倍,以下是几种细菌基因组的大小: 分类 基因组大小范围(Kb) 真细菌 650-13200 革兰氏阴性菌 650-7800 革兰氏阳性菌 1600-11600 兰细菌 3100-13200 枝原体 650-1800 古细菌 1600-4100 但在我们的实验中,一般也只能提取得到20-30Kb左右大小,可能是DNA太长容易断裂;以下的文献列举了12种真细菌和4种古细菌的16个完整基因组的大小,供参考 。 http://www.scienceinchina.com/zk/zc/0001/zc0099.htm
基因组大小单位Mb是多少,包括多少碱基对啊 不好意思,没分了,
在国际单位制词头中,大写M代表Mega,即一百万(10的6次方) . b是指base或base pair,即碱基或碱基对.所以,1Mb是一百万个碱基对.
基因组大小的c-value怎样估算总碱基数
基因组大小(英语:Genome size)是指一个基因组中所拥有的DNA含量,一般以重量计算,单位通常是皮克(10-12克),写成pg;有时也用道耳顿;或是以核苷酸碱基对的数量表示,单位为百万计,写成Mb或Mbp。1pg等于978Mb。
基因组测序的测序深度一般是多少
基因组测序的测序深度一般是10X。 测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M,测序深度为10X,那么获得的总数据量为20M。 基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等。
地衣芽孢杆菌基因组DNA的大小是多少?
NCBI上查询Bacillus licheniformis。大小在4.16-4.32Mb(10^6 bp)。
人类全基因组测序
问题一:个人全基因组重测序需花费多少钱? 人类基因组大小3G, 重测序一般需要测定至少20x以上的数据(数据乘数高的话对于信息分析是有海的),也就是说一般需要测定60G的数据,如果1G按照5000元算的话,需要30万元。 不过要看你的目的,现在illumina推出的my-seq测1个人的好像只需要几万。 问题二:人类基因组测序:目前到底发现了多少个基因 全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;平均的基因大小有27kbp 目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能 基因数量少得惊人:一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但Celera公司将人类基因总数定在2.6383万到3.9114万个之间,不超过40,000,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,而能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义,也说明人类的基因较其他生物体更"有效",人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。 问题三:个人基因组测序有哪些意义 理论上说,知道了序列,就可以确定这个人的基因,从而能够知道这个人的表型特征,或者对那些病是易感的,以后有可能得什么病,以及对将来对孩子的遗传等等… 但目前来说,个人的全基因组还没有什么用,因为现在我们对基因组中序列的信息了解的还太少,如SNP相关疾病,多基因遗传病等。在科研上全基因组测序,可以为我们提供数据库,以便分析相关的特征。 随着代号为AK1的韩国人的测序成功,目前世界上只有5个人进行了,全基因组测序,另外四个是:一名非洲优鲁巴人、基因研究的先驱詹姆斯u30fb沃森、克里格u30fb文特和一名代号为YH的中国人。 问题四:“人类基因组计划”对人类全部染色体的基因进行测序,你认为该计划测定人类染色体数应该是( )A.16 人体内每个细胞内有23对染色体;包括22对常染色体和一对性染色体,性染色体包括:X染色体和Y染色体.含有一对X染色体的受精卵发育成女性,而具有一条X染色体和一条Y染色体者则发育成男性.即男性染色体的组成:22对常染色体+XY,女性染色体的组成:22对常染色体+XX,因此人类基因组计划要测定的人类染色体数应该是22条常染色体和两条性染色体X和Y,即24条.故选:B.
流式细胞仪估计基因组大小估计准确吗
基因组大小(sizeofgenome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量。在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小。通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value。通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量。不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如vihole所述。不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力。关于动物的基因组含量可以在Animalgenomesize网站查到:Ref1:/releases/2003/05/030526103731.htm
GenomeScope 2.0 评估基因组大小、杂合度和重复序列
GenomeScope 是2017年发表在 bioinformatic 的一个工具,这个工具的目的就是处理一些高复杂度的基因组,比如说高杂合度或者基因组非常大的物种。GenomeScope只能预测二倍体基因组,GenomeScope 2.0可以预测多倍体物种。 安装 在软件的安装目录下, genomescopre.R 文件是核心的运行脚本,用法如下 可选参数: - i input histogram_file (from KMC or jellyfish) ,如jellyfish软件产生的kmer频数分布数据 - o output_dir - k kmer length used to calculate kmer spectra [default 21] ; 必选参数: - p PLOIDY, --ploidy PLOIDY ploidy (1, 2, 3, 4, 5, or 6) for model to use [default 2] ; - m MAX_KMERCOV, --max_kmercov MAX_KMERCOV optional maximum kmer coverage threshold (kmers with coverage greater than max_kmercov are ignored by the model) ; - n NAME_PREFIX, --name_prefix NAME_PREFIX optional name_prefix for output files ; - l LAMBDA, --lambda LAMBDA, --kcov LAMBDA, --kmercov LAMBDA optional initial kmercov estimate for model to use ; 示例: 在运行过程中,终端会输出如下信息 het 表示杂合度,为1.65%; len 表示基因组大小,为376M左右。 输出目录output_p3文件列表如下 通常关注summary.txt, transformed_linear_plot.png这2个文件。 内容如下: 在该文件中,会给出杂合度,基因组大小,重复片段长度等详细信息。 结果分为三列: 有疑问,可以对照模型进行检验。 K-mer覆盖度-频数分布图如下: kcov指的是杂合峰的覆盖度。可以看到使用数据预测K-mer最低深度峰在18.4X处。 一般情况下杂合度大于1%就会存在一个高于主峰的杂合峰。 基因组越大,杂合度也大,重复片段越大,该物种的组装难度就越大。 讨论: 基因组预测大小和参数 Max kmer coverage 密切相关。GenomeScope默认会过滤掉出现10,000次以上的kmers,避免细胞器基因组的影响,如果你觉得基因组小了,那么就把数值调整的大一点。 基因组survey介绍了如何通过jellyfish统计k-mer然后绘制k-mer分布图研究基因组的方法。 对于不同的基因组杂合度,kmer分布如下 https://github.com/tbenavi1/genomescope2.0
人类的基因组有多少,是不是最多的?
