LIGO

第一步：新建序列（或者通过Open直接打开序列）第二步：确定你要设计引物的起始位点,双击下面的序列可以选中一段（暂时先不要管引物长度）第三步：选择作为上游引物Select->Forward Primer,然后你会发现下面的序列上有相关引物第四步：编辑引物,Edit->Forward Primer,可以在文本框中对引物进行添加或删除（在此步骤中加入酶切位点或/和保护碱基）,最下面是发夹结构情况,没有发夹结构最好,参与配对形成发夹结构的碱基对越少越好（此窗口还有Tm等信息）第五步：分析引物Analyze->Duplex Formation->Forward Primer是上游引物形成二聚体情况,不形成最好,参与配对形成二聚体的碱基对越少越好；Analyze->****->Forward Primer（Analyze菜单中有很多可以对引物进行评估的功能,根据菜单名字便可知道）第六步：设计下游引物（同上游引物设计）第七步：将设计好的引物进行检查是否移码等等,然后从中Ctrl+C复制出来,

第一步：新建序列（或者通过Open直接打开序列）第二步：确定你要设计引物的起始位点,双击下面的序列可以选中一段（暂时先不要管引物长度）第三步：选择作为上游引物Select->Forward Primer,然后你会发现下面的序列上有相关引物第四步：编辑引物,Edit->Forward Primer,可以在文本框中对引物进行添加或删除（在此步骤中加入酶切位点或/和保护碱基）,最下面是发夹结构情况,没有发夹结构最好,参与配对形成发夹结构的碱基对越少越好（此窗口还有Tm等信息）第五步：分析引物Analyze->Duplex Formation->Forward Primer是上游引物形成二聚体情况,不形成最好,参与配对形成二聚体的碱基对越少越好；Analyze->****->Forward Primer（Analyze菜单中有很多可以对引物进行评估的功能,根据菜单名字便可知道）第六步：设计下游引物（同上游引物设计）第七步：将设计好的引物进行检查是否移码等等,然后从中Ctrl+C复制出来,

　　寡核苷酸是具有特殊设计序列的核酸聚合物，包括反义寡核苷酸（ASOs）、小干扰RNA （siRNA）、microRNA和适配体。寡核苷酸可通过一系列过程调控基因表达，包括RNAi、RNase h介导的裂解降解靶标、剪接调控、非编码RNA抑制、基因激活和程序化基因编辑。 　　小干扰RNA 　　反义寡核苷酸 　　核酸适配体 　　大多数寡核苷酸（ASOs、siRNA和microRNA）通过互补碱基配对与靶基因mRNA或pre-mRNA杂交，理论上可以选择性调控任何靶基因和蛋白的表达，包括许多“不可抑制”的靶点。适配体与靶蛋白的亲和力类似于抗体，是通过三级结构而不是序列来实现的。寡核苷酸还有其他的优势，包括相对简单的生产和制备技术，较短的开发周期和持久的影响。 　　与传统的小分子抑制剂相比，利用 寡核苷酸 作为药物是一种根本上的新方法。寡核苷酸在精确遗传学方面的潜力已经提高了应用于癌症、心血管疾病和罕见疾病治疗的热情。最近FDA批准了Givosiran, Lumasiran和Viltolarsen，将RNAi或rna为基础的治疗浪潮引入了药物开发的主流。

这两个概念不一样。Oligo或者说是寡聚核苷酸不带有重复的意思。oligo的定义基于20个碱基以下，是说这个核苷酸分子就这么长，而对这个核苷酸的序列没有任何限定。而SSR，即简单重复序列，是说这个序列含有重复相邻排列的核苷酸，这个序列可以存在于一个更长的核苷酸长链之中,SSR不是描述一个单独的分子。如果举个例子，就好比“小布条”与“千鸟纹”都是布料方面的概念，但是它们描述的是完全不同的性质。一个小布条上的花纹可以是千鸟纹，而千鸟纹的布料也可以裁成小步条。呃，这样说不知道明白吗?原位杂交一般需要用到特定序列的oilgos作为探针，而SSR-FISH应是指这个探针识别的是具有SSR特征的序列。