当然不是最多的,无论是基因组的大小还是基因的数量上看,人类基因组都不是最多的。不过,人类基因组的一些转录后、翻译后的修饰是非常普遍,并且类型繁多,估计这些因素也是决定了人类的功能的。人类的基因组大小只有3.2Gb,而比如红豆杉的基因组就有11Gb左右。人类的
鸡的基因组大小约有多少个碱基
Gallus gallus(原鸡)33条染色体 1,074.96 X10的六次方个碱基 17,529个基因 16,868个蛋白
随着人类基因组计划研究 人类基因组共有多少个基因
人类基因组计划得出的结果是人的基因组大小约为3000Mb.即30亿个碱基对.这里的Mb表示一兆碱基对.但是由于基因有长有短,有些基因又尚未被发现,所以,尚不知道人的基因具体有多少个,只知道大概有10万个基因(等位基因算作一个,因为一点微小的变化就造成一个等位基因,如果分别算就太多了.所以应该说是10万个基因座比较准确).
如何在NCBI上按基因组大小查看已经测序的物种
前两天Cell上发表了目前已经组装出来的最大的物种的基因组的大小,是40G,一种鱼类。 那么,有没有什么网站是可以看到所有的已经测序且组装过的物种的基因组的大小的排序呢? 答案当然是:有! 是在NCBI上Genome下的基于BioProject的一个功能,可以根据自己的需要选择排序的顺序,比如基因组的大小、物种的名字、物种所属的属等。非常的方便! 直接放网站: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/#!/overview/ PS:物种基因组大小(genome size)和已经组装的基因组大小(assembled genome size)是不一样的哦,措词需要严谨。在我们中文翻译到英文的时候,有时候会不注意这些细节问题。所以说还是要多看多写,才能发现错误的地方~!
请问小鼠,大鼠和猪基因组大小分别是多少bp?
无论是手工提取还是用试剂盒提取,比如promega,Qiagen等等,基因组在提取过程中都不可能完整,根据提取方式不同,提取的DNA片段一般在15k-30k之间。
典型的叶绿体基因组有多大
叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在120kb到217kb之间,平均165Kb。一般1.0~1.3Kb/个基因,大概150个左右的基因,其中大约50个左右的蛋白基因,其他主要是tRNA基因和rRNA基因。
鸡的基因组大小约有多少个碱基
Gallus gallus(原鸡)33条染色体 1,074.96 X10的六次方个碱基 17,529个基因 16,868个蛋白
基因组最小的动物病毒是什么
病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此,痘病毒对宿主的依赖性较乙肝病毒小得多。
细菌基因组大小
不测序没法知道基因组大小的.不能体外培养,可以考虑将其插入已知基因组的质粒中培养,再测序.拿到基因组测序图,后面问题就都解决了.
四角蛤蜊基因组大小
基因组大小约为1.21Gb(千兆碱基对)。四角蛤蜊(scientificname:Sinonovaculaconstricta)是一种常见的贝类,这一数据来源于2021年发表在《MolecularEcologyResources》杂志上的一篇研究论文,该研究利用IlluminaHiSeqXTen测序技术对四角蛤蜊的基因组进行了测序,并对其基因组大小进行了估算。
基因组-genome survey(2)
在实际基因组概貌调查中,流式细胞术、染色体基数观察和基因组调查测序往往是同时进行的。 在此,我们主要介绍下基因组调查测序与K-mer分析 Survey一般测序量为预估基因组大小的30-50X(二代测序)。 通过survey我们可以知道如下信息: (1)基因组大小 (2)基因组杂合度 (3)重复序列比例 (4)GC含量分布 (1)什么是K-mer 从一段连续序列中迭代地选取长度为K个碱基的序列,若每条序列的长度为L,那么可以得到(L-K+1)个K-mer。 (2)K-mer估计基因组大小(K-mer有效深度大于20且K-mer种类数要大于基因组) 在数据量一定的情况下,K-mer出现的频数是服从泊松分布(偏态分布,可以理解为最优解,想想卖馒头的例子)的,K-mer频率分布曲线的峰值作为其期望测序深度。 基因组大小计算:G=Knum/Kdepth (1) 基因组的杂合区段的K-mer深度较纯合区段降低50% 例如,来自基因组的一个17-mer片段,如果没有杂合性,其覆盖度为2;如果有一个杂合位点,则这个片段将会产生2条序列,构成不同的17-mer。
下列哪些基因组特性随生物的复杂程度增加而上升?()
下列哪些基因组特性随生物的复杂程度增加而上升?() A.基因组大小B.基因数量C.基因组中基因的密度D.单个基因的平均大小正确答案:基因组大小;基因数量;单个基因的平均大小
基因测序哪些文章影响因子比较低
全基因组测序项目发表文章档次的三个影响因素随着高通量测序技术的迅速发展及成本的不断降低,物种全基因组测序项目从最初耗时10年并花费几十亿美元的人类基因组计划到现在仅需几个月、花费几百万甚至几十万即可完成。因此,物种全基因组测序项目已成为众多实验室或研究者的首选课题。自2013年3月至今已有三四十个物种的基因组测序成果相继发表,但文章的档次良莠不齐,有的项目同时在Nature杂志上发表两篇文章,而有的项目只发表影响因子为10以内的文章。同样是全基因组测序项目的研究成果,是什么原因导致如此大的差异呢?通过对大量物种基因组测序文章的解析,我们将与大家分享几点心得。首先,组装结果的差异是否直接导致文章发表档次的高低?这通常是研究者开展全基因组项目时比较关注的因素,然而事实并非如此。组装结果是评价一个物种基因组项目结果好坏的重要的指标,如Scaffold N50的长度、基因组的覆盖率等。其中,Scaffold N50是指通过shotgun文库测序的数据及mate pair文库的数据组装后得到的所有Scaffold按照长度从大到小的顺序依次累加,待总和为所有Scaffold总长一半时遇到的那个Scaffold长度。因此,Scaffold N50越长说明组装结果越好。最理想的组装结果是物种有几条染色体就组装得到几个Scaffold,即每个Scaffold都是一条染色体。基因组覆盖率是指组装得到的序列占物种基因组大小的比例,假如一个物种的基因组大小是1Gb,组装得到0.8Gb,则基因组覆盖率为80%。然而,由于物种基因组中重复序列的存在及基因组杂合度的影响,大型真核生物的全基因组测序项目很难达到100%的覆盖率。纵观全基因组测序项目发表的文章,小麦基因组项目连续发表3篇Nature文章,而Scaffold N50只有19Kb及60多Kb;发表在Nature杂志的轮虫基因组Scaffold N50为仅259Kb。然而,发表在Nature Communication杂志的双峰驼基因组Scaffold N50高达2Mb多;发表在GB杂志的中国莲基因组Scaffold N50达3.4Mb。从这些案例中不难看出,组装结果对文章档次的影响并非至关重要的。当文章的其他方面如分析等处于同等水平时,更好的组装结果会使文章锦上添花,然而反之未必亦然。其次,物种基因组的大小是否直接导致文章发表档次的高低?基因组大小为几Gb的小麦基因组、大麦基因组,甚至十几Gb的云杉基因组的发表,可能会给很多研究者造成一种误区,即目前小基因组的文章相对于大的基因组没有竞争力。然而,事实也并非如此。好的文章主要取决于选材的好坏及整个故事的完整性,并非受基因组大小的直接影响。例如,轮虫基因组只有244Mb,由于研究人员通过全基因组测序解析了蛭形轮虫中缺少减数分裂现象的机理并为后续深入研究奠定了基础,这一研究成果发表于Nature杂志。桃子基因组为265Mb,基因组测序成果发表于Nature Genetics杂志;剑尾鱼基因组为669Mb,基因组测序成果发表于Nature Genetics杂志;棕榈基因组为1.8Gb,基因组测序成果近期同时发表两篇Nature文章。第三,研究的物种与其他研究者相同但进度落后,是否无法发表高水平文章?答案当然是否定的。随着物种测序项目越来越多,出现这种情况的几率也越来越大,只要双方的研究思路不同,能够挖掘到有意义的分析角度并很好地阐明问题,物种基因组测序就不再怕重复。例如,2012年先后发表于Nature Genetics(2012.08)及Nature(2012.12)的两篇棉花基因组测序的文章,今年先后发表于Nature(2013.04)及Genome Research(2013.07)的两篇腔棘鱼文章,及今年5月分别发表的挪威云杉和白云杉基因组文章。
里氏木霉(T.reesei)的基因组
T.reesei是工业上纤维素酶和半纤维素酶的主要生产来源,这些酶用于将生物质解聚成简单的糖类,再转化成化学中间体和生物燃料例如乙醇。对T.reesei的基因组进行测序(Martinez et al.,2008),将reads组装成89个scaffold,大小为34Mbp,包含9219个基因。出乎意料的是,相比其他已测序的能降解植物细胞壁多糖的真菌,T.reesei基因组中编码的纤维素酶和半纤维素酶基因数目较少。许多T.reesei的碳水化合物活性酶编码基因并非随机分布,而是成簇地分布在与其他粪壳菌纲(Sardariomycetes)真菌的共线性区域之间。7.2.1.1 T.reesei基因组的特点利用鸟枪法对T.reesei的基因组进行测序,构建了3个文库,插入片段的大小分别为3kb,8kb和40kb,覆盖度为9倍,共得到 433863个 reads,利用 Jazz,Phred/Phrap/Consed等软件将这些数据组装成89个scaffold和97个contig,大小约为34Mb(Martinez et al.,2008)。比几个核型分析预测的基因组大小约大2.9%(Carter et al.,1992;Man-tyla et al.,1992;Herrera-Estrella et al.,1993),与物理方法预测的大小几乎一致。核型分析所用的遗传标记和在Genbank中发布的所有蛋白和RNA序列在该基因组中都能找到。因此,推测该基因组序列代表了T.reesei 99%以上的基因组信息。在基因组中发现了类似于I和II型转座子的重复序列,但都存在多个终止密码子。造成缺少活跃转座子的原因可能是由于T.reesei存在活跃的防御机制,例如重复诱导的点突变。这些转座子总数不超过基因组序列的1%,是目前已知的出现频率最低的真菌之一。在T.reesei的7个scaffold末端存在重复6核苷酸序列TTAGGG,该序列与粉红面包霉(Neurospora crassa)端粒重复序列相同。预测T.reesei 基因组含有9129个基因,与N.crassa中的基因数目相当(Galagan et al.,2003),但是比禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum,其有性态为Gibberella zeae)预测的基因数少了接近2500个(Cuomo et al.,2007)。T.reesei基因的平均大小为1793 bp,每个基因平均含有3.1个外显子,外显子的平均长度508 bp,内含子平均大小120 bp。7.2.1.2 T.reesei保守共线性为了解环境因素对基因组进化的影响,比较了T.reesei,F.graminearum和N.crassa共线性的区域。根据比较结果,推测许多基因组片段中基因的顺序在该种类出现时就已经改变,共线性的区段间存在很大的间隙(Galagan et al.,2005)。在很多情况下,T.reesei和其他粪壳菌纲(Sordariomycetes)真菌中这种间隙是很保守的。非共线性的区域通常包含对菌株适应性重要的基因(Galagan et al.,2005;Machida et al.,2005;Nierman et al.,2005)。另外一个值得注意的特点是在3个真菌(T.reesei,F.graminearum和N.crassa)中存在一些随种类出现就已发生的染色体重排,表明了基因组的高度动态性。7.2.1.3 T.reesei的蛋白结构域与盘菌亚门(Pezizomycotina)的其他真菌相比,T.reesei基因组中已知功能的蛋白质数量较少,与生物质降解有关的蛋白组成也不一样。T.reesei缺少与侵染和降解植物活体组织相关的蛋白,例如果胶裂解酶和果胶酯酶,这与其腐生习性相符。而且,在T.reesei中没有发现鞣酸酶和阿魏酸酯酶,表明其在半纤维素降解方面存在缺陷。7.2.1.4 T.reesei和其他真菌中的碳水化合物活性酶在CAZy数据库中,碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes,CAZymes)被分为不同的级别和种类。能切割、构建和重排寡糖和多糖的CAZymes在真菌生物学中扮演重要的角色,对优化生物质的降解也同样重要。尽管T.reesei是植物多糖的有效降解者和降解研究体系中的重要模式菌,但是在其基因组中含有的糖苷水解酶(GH)编码基因较少。T.reesei中仅含有200个GH编码基因,比植物病原菌Magnaporthe grisea(231个)和F.graminearum(243个)都少。T.reesei中含有103个糖基转移酶,接近粪壳菌纲(Sordariomycetes)中该类酶的平均数(96个)。在粪壳菌纲中,该酶类的变异性比GH小。这种趋势在世系内外皆存在,表明糖基转移酶控制的是比较基础性的胞内生命活动,其组成变化所反映的是物种的差异而非环境压力的不同。与植物多糖解聚过程有关的酶,通常携带一个碳水化合物结合组件(Carbohydrate-Binding Module,CBM),该组件连接在催化区上。在已知的粪壳菌纲中,T.reesei的基因组中含CBM的蛋白数量最少。同样,T.reesei中碳水化合物酯酶的数量也是粪壳菌纲中最少的。包括T.reesei在内,粪壳菌纲真菌中相对缺少多糖裂解酶基因,而散囊菌纲真菌(Eurotiomycetes)含有的多糖裂解酶数量较多,平均有18个。在单细胞子囊菌纲(Ascomycetes)中没有发现多糖裂解酶。出人意料的是,在T.reesei基因组中仅发现了7个编码已知纤维素酶(内切葡聚糖酶和纤维二糖水解酶)的基因,在表7.4列出的能降解植物细胞壁的真菌中,T.reesei的纤维素酶基因的数量最少。如果加上GH61蛋白家族,这种趋势更加明显。半纤维素包含不同种类的多糖,完全降解它们需要一系列的酶。T.reesei基因组仅含有16个半纤维素酶基因,也是在真菌中数量较少的。同样,其分解果胶的酶数量为5个,也是在植物细胞壁降解真菌中数量较少的(Martinez et al.,2008)。表7.4 真菌基因组中的纤维素水解酶注:a纤维素种类:CBH1,外切纤维二糖水解酶Ⅰ,GH7;CBH2,外切纤维二糖水解酶Ⅱ,GH6;EG1,内切葡聚糖酶Ⅰ,GH7;EG2,内切葡聚糖酶Ⅱ,GH5_5;EG3,内切葡聚糖酶Ⅲ,GH12_1;EG4,糖苷水解酶家族,Cel61,GH61;EG5,内切葡聚糖酶基因Ⅴ,Cel45。7.2.1.5 蛋白分泌T.reesei能非常有效地分泌胞外酶,有些工业菌株1L培养液可以产生100g胞外蛋白(Cherry et al.,2003)。在T.reesei中发现了与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)分泌途径中起作用蛋白的同源蛋白。这些蛋白多数是单拷贝,与酵母蛋白的相似性比与哺乳动物源相似蛋白的相似性更高。T.reesei含有三个与酵母的蛋白质二硫键异构酶(Pdi lp)同源的蛋白,这可能与T.reesei分泌的纤维素酶多数含有二硫键有关(Divne et al.,1994)。酵母der1和ufd1基因在T.reesei中都存在两个直系同源基因,它们与内质网相关的蛋白降解(ERAD)途径有关。此外,在T.reesei中发现了大多数已知ERAD组分的同源蛋白,但在Aspergillus niger基因组中却缺少ERAD组分同源蛋白(Pel et al.,2007)。这些数据表明,在T.reesei中,ERAD途径似乎比内质网分泌途径更过剩。S.cerevisiae中参与蛋白运转相关的蛋白直系同源物大多数能在T.reesei中找到,它们多数是单拷贝。酵母缺少与哺乳动物GTPase蛋白Rab2,Rab4,Rab5,Arf6和Arf10对应的蛋白,这些信号蛋白参与膜融合或囊泡的出芽,而在T.reesei和N.crassa中含有这些蛋白的直系同源物。酵母中质膜分泌小泡受体t-SNARE蛋白Sso1p,在T.reesei中有两个同源蛋白,研究表明,这两个Sso1同源蛋白具有不同的功能(Valkonen et al.,2007)。综上所述,这些研究表明T.reesei的膜运输系统比在S.cerevisiae中的更加多样化。7.2.1.6 T.reesei的CAZyme基因簇T.reesei中许多CAZyme的编码基因在基因组中不是随机分布的。有研究表明,9个与纤维素和半纤维素降解有关的蛋白编码基因共同分布在基因组的几个区域。通过对T.reesei基因组中所有CAZyme的编码基因定位发现,316个CAZyme中的130(41%)分布在25个不连续的区域,这些区域大小从14 kb到275 kb不等(总共约2.4Mb,约占基因组的7%)。这些区域中含有CAZyme基因的密度比随机分布基因密度大5倍。通过对基因簇中基因数量的分析,130个CAZyme的95个(73%)分布在基因组共线性区域的间隙。而这95个中的69个(72%)在F.graminearum含有直系同源物。有16个CAZyme与F.graminearum共线性,表明基因迁移是这些基因簇形成的主要因素,而基因复制的作用较小。在同一基因簇中的CAZyme基因很少是出自同一个CAZyme家族,这也表明基因的迁移在这些基因簇形成过程的作用比基因复制更大。CAZyme基因成簇分布表明其特殊的生物学功能,在基因簇中的CAZyme基因有70%编码GH。基因组中有24%的糖基转移酶基因和46%的GH基因分布在这些基因簇内,表明这些基因簇中的CAZyme基因大多数参与多糖的降解。与植物细胞壁降解有关的基因多数分布在富含CAZyme的区域的现象,也证实了这一点。T.reesei中有4个类似于扩展蛋白的基因(Saloheimo et al.,2002),其中3个分布在这些基因簇内。有趣的是,少量与真菌细胞壁合成有关的糖基转移酶编码基因也出现在CAZyme基因簇中,比如甘露糖基转移酶、几丁质合酶、a-糖基转移酶和β-糖基转移酶(Cabib et al.,2001)。结合对槐二糖和纤维素诱导的T.reesei转录组数据进行分析(Foreman et al.,2003),将槐二糖和纤维素诱导表达基因定位到基因组上,发现尽管不是所有成簇分布的GH基因都共表达,但是确实发现了一些相邻基因共表达的例子。例如,在T.reesei基因组第29条scaffold的CAZyme基因簇区,外切纤维二糖水解酶cel7a、纤维素膨胀因子和木聚糖酶4在槐二糖和纤维素诱导下同时表达。上述结果表明,CAZyme基因成簇分布具有重要的意义。由于这些区域与其他真菌没有共线性的信号,表明在T.reesei中这些基因发生了重排,这种重排对其在进化上是有利的。在几个CAZyme基因密度高的区域也包含与次级代谢有关的蛋白编码基因。在25个CAZyme基因簇中,有5个基因簇都包含一个聚酮合酶(PKS)或非核糖体肽合成酶(NRPS)基因。另外,与其他Sordariomycetes真菌相比,T.reesei中保留了大多数非核糖体肽合成酶(NRPS)的旁系同源基因。
人体30亿个碱基对的基因组,容量有多少兆
人类基因组计划得出的结果是人的基因组大小约为3000Mb.即30亿个碱基对.这里的Mb表示一兆碱基对.但是由于基因有长有短,有些基因又尚未被发现,所以,尚不知道人的基因具体有多少个,只知道大概有10万个基因(等位基因算作一个,因为一点微小的变化就造成一个等位基因,如果分别算就太多了.所以应该说是10万个基因座比较准确).
基因组dna大小为什么是21kb
采用在细胞核被裂解之前去除细胞质中的茶多酚和蛋白质,而后用SDS裂解细胞核,异丙醇和乙醇沉淀基因组DNA的方法,分别从不同茶树品种新梢、干梢及冰冻新梢中成功地提取和纯化基因组DNA,并对其DNA的得率和质量进行了鉴定。DNA的得率在205~963ng/mg鲜重之间,所得到的DNA样品片段均大于21kb,适宜于进行限制性酶切和RAPD反应。实践证明,上述提取富含酚类物质植物基因组DNA的方法,不仅迅速简单,而且经济有效。
基因数目相同,DNA大小由什么决定?
一般来说高等生物的基因组大小也就是DNA碱基数目的大小要大一点,低等生物的要小一点,比如细菌的基因组大小约为10的六次方这个数量级,人的是10的9次方数量级,但也不是绝对,比如阿米巴变形虫的是10的11次方这个数量级,也就是说基因组的大小因物种而异,决定因素暂时没有被报道,但是一般认为功能越复杂的生物基因组的越大。希望能有帮助~~
分子克隆获取目的基因时什么时候用酶切,什么时候用PCR?
连接T-vector之前进行PCR得到带A的PCR产物,然后进行转化,对expression vector和质粒进行相同酶切,连接,转化。在整个clone中有时会用PCR来鉴定,如目的基因是否转入进感受态细胞。
为什么基因克隆和PCR如此重要?
基因克隆和PCR重要:克隆的目的就是增加DNA的量,保证成功率。分子克隆和传统克隆完全不是一个意思。PCR主要是针对目的DNA进行扩增,然后把其转化到克隆载体(可以理解成某种工程微生物)中,这个载体相当于复制了很多份,保存的每一份都称为一个克隆。一般来说基因克隆技术包括把来自不同生物的基因同有自主复制能力的载体DNA在体外人工连接,构建成新的重组DNA,然后送入受体生物中去表达,从而产生遗传物质和状态的转移和重新组合。因此基因克隆技术又称为分子克隆、基因的无性繁殖、基因操作、重组DNA技术以及基因工程等。
基因组大小单位Mb是多少,包括多少碱基对啊
1Mb=1,000,000bp1、M是millone的缩写,源于意大利早期意大利百万富翁(millone)(意大利语里米尔),来自米勒(mille),再加上“suffix -one”的后缀one,就形成了millone,通常缩写为m或M。2、碱基对(bp):一对相互匹配的碱基(即A—T, G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。扩展资料1、kb是DNA的一个常用的长度单位,指某段DNA分子中含有一千个碱基对,英文全称为Kilobase(kb),即千碱基对。生物学上描述DNA常用的kb、nt、bp 表示。1kb=1000bp2、碱基对的意义:形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。3、染色体是由脱氧核糖核酸、蛋白质和少量核糖核酸组成的线状或棒状物,是生物主要遗传物质的载体。在细胞间期核中,以染色质丝形式存在。在细胞分裂时。染色质丝经过螺旋化、折叠、包装成为染色体,为显微镜下可见的具不同形状的小体。参考资料来源:百度百科-KB参考资料来源:百度百科-碱基对参考资料来源:百度百科-百万
人类基因组大小多少M
3G个序列,每个序列需要两位二进制数表示,所以总共6Gb,由位与字的换算相差8,总共算下来大约750MB。也就是只需要一张光盘,就可以记录一个人的生命所有遗传信息。还有,男人比女人要长一点,准确数值是男人734MB,女人720MB。
有些基因组为什么非常大而另一些却很小?
人体是一个非常复杂的组合体,在细胞逐渐成长成一个个体的时候,往往是由于基因来支配染色体当中的遗传物质帮助一个个体慢慢形成,人体当中的基因数量数不胜数,但是这些基因也存在很大的差异性,有些基因组看起来非常大,有些基因组却非常小。根据人类基因组计划大家也可以了解,人类基因数量非常庞大,甚至用了几十年才初步完成了人类基因组计划的一部分,之所以会出现一些基因组大而另一些基因组却很小,是因为每一个基因当中并不是所有的基因组都会发生转录、翻译,形成人体所需要的蛋白质物质,很多基因组当中的基因他们属于管家基因,也就是在身体任何部位都会发生转录翻译过程,还有一些特殊的基因他们只有在特殊的部位才会发生转录和翻译,但是几乎所有的基因组当中都会蕴含这部分基因,所以才会出现一些基因组大一些基因组比较小。还有就是根据人体功能作用不同组成的基因数量也不同,人体更复杂的功能器官以及细胞组成就需要更多的基因来进行调控,对于比较简单的生理过程可能一些简单的基因组成就可以完成调控作用,所以为了更好地完成身体各项功能的正常运行,才会出现一些基因组大一些基因组小的问题。还有一种因素是因为基因组大的当中含有很多不能够进行转录翻译的部分,这些部分承担的作用是帮助基因进行转移,因为基因在人体当中并不是完全固定的,他会在不同的时间段以及不同细胞状态下进行转移,所以需要不断移动的基因组比较大,但是不需要进行移动的基因组,肯定就不需要这些基因来进行搭配,那么他的个组织就会比较小。
在哪里查基因组的大小
基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量。在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小。通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value。通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量。不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述。不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力。关于动物的基因组含量可以在Animal genome size 网站查到:http://www.genomesize.com/results.php?page=1例如人类Homo sapiens的基因组大小为3.5pg。植物: http://data.kew.org/cvalues/真菌:http://www.zbi.ee/fungal-genomesize/微生物: 基因组规模小,测序简单,大多用计数法。可参考下面的网址(不全)http://www.sci.sdsu.edu/~smaloy/MicrobialGenetics/topics/chroms-genes-prots/genomes.htmlRef 1: http://www.sciencedaily.com/releases/2003/05/030526103731.htm
基因组大小怎么确定
基因组大小(Genomesize)是指一个基因组中所拥有的DNA含量,一般以重量计算,单位通常是皮克(10-12克),写成pg,有时也用道耳吞,或是以核苷酸碱基对的数量表示,单位为百万计,写成Mb或Mbp。不测序没法知道基因组大小的。不能体外培养,可以考虑将其插入已知基因组的质粒中培养,再测序。拿到基因组测序图,后面问题就都解决了。
为什么有些基因组非常大,而另一些却很小?
基因组的意思其实只是存在于生物学里面的遗传学的,只有在这里面讨论才能有意义,我们所说的遗传基因组其实就是遗传信息或者说是遗传物质的总和。对于人体来说,我们所有的染色体的组合就是我们的基因组,所以我们的基因组在生物里面算很大得了,当然也不仅仅如此,还有的生物的基因组比人类大得多,但是在体型上却比人类要小。当然,自然界的生物种类多如繁星,但是只有像北极星那样的明亮的星才能闪耀在宇宙之中。地球也一样,基因组出众的生物就能获得他的地位,人类的基因在不是最大的,但却是最灵活的和适应性最好的,所以人类才能在这几千年里成为地球之主。有的基因组大,而有的基因组小,这里面牵涉到遗传信息多与少之间的关系,一般来讲基因组大的生物携带有的遗传信息就很多,而基因组小的生物携带的遗传信息就很少,比如细菌的基因组很小,同时这些细菌能够利用的基因组也很少,究其原因就是这些基因在只有少量的遗传信息,遗传信息表达出来的形状就很少。而人类的就复杂得多,不仅仅有我们的衣食住行,而且我们的传承以及血统的继承问题都明明白白写在我们的遗传信息之中了。但是这种基因组没有好与坏的区别,这都是适应环境的结果,只有对自己适合的基因组才能在自身的环境下生存,我们人也是一样,我们的基因组也是早就形成了,没有好坏基因。而人类的就复杂得多,不仅仅有我们的衣食住行,而且我们的传承以及血统的继承问题都明明白白写在我们的遗传信息之中了。但是这种基因组没有好与坏的区别,这都是适应环境的结果,只有对自己适合的基因组才能在自身的环境下生存,我们人也是一样,我们的基因组也是早就形成了,没有好坏基因。不管我们是什么样的人,我们都需要像对待自己一样尊重他人,在一些时候能够理解他人,这样才会有自己精彩的一生,才能在自己的环境中得到他人的祝福。
有关基因组大小的单位换算
原先一直以为测序的bp和byte是等价的,原来对fastq来说,其实:利用(公式要怎么换行啊?) 如果测序reads总量4,000,000,average read length为150bp,基因组大小是50M,估算基因组coverage/depth大小? 应该是, 总长 4,000,000x150 bp=600,000,000 bp /4=150,000,000 BT=150M 但其实fastq格式储存的数据大小要比实际的数据量虚高一些,所以实际的fastq文件要大。 coverage=测序数据大小150M/基因组大小50M = 3 熟知单位换算对预测测序结果提前估量有一定的帮助,当测序结果未达到要求时,可以合理要求测序公司对不符合的样本重新上机测序。有关问题欢迎一起来探讨啊 Base vs Byte: Estimating the storage requirement of sequencing - SEQOME
基因组大小用Gb表示 那1Gb是什么概念 有多大啊
b是bp 的简写,全称是base pair,就是碱基对 1000b=1kb 1000kb=1Mb 1000Mb=1Gb 因此是大约10的9次方,十亿这个数量级. 人类基因组的大小一共是三十亿个碱基对.
人体基因组的大小约为多大
人类基因组含有约31.6亿个DNA碱基对,碱基对是以氢键相结合的两个含氮碱基,以胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)四种碱基排列成碱基序列,其中A与T之间由两个氢键连接,G与C之间由三个氢键连接,碱基对的排列在DNA中也只能是A对T,G对C。目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能,在已知基因中酶占10.28%,核酸酶占7.5%,信号传导占12.2%,转录因子占6.0%,信号分子占1.2%,受体分子占5.3%,选择性调节分子占3.2%,等。发现并了解这些功能基因的作用对于基因功能和新药的筛选都具有重要的意义。人类基因组中存在"热点"和大片"荒漠"。 在染色体上有基因成簇密集分布的区域,也有大片的区域只有“无用DNA” ——不包含或含有极少基因的成分。基因组上大约有1/4的区域没有基因的片段。在所有的DNA中,只有1%-1.5%DNA能编码蛋白,在人类基因组中98%以上序列都是所谓的“无用DNA”,分布着300多万个长片断重复序列。这些重复的“无用”序列,决不是无用的,它一定蕴含着人类基因的新功能和奥秘,包含着人类演化和差异的信息。经典分子生物学认为一个基因只能表达一种蛋白质,而人体中存在着非常复杂繁多的蛋白质,提示一个基因可以编码多种蛋白质,蛋白质比基因具有更为重要的意义扩展资料:演化:比较基因组学(Comparative genomics)对于哺乳类基因组的研究显示,人类与大约两亿年前就已经分化的各物种相比,有大约5%的比例在人类基因组中保留了下来,其中包含许多的基因与调控序列。而且人类与大多数已知的脊椎动物间,也享有了一些相同的基因。黑猩猩的基因组与人类的基因组之间,有98.77%是相似的。而平均每一个属于人类的标准蛋白质编码基因,只与属于黑猩猩的同源基因相差两个氨基酸;并且有将近三分之一的人类基因与黑猩猩的同源基因,能够转译出相同的蛋白质。人类的2号染色体,是人类与黑猩猩基因组之间的主要差异,这一条染色体是由黑猩猩的染色体12号与13号融合而成。参考资料来源:百度百科-人类基因组
玉米基因组大小
玉米基因组大小为2.8 pg·(1C)-1。因为Nature Genetics 在线发表了由华中农业大学严建兵团队主导,华大基因等单位参与的玉米基因组研究成果发布了玉米的基因组,所以玉米基因组大小为2.8 pg·(1C)-1。该项研究首先以一个热带小粒玉米品种SK为材料,应用Pacbio测序技术、Bionano Genomics双酶切光学图谱、10X Genomics和二代测序数据,组装得到迄今为止质量最好的玉米参考基因组,大小为2.32Gb, contig N50达到15.78Mb,注释获得了43,271个基因。玉米的价值玉米中的维生素含量非常高,是稻米、小麦的5-10倍,在所有主食中,玉米的营养价值和保健作用是最高的。玉米中含有的核黄素等高营养物质,对人体是十分有益的。值得注意的是,特种玉米的营养价值要高于普通玉米,鲜玉米的水分、活性物、维生素等各种营养成分也比老玉米高很多。据本草纲目记载玉蜀黍种出西土,甘平无毒,能调中开胃。玉米的花粉、胚芽中还含有大量的维生素E和玉米黄酮,经常食用玉米制品可延缓人体衰老,增强人的体力和耐力。玉米果糖浆能防止牙龈出血,对心血管疾病的治疗具有辅助功效。
如何查询测序完成的所有物种的基因组大小
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术。基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量.在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小.通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value.通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量.不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述.不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力.
基因组大小用Gb表示 那1Gb是什么概念 有多大啊
b是bp 的简写,全称是base pair,就是碱基对 1000b=1kb1000kb=1Mb1000Mb=1Gb因此是大约10的9次方,十亿这个数量级。人类基因组的大小一共是三十亿个碱基对。 希望能够帮到你~望采纳~谢谢~
基因组- genome survey(1)
尚未进行基因组测序的物种,在进行基因组测序前,首先需对该物种进行 genome survey。 一般通过两个途径:细胞遗传学(这里只讲流式细胞术)和基因组测序 (1)基因组大小指生物个体单倍体基因组所含的 DNA 总量。基因组大小一般用重量衡量,用 pg(皮克)作为常用单位。有时候也用道耳顿(KD)、核苷酸碱基对的数量(Mb)等方式表示。pg 与常用单位 Mb 之间可以 转换,1pg 约等于 978Mb(这个数值估计随着较好参考基因组的出现,会有变化,如果粗粗估计,倒也无妨)。 (2) DNA-C 值的含义 DNA-C:某一生物体的配子体的 DNA 含量就称为 DNA-C 值(传统的叫法,表示基因组大小,二倍体生物,DNA-C和基因组大小是相等的。实际上如果是多倍体,此叫法不严谨) DNA-1C:一个物种配子核中没有复制时的 DNA-C 值(考虑倍性,只考虑配子体DNA含量) DNA-2C:成熟植物的体细胞 DNA含量称为 DNA-2C 值(这个是最重的,用来计算基因组大小) (3)基因组大小的概念 单个染色体组 DNA 含量称为该物种的基因组大小,通过DNA-2C 值除以倍性的公式计算。 例如,二倍体的一粒小麦(Triticum monococcum),体细胞DNA含量为12.45pg,则其 DNA-1C(等于DNA-C)值为12.45/2=6.23pg,即基因组大小;四倍体栽培二粒小麦(Triticum dicoccum),DNA-2C 为 24.05pg,则其 DNA-1C 值为 24.05/2=12.03pg,而基因组大小则为 24.05/4=6.01pg。 (1)流式细胞术原理 流式细胞仪的原理是通过发挥荧光染料定性定量与 DNA 双链碳架结构相结合的特性进行测量的。 具体来看,荧光信号的强弱与DNA 含量正相关,结合的 DNA 越多,则引发的荧光强度也就越强。 所以就有如下公式:
无花果基因组大小
401.8Mbp。无花果是桑科、榕属植物,落叶灌木或小乔木,基因组大小是401.8Mbp。在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和,这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。
番茄基因组大小
799.09Mb。中国农业大学园艺学院研究组利用多种新测序技术和优化的组装算法,采用PacBioHiFi和Hi-C技术对多毛番茄(LA0407品系)和加拉帕戈斯番茄(LA0317品系)进行全基因组测序,获得了精准度高、序列完整番茄基因组大小为799.09Mb。在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。
如何评估一个物种基因组的大小?
植物组织中绝大部分是核DNA,它和组蛋白、非组蛋白结合在一起,以核蛋白(即染色质或染色体)的形式存在于细胞核内。十六烷基三甲基溴化铵是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中可溶,当降低溶液盐浓度到一定程度时,从溶液中沉淀。浓度的测定,需测定在230、260和280nm处的消光值,经验数据表明,纯净的核酸溶液A260/A230的消光值比大于或等于2.0;A260/A280大于或等于1.80。A260/A280值过小,说明蛋白未脱净;A260/A230过小,说明有杂质(一般为多酚类或色素)。
基因组的大小与生物的复杂程度是否有关系
基因组的大小与生物的复杂程度是否有关系基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量.在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小.通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value.通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量.不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述.不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力.
蓝细菌基因组大小,有多少个基因
细菌基因组的变化很大,基因组大小从几百kb(千碱基对)到十几个Mb(兆碱基对),其变化幅度超过了20倍,以下是几种细菌基因组的大小:分类基因组大小范围(Kb)真细菌650-13200革兰氏阴性菌650-7800革兰氏阳性菌1600-11600兰细菌3100-13200枝原体650-1800古细菌1600-4100但在我们的实验中,一般也只能提取得到20-30Kb左右大小,可能是DNA太长容易断裂;以下的文献列举了12种真细菌和4种古细菌的16个完整基因组的大小,供参考。http://www.scienceinchina.com/zk/zc/0001/zc0099.htm
GenomeScope 2.0 评估基因组大小、杂合度和重复序列
GenomeScope 是2017年发表在 bioinformatic 的一个工具,这个工具的目的就是处理一些高复杂度的基因组,比如说高杂合度或者基因组非常大的物种。GenomeScope只能预测二倍体基因组,GenomeScope 2.0可以预测多倍体物种。 安装 在软件的安装目录下, genomescopre.R 文件是核心的运行脚本,用法如下 可选参数: - i input histogram_file (from KMC or jellyfish) ,如jellyfish软件产生的kmer频数分布数据 - o output_dir - k kmer length used to calculate kmer spectra [default 21] ; 必选参数: - p PLOIDY, --ploidy PLOIDY ploidy (1, 2, 3, 4, 5, or 6) for model to use [default 2] ; - m MAX_KMERCOV, --max_kmercov MAX_KMERCOV optional maximum kmer coverage threshold (kmers with coverage greater than max_kmercov are ignored by the model) ; - n NAME_PREFIX, --name_prefix NAME_PREFIX optional name_prefix for output files ; - l LAMBDA, --lambda LAMBDA, --kcov LAMBDA, --kmercov LAMBDA optional initial kmercov estimate for model to use ; 示例: 在运行过程中,终端会输出如下信息 het 表示杂合度,为1.65%; len 表示基因组大小,为376M左右。 输出目录output_p3文件列表如下 通常关注summary.txt, transformed_linear_plot.png这2个文件。 内容如下: 在该文件中,会给出杂合度,基因组大小,重复片段长度等详细信息。 结果分为三列: 有疑问,可以对照模型进行检验。 K-mer覆盖度-频数分布图如下: kcov指的是杂合峰的覆盖度。可以看到使用数据预测K-mer最低深度峰在18.4X处。 一般情况下杂合度大于1%就会存在一个高于主峰的杂合峰。 基因组越大,杂合度也大,重复片段越大,该物种的组装难度就越大。 讨论: 基因组预测大小和参数 Max kmer coverage 密切相关。GenomeScope默认会过滤掉出现10,000次以上的kmers,避免细胞器基因组的影响,如果你觉得基因组小了,那么就把数值调整的大一点。 基因组survey介绍了如何通过jellyfish统计k-mer然后绘制k-mer分布图研究基因组的方法。 对于不同的基因组杂合度,kmer分布如下 https://github.com/tbenavi1/genomescope2.0
典型的叶绿体基因组有多大
叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在120kb到217kb之间,平均165Kb。一般1.0~1.3Kb/个基因,大概150个左右的基因,其中大约50个左右的蛋白基因,其他主要是tRNA基因和rRNA基因。
百合,瓜蚜(棉蚜)的基因组大小
C value paradox是指基因组大小和生物的复杂性之间的关系。从低等生物,如微生物,到高等生物,如人类,随着基因组复杂性的增加,基因组的大小也呈现增加的趋势。但是后来发现在生物复杂性相似的物种中,基因组大小可以相差非常大。例如,植物中拟南芥只有100多个Mb,而和同为高等植物的百合基因组大小可以相差100倍。造成矛盾的原因现在基本认为是倍性和重复序列的多少造成的。如果满意请采纳。谢谢支持!
基因组大小与生物体的复杂性直接相关吗
全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;平均的基因大小有27kbp目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能基因数量少得惊人:一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但Celera公司将人类基因总数定在2.6383万到3.9114万个之间,不超过40,000,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,而能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义,也说明人类的基因较其他生物体更"有效",人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。
人类基因组中的编码基因占核基因组多少
人的基因组大小约为3000Mb.即30亿个碱基对.这里的Mb表示一兆碱基对.但是由于基因有长有短,有些基因又尚未被发现,所以,尚不知道人的基因具体有多少个,只知道大概有10万个基因(等位基因算作一个,因为一点微小的变化就造成一个等位基因,如果分别算就太多了.所以应该说是10万个基因座比较准确).
鸡的基因组大小约有多少个碱基
Gallusgallus(原鸡)33条染色体1,074.96X10的六次方个碱基17,529个基因16,868个蛋白
线粒体基因组的大小
已知的是哺乳动物的线粒体基因组最小,果蝇和蛙的稍大,酵母的更大,而植物的线粒体基因组最大。人、小鼠和牛的线粒体基因组全序列已经测定,都是16.5 kb左右。每个细胞里有成千上万份线粒体基因组DNA拷贝。果蝇和蛙的细胞里有多少个线粒体以及每个线粒体有多少份DNA拷贝,还没有准确的数字。估计线粒体DNA的总量只相当于核DNA的1%弱。酿酒酵母(S.cerevisiae)的线粒体基因组约长84 kb,每个细胞里有22个线粒体,每个线粒体有4个基因组。生长中的酵母细胞线粒体DNA占细胞总DNA量的比例可高达18%